More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_3329 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_0695  chloride channel protein  73.1 
 
 		 466 aa  669    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.750689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3458  chloride channel protein  99.58 
 
 		 478 aa  941    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.41349  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0782  chloride channel protein  76.32 
 
 		 479 aa  697    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.12239 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  77.51 
 
 		 473 aa  706    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0993  chloride channel protein  99.58 
 
 		 478 aa  941    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  77.28 
 
 		 473 aa  704    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  77.51 
 
 		 473 aa  706    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  77.28 
 
 		 473 aa  706    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3329  chloride channel protein  100 
 
 		 478 aa  944    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  77.51 
 
 		 473 aa  706    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3102  chloride channel protein  67.61 
 
 		 471 aa  607  9.999999999999999e-173  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00154  chloride channel protein  72.71 
 
 		 473 aa  590  1e-167  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0502549  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3447  Chloride channel core  72.71 
 
 		 473 aa  590  1e-167  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3504  chloride channel protein  72.71 
 
 		 473 aa  590  1e-167  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0159  chloride channel protein  72.48 
 
 		 473 aa  590  1e-167  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0160  chloride channel protein  72.71 
 
 		 473 aa  590  1e-167  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0167  chloride channel protein  72.48 
 
 		 473 aa  590  1e-167  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0165  chloride channel protein  72.48 
 
 		 473 aa  590  1e-167  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0147  chloride channel protein  72.48 
 
 		 473 aa  588  1e-167  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00153  hypothetical protein  72.71 
 
 		 473 aa  590  1e-167  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0410723  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2810  chloride channel protein  66.88 
 
 		 472 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0459  chloride channel protein  56.92 
 
 		 468 aa  473  1e-132  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.511438  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000478  H(+)/Cl(-) exchange transporter ClcA  58.31 
 
 		 467 aa  445  1.0000000000000001e-124  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.791443  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0866  chloride channel protein  52.86 
 
 		 470 aa  425  1e-118  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0280286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06233  chloride channel protein  56.67 
 
 		 468 aa  420  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2176  chloride channel protein  45.8 
 
 		 466 aa  349  6e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.462447  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1576  chloride channel protein  42.69 
 
 		 463 aa  314  1.9999999999999998e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.803836 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0212  chloride channel protein  38.26 
 
 		 456 aa  314  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1697  chloride channel protein  41.36 
 
 		 427 aa  283  5.000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1698  chloride channel protein  41.82 
 
 		 427 aa  282  1e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4138  Chloride channel core  42.25 
 
 		 455 aa  268  2e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3829  chloride channel core  42.39 
 
 		 455 aa  263  4e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5126  Chloride channel core  41 
 
 		 455 aa  259  7e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.967493 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3525  Chloride channel core  37.4 
 
 		 533 aa  237  4e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2460  chloride channel core  39.07 
 
 		 459 aa  218  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11718  normal  0.460638 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  33.86 
 
 		 519 aa  210  4e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  34.25 
 
 		 519 aa  208  2e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3026  chloride channel protein  38.57 
 
 		 436 aa  199  6e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.139269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2944  Cl- channel, voltage-gated family protein  32.6 
 
 		 526 aa  187  3e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0120087  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2409  Chloride channel core  37.4 
 
 		 435 aa  187  3e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A25  chloride channel protein EriC  29.3 
 
 		 510 aa  187  5e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1588  Cl- channel, voltage gated  37.64 
 
 		 539 aa  183  7e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000108225  normal  0.782392 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1662  voltage-gated chloride channel family protein  35.47 
 
 		 523 aa  181  4e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1400  chloride channel protein  35.47 
 
 		 523 aa  179  8e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.340394  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0757  Chloride channel core  31.81 
 
 		 528 aa  178  2e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.937422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  33.96 
 
 		 615 aa  178  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0552  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.61 
 
 		 437 aa  174  2.9999999999999996e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2509  chloride channel protein  37.98 
 
 		 455 aa  173  5e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  35.32 
 
 		 859 aa  172  1e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1639  Cl- channel voltage-gated family protein  36.07 
 
 		 597 aa  172  2e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1830  chloride channel protein EriC  34.05 
 
 		 512 aa  171  3e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.116382  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2188  Chloride channel core  28.54 
 
 		 563 aa  170  5e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000751746  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1107  voltage-gated chloride channel family protein  30.91 
 
 		 510 aa  169  9e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0386  chloride channel protein EriC  29.27 
 
 		 457 aa  167  4e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000543407 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  33.98 
 
 		 863 aa  166  1.0000000000000001e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  31.49 
 
 		 569 aa  163  5.0000000000000005e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0845  chloride channel protein EriC  32.22 
 
 		 512 aa  160  5e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1147  chloride channel protein EriC  32.34 
 
 		 487 aa  157  3e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.433892  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1891  chloride channel protein EriC  30.91 
 
 		 534 aa  157  4e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.85971e-16 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0391  chloride channel, core  31.4 
 
 		 516 aa  156  6e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000201773  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4427  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.93 
 
 		 439 aa  156  7e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.292219 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4200  Cl- channel, voltage gated  30.93 
 
 		 439 aa  156  7e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.419413  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4266  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.93 
 
 		 439 aa  156  7e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal  0.948351 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  29.08 
 
 		 614 aa  155  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2179  voltage-gated chloride channel  30.17 
 
 		 528 aa  154  2e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4719  Cl- channel, voltage-gated family protein  32.72 
 
 		 439 aa  155  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6434  Chloride channel core  33.8 
 
 		 600 aa  152  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  34.8 
 
 		 587 aa  152  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.17 
 
 		 598 aa  151  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  28.51 
 
 		 613 aa  150  4e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0762  chloride channel core  30.49 
 
 		 518 aa  150  6e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000775923  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  32.4 
 
 		 626 aa  149  8e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  34.93 
 
 		 862 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2009  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.39 
 
 		 443 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  30.46 
 
 		 606 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0118  chloride transporter, ClC family  32.33 
 
 		 455 aa  145  1e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1346  chloride channel protein  30.98 
 
 		 527 aa  144  4e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0681  Chloride channel core  26.53 
 
 		 538 aa  143  5e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  28.96 
 
 		 608 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  28.44 
 
 		 584 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.4 
 
 		 593 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.4 
 
 		 593 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.95 
 
 		 589 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  31.76 
 
 		 875 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6342  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.95 
 
 		 589 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867968  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  31 
 
 		 669 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1737  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.95 
 
 		 589 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  31.42 
 
 		 470 aa  140  4.999999999999999e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.27 
 
 		 577 aa  139  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.03 
 
 		 589 aa  139  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2543  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.97 
 
 		 591 aa  138  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.232119  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0449  Chloride channel core  27.87 
 
 		 428 aa  137  5e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0487186  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0189  chloride channel, core  27.65 
 
 		 445 aa  135  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.6 
 
 		 591 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1400  chloride channel, putative  28.51 
 
 		 631 aa  134  5e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18351  putative chloride channel  30.16 
 
 		 452 aa  133  6e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.78 
 
 		 636 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.91 
 
 		 579 aa  131  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.91 
 
 		 579 aa  131  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  32.39 
 
 		 863 aa  131  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.298005 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>