More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0845 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_0845  chloride channel protein EriC  100 
 
 
512 aa  1005    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1107  voltage-gated chloride channel family protein  56.41 
 
 
510 aa  537  1e-151  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1147  chloride channel protein EriC  56.26 
 
 
487 aa  473  1e-132  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.433892  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A25  chloride channel protein EriC  43.79 
 
 
510 aa  370  1e-101  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0391  chloride channel, core  42.8 
 
 
516 aa  350  4e-95  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000201773  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1891  chloride channel protein EriC  37.28 
 
 
534 aa  317  3e-85  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  8.85971e-16 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1400  chloride channel protein  38.04 
 
 
523 aa  299  6e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.340394  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1662  voltage-gated chloride channel family protein  38.24 
 
 
523 aa  298  1e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1830  chloride channel protein EriC  36.84 
 
 
512 aa  292  1e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.116382  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2944  Cl- channel, voltage-gated family protein  39.64 
 
 
526 aa  291  2e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0120087  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0386  chloride channel protein EriC  40.49 
 
 
457 aa  283  5.000000000000001e-75  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000543407 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  33.99 
 
 
519 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  34.21 
 
 
519 aa  273  5.000000000000001e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0189  chloride channel, core  35.49 
 
 
445 aa  263  6e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0762  chloride channel core  36.96 
 
 
518 aa  249  7e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000775923  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2188  Chloride channel core  33.94 
 
 
563 aa  249  1e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000751746  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0757  Chloride channel core  34.3 
 
 
528 aa  237  3e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.937422  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3525  Chloride channel core  37.9 
 
 
533 aa  230  5e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1346  chloride channel protein  35.26 
 
 
527 aa  226  8e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2179  voltage-gated chloride channel  30.99 
 
 
528 aa  223  8e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0681  Chloride channel core  31.59 
 
 
538 aa  214  2.9999999999999995e-54  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0449  Chloride channel core  35.07 
 
 
428 aa  191  2e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0487186  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3102  chloride channel protein  33.42 
 
 
471 aa  191  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  32.09 
 
 
473 aa  191  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  32.22 
 
 
473 aa  189  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  32.22 
 
 
473 aa  189  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  32.22 
 
 
473 aa  189  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  32.22 
 
 
473 aa  189  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0118  chloride transporter, ClC family  35.16 
 
 
455 aa  188  2e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1588  Cl- channel, voltage gated  33.86 
 
 
539 aa  187  4e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000108225  normal  0.782392 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1576  chloride channel protein  33.61 
 
 
463 aa  187  5e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.803836 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2409  Chloride channel core  33.41 
 
 
435 aa  181  4e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0212  chloride channel protein  32.82 
 
 
456 aa  180  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0782  chloride channel protein  31 
 
 
479 aa  180  7e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.12239 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0695  chloride channel protein  30.39 
 
 
466 aa  179  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.750689  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3329  chloride channel protein  31.19 
 
 
478 aa  177  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0993  chloride channel protein  31.03 
 
 
478 aa  176  7e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3458  chloride channel protein  31.03 
 
 
478 aa  176  7e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.41349  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1698  chloride channel protein  32.86 
 
 
427 aa  172  2e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1697  chloride channel protein  32.39 
 
 
427 aa  171  3e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  31.98 
 
 
859 aa  169  1e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0459  chloride channel protein  32.52 
 
 
468 aa  168  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.511438  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0552  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.84 
 
 
437 aa  161  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000478  H(+)/Cl(-) exchange transporter ClcA  31.11 
 
 
467 aa  158  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.791443  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0866  chloride channel protein  31.16 
 
 
470 aa  155  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0280286  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2460  chloride channel core  35.47 
 
 
459 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11718  normal  0.460638 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2176  chloride channel protein  35.31 
 
 
466 aa  152  1e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.462447  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3829  chloride channel core  31.82 
 
 
455 aa  151  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4138  Chloride channel core  31.43 
 
 
455 aa  150  5e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5126  Chloride channel core  30.79 
 
 
455 aa  149  9e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.967493 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  32.02 
 
 
862 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2810  chloride channel protein  32.44 
 
 
472 aa  145  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0159  chloride channel protein  30.89 
 
 
473 aa  144  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0167  chloride channel protein  30.89 
 
 
473 aa  144  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0165  chloride channel protein  30.89 
 
 
473 aa  144  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00154  chloride channel protein  30.66 
 
 
473 aa  144  4e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0502549  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3447  Chloride channel core  30.66 
 
 
473 aa  144  4e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3504  chloride channel protein  30.66 
 
 
473 aa  144  4e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17992  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00153  hypothetical protein  30.66 
 
 
473 aa  144  4e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0410723  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0147  chloride channel protein  30.66 
 
 
473 aa  144  4e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0160  chloride channel protein  30.66 
 
 
473 aa  144  4e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06233  chloride channel protein  32.46 
 
 
468 aa  144  5e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0318  Chloride channel core  30.81 
 
 
511 aa  141  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000450379  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3026  chloride channel protein  34.04 
 
 
436 aa  140  6e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.139269  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2366  Cl- channel voltage-gated family protein  26.56 
 
 
416 aa  139  1e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  27.93 
 
 
569 aa  139  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4427  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.87 
 
 
439 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.292219 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4200  Cl- channel, voltage gated  27.87 
 
 
439 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.419413  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4266  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.87 
 
 
439 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal  0.948351 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4719  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.71 
 
 
439 aa  134  5e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  30.96 
 
 
875 aa  131  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  31.41 
 
 
863 aa  130  8.000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2509  chloride channel protein  35.26 
 
 
455 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2009  Cl- channel, voltage-gated family protein  32.52 
 
 
443 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1638  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.63 
 
 
436 aa  126  9e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0546  Cl- channel, voltage gated  28.11 
 
 
559 aa  126  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2680  Chloride channel core  34.39 
 
 
879 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3436  Chloride channel core  34.39 
 
 
879 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  27.82 
 
 
470 aa  117  6.9999999999999995e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3116  chloride channel protein  29.38 
 
 
453 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.958796 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3504  chloride channel family protein  27.68 
 
 
602 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4624  voltage-gated chloride channel  33.01 
 
 
574 aa  113  6e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  34.53 
 
 
897 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  31.37 
 
 
863 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0832  chloride channel  28.61 
 
 
585 aa  112  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.48 
 
 
580 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  30.27 
 
 
613 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0367  Chloride channel core  30.75 
 
 
595 aa  110  5e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.26 
 
 
577 aa  110  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.63 
 
 
579 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.89 
 
 
591 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.63 
 
 
579 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.63 
 
 
579 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.63 
 
 
636 aa  108  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  27.23 
 
 
615 aa  108  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.88 
 
 
598 aa  107  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4701  Chloride channel core  29.02 
 
 
471 aa  106  8e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.10029 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  30.48 
 
 
614 aa  106  9e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  26.72 
 
 
584 aa  105  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  27.94 
 
 
606 aa  105  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>