More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0681 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0681  Chloride channel core  100 
 
 		 538 aa  1051    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2188  Chloride channel core  51.04 
 
 		 563 aa  509  1e-143  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000751746  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2944  Cl- channel, voltage-gated family protein  38.62 
 
 		 526 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0120087  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1662  voltage-gated chloride channel family protein  37.36 
 
 		 523 aa  300  4e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1400  chloride channel protein  37.71 
 
 		 523 aa  299  7e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.340394  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  37.71 
 
 		 519 aa  298  2e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  38.05 
 
 		 519 aa  297  4e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1830  chloride channel protein EriC  34.98 
 
 		 512 aa  289  8e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.116382  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0762  chloride channel core  38.25 
 
 		 518 aa  288  2e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000775923  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1891  chloride channel protein EriC  33.46 
 
 		 534 aa  281  2e-74  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.85971e-16 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A25  chloride channel protein EriC  34.38 
 
 		 510 aa  276  9e-73  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2179  voltage-gated chloride channel  32.62 
 
 		 528 aa  265  1e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1107  voltage-gated chloride channel family protein  31.96 
 
 		 510 aa  240  5e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0757  Chloride channel core  29.36 
 
 		 528 aa  239  8e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.937422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0391  chloride channel, core  31.41 
 
 		 516 aa  228  2e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000201773  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1346  chloride channel protein  30.43 
 
 		 527 aa  226  9e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1588  Cl- channel, voltage gated  32.26 
 
 		 539 aa  223  7e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000108225  normal  0.782392 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3525  Chloride channel core  32.6 
 
 		 533 aa  221  3e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1147  chloride channel protein EriC  31.77 
 
 		 487 aa  205  1e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.433892  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2366  Cl- channel voltage-gated family protein  31.65 
 
 		 416 aa  191  2.9999999999999997e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0845  chloride channel protein EriC  30.47 
 
 		 512 aa  190  5e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0118  chloride transporter, ClC family  33.64 
 
 		 455 aa  190  5.999999999999999e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0386  chloride channel protein EriC  33.52 
 
 		 457 aa  181  2e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000543407 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  28.06 
 
 		 473 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  28.06 
 
 		 473 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  28.06 
 
 		 473 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0459  chloride channel protein  29.71 
 
 		 468 aa  171  3e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.511438  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  28.06 
 
 		 473 aa  171  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  27.84 
 
 		 473 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0552  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.53 
 
 		 437 aa  168  2.9999999999999998e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0449  Chloride channel core  34.54 
 
 		 428 aa  166  6.9999999999999995e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0487186  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0782  chloride channel protein  28.53 
 
 		 479 aa  164  5.0000000000000005e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.12239 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  32.48 
 
 		 859 aa  162  1e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0695  chloride channel protein  27.44 
 
 		 466 aa  161  3e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.750689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2409  Chloride channel core  31.78 
 
 		 435 aa  160  4e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3102  chloride channel protein  29.52 
 
 		 471 aa  160  5e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0212  chloride channel protein  31.89 
 
 		 456 aa  160  7e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06233  chloride channel protein  27.15 
 
 		 468 aa  157  4e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000478  H(+)/Cl(-) exchange transporter ClcA  26.7 
 
 		 467 aa  154  5e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.791443  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3026  chloride channel protein  31.37 
 
 		 436 aa  152  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.139269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0866  chloride channel protein  29.14 
 
 		 470 aa  150  4e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0280286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0189  chloride channel, core  29.93 
 
 		 445 aa  150  8e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1698  chloride channel protein  31.07 
 
 		 427 aa  147  4.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  31.53 
 
 		 863 aa  147  7.0000000000000006e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1697  chloride channel protein  31.29 
 
 		 427 aa  145  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  30.97 
 
 		 862 aa  145  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4427  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.77 
 
 		 439 aa  144  6e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.292219 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4200  Cl- channel, voltage gated  28.77 
 
 		 439 aa  144  6e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.419413  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4266  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.77 
 
 		 439 aa  144  6e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal  0.948351 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3329  chloride channel protein  25.56 
 
 		 478 aa  143  9e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3458  chloride channel protein  25.56 
 
 		 478 aa  143  9e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.41349  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0993  chloride channel protein  25.56 
 
 		 478 aa  143  9e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  30.23 
 
 		 875 aa  141  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1576  chloride channel protein  26.87 
 
 		 463 aa  140  6e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.803836 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  27.78 
 
 		 614 aa  139  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  29.05 
 
 		 613 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2176  chloride channel protein  31.1 
 
 		 466 aa  136  8e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.462447  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4719  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.7 
 
 		 439 aa  133  6.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5126  Chloride channel core  28.14 
 
 		 455 aa  131  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.967493 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  26.91 
 
 		 863 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0147  chloride channel protein  25.91 
 
 		 473 aa  130  6e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00154  chloride channel protein  26.14 
 
 		 473 aa  130  7.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0502549  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3447  Chloride channel core  26.14 
 
 		 473 aa  130  7.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0159  chloride channel protein  26.14 
 
 		 473 aa  130  7.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00153  hypothetical protein  26.14 
 
 		 473 aa  130  7.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0410723  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3504  chloride channel protein  26.14 
 
 		 473 aa  130  7.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0160  chloride channel protein  26.14 
 
 		 473 aa  130  7.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0318  Chloride channel core  28.37 
 
 		 511 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000450379  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0165  chloride channel protein  25.91 
 
 		 473 aa  130  9.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0167  chloride channel protein  25.91 
 
 		 473 aa  130  9.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  25.89 
 
 		 569 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4138  Chloride channel core  24.37 
 
 		 455 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2810  chloride channel protein  26.09 
 
 		 472 aa  128  3e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2285  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.12 
 
 		 426 aa  128  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397915  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  24.79 
 
 		 587 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2009  Cl- channel, voltage-gated family protein  25 
 
 		 443 aa  127  5e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3116  chloride channel protein  28.73 
 
 		 453 aa  127  6e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.958796 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3829  chloride channel core  25.87 
 
 		 455 aa  125  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.44 
 
 		 598 aa  125  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  26.16 
 
 		 606 aa  124  6e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0546  Cl- channel, voltage gated  27.67 
 
 		 559 aa  123  8e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  24.94 
 
 		 580 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  28.61 
 
 		 897 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1638  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.23 
 
 		 436 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0832  chloride channel  25.27 
 
 		 585 aa  122  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3300  Cl- channel, voltage gated  23.82 
 
 		 585 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0616826  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  27.47 
 
 		 608 aa  120  6e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3436  Chloride channel core  27.79 
 
 		 879 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2680  Chloride channel core  27.79 
 
 		 879 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.07 
 
 		 582 aa  119  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  23.11 
 
 		 589 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.22 
 
 		 628 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2509  chloride channel protein  28.38 
 
 		 455 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3051  chloride channel core  28.86 
 
 		 449 aa  117  6.9999999999999995e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156315  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6342  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.78 
 
 		 589 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867968  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1737  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.78 
 
 		 589 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2543  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  23.89 
 
 		 591 aa  116  7.999999999999999e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.232119  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.78 
 
 		 589 aa  117  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.94 
 
 		 579 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  23.49 
 
 		 470 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>