More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0391 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0391  chloride channel, core  100 
 
 		 516 aa  1039    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000201773  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A25  chloride channel protein EriC  45.87 
 
 		 510 aa  437  1e-121  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1891  chloride channel protein EriC  43.58 
 
 		 534 aa  413  1e-114  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.85971e-16 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1107  voltage-gated chloride channel family protein  41.17 
 
 		 510 aa  369  1e-100  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0845  chloride channel protein EriC  42.8 
 
 		 512 aa  346  5e-94  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1147  chloride channel protein EriC  42.98 
 
 		 487 aa  345  1e-93  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.433892  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2944  Cl- channel, voltage-gated family protein  37.94 
 
 		 526 aa  334  3e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0120087  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  36.83 
 
 		 519 aa  318  2e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1662  voltage-gated chloride channel family protein  36.72 
 
 		 523 aa  315  9.999999999999999e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1400  chloride channel protein  36.72 
 
 		 523 aa  315  9.999999999999999e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.340394  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  35.01 
 
 		 519 aa  315  9.999999999999999e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0189  chloride channel, core  41.65 
 
 		 445 aa  306  5.0000000000000004e-82  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0762  chloride channel core  36.51 
 
 		 518 aa  296  7e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000775923  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0386  chloride channel protein EriC  40.66 
 
 		 457 aa  295  1e-78  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000543407 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1830  chloride channel protein EriC  37.25 
 
 		 512 aa  291  3e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.116382  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2179  voltage-gated chloride channel  32.18 
 
 		 528 aa  288  2e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2188  Chloride channel core  33.74 
 
 		 563 aa  276  4e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000751746  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0757  Chloride channel core  31.64 
 
 		 528 aa  240  2.9999999999999997e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.937422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0681  Chloride channel core  31.33 
 
 		 538 aa  239  1e-61  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1346  chloride channel protein  34.48 
 
 		 527 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3525  Chloride channel core  32.78 
 
 		 533 aa  219  6e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0118  chloride transporter, ClC family  33.25 
 
 		 455 aa  202  9.999999999999999e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1588  Cl- channel, voltage gated  34.38 
 
 		 539 aa  193  7e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000108225  normal  0.782392 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0695  chloride channel protein  33.1 
 
 		 466 aa  192  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.750689  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3102  chloride channel protein  29.87 
 
 		 471 aa  186  9e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0782  chloride channel protein  29.77 
 
 		 479 aa  183  7e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.12239 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  31.72 
 
 		 473 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  31.72 
 
 		 473 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  31.72 
 
 		 473 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  31.72 
 
 		 473 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  31.72 
 
 		 473 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0449  Chloride channel core  30.68 
 
 		 428 aa  173  7.999999999999999e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0487186  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3458  chloride channel protein  30.7 
 
 		 478 aa  172  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.41349  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0993  chloride channel protein  30.7 
 
 		 478 aa  172  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3329  chloride channel protein  30.7 
 
 		 478 aa  172  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1576  chloride channel protein  28.05 
 
 		 463 aa  165  2.0000000000000002e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.803836 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1698  chloride channel protein  30.26 
 
 		 427 aa  164  3e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000478  H(+)/Cl(-) exchange transporter ClcA  32.74 
 
 		 467 aa  162  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.791443  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1697  chloride channel protein  30.02 
 
 		 427 aa  161  2e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0552  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.97 
 
 		 437 aa  158  2e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2409  Chloride channel core  30.48 
 
 		 435 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0212  chloride channel protein  31.15 
 
 		 456 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4138  Chloride channel core  29.59 
 
 		 455 aa  152  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3829  chloride channel core  30.41 
 
 		 455 aa  150  5e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2460  chloride channel core  32.95 
 
 		 459 aa  150  8e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11718  normal  0.460638 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0866  chloride channel protein  31.7 
 
 		 470 aa  149  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0280286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0459  chloride channel protein  31.34 
 
 		 468 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.511438  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06233  chloride channel protein  32.59 
 
 		 468 aa  147  4.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0167  chloride channel protein  32.41 
 
 		 473 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0165  chloride channel protein  32.41 
 
 		 473 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00154  chloride channel protein  32.41 
 
 		 473 aa  147  5e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0502549  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3447  Chloride channel core  32.41 
 
 		 473 aa  147  5e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0147  chloride channel protein  32.41 
 
 		 473 aa  147  5e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0160  chloride channel protein  32.41 
 
 		 473 aa  147  5e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0159  chloride channel protein  32.41 
 
 		 473 aa  147  5e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3504  chloride channel protein  32.41 
 
 		 473 aa  147  5e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00153  hypothetical protein  32.41 
 
 		 473 aa  147  5e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0410723  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2366  Cl- channel voltage-gated family protein  26.19 
 
 		 416 aa  146  1e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5126  Chloride channel core  30.38 
 
 		 455 aa  144  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.967493 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2810  chloride channel protein  30.7 
 
 		 472 aa  143  8e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0318  Chloride channel core  30.47 
 
 		 511 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000450379  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2176  chloride channel protein  33.96 
 
 		 466 aa  140  3.9999999999999997e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.462447  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2009  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.02 
 
 		 443 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  33.33 
 
 		 859 aa  140  3.9999999999999997e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  29.22 
 
 		 569 aa  139  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4719  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.67 
 
 		 439 aa  137  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4427  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.57 
 
 		 439 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.292219 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4266  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.57 
 
 		 439 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal  0.948351 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4200  Cl- channel, voltage gated  29.57 
 
 		 439 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.419413  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3026  chloride channel protein  32.86 
 
 		 436 aa  127  7e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.139269  normal  1 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  29.64 
 
 		 863 aa  126  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.65 
 
 		 636 aa  123  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.65 
 
 		 579 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.65 
 
 		 579 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.65 
 
 		 579 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1638  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.71 
 
 		 436 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2680  Chloride channel core  29.32 
 
 		 879 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3436  Chloride channel core  29.32 
 
 		 879 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  27.4 
 
 		 614 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.93 
 
 		 589 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.75 
 
 		 628 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  27.73 
 
 		 608 aa  111  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2509  chloride channel protein  31.8 
 
 		 455 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.74 
 
 		 598 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  26.02 
 
 		 470 aa  110  5e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30 
 
 		 589 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6342  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30 
 
 		 589 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867968  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3116  chloride channel protein  26.03 
 
 		 453 aa  109  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.958796 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1737  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30 
 
 		 589 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.31 
 
 		 593 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0832  chloride channel  28.61 
 
 		 585 aa  108  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0845  Chloride channel core  30.39 
 
 		 640 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0525209 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.31 
 
 		 593 aa  108  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3051  chloride channel core  27.45 
 
 		 449 aa  106  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156315  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0546  Cl- channel, voltage gated  26.94 
 
 		 559 aa  106  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4624  voltage-gated chloride channel  28.92 
 
 		 574 aa  105  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  27.42 
 
 		 606 aa  105  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18921  putative chloride channel  28.01 
 
 		 452 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1794  putative chloride channel  27.73 
 
 		 452 aa  104  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18921  putative chloride channel  28.07 
 
 		 452 aa  104  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.708029  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>