More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1107 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1107  voltage-gated chloride channel family protein  100 
 
 
510 aa  1006    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1147  chloride channel protein EriC  59.5 
 
 
487 aa  550  1e-155  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.433892  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0845  chloride channel protein EriC  56.41 
 
 
512 aa  516  1.0000000000000001e-145  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A25  chloride channel protein EriC  44.11 
 
 
510 aa  403  1e-111  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0391  chloride channel, core  42.02 
 
 
516 aa  355  7.999999999999999e-97  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000201773  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1891  chloride channel protein EriC  38.42 
 
 
534 aa  345  1e-93  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  8.85971e-16 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2944  Cl- channel, voltage-gated family protein  37.45 
 
 
526 aa  298  1e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0120087  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1400  chloride channel protein  36.19 
 
 
523 aa  298  1e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.340394  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1662  voltage-gated chloride channel family protein  35.8 
 
 
523 aa  297  3e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  35.12 
 
 
519 aa  297  3e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  34.69 
 
 
519 aa  292  1e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1830  chloride channel protein EriC  36.19 
 
 
512 aa  286  5.999999999999999e-76  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.116382  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0386  chloride channel protein EriC  39.42 
 
 
457 aa  275  2.0000000000000002e-72  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000543407 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0762  chloride channel core  35.57 
 
 
518 aa  266  8.999999999999999e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000775923  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2188  Chloride channel core  33.06 
 
 
563 aa  260  4e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000751746  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0189  chloride channel, core  32.44 
 
 
445 aa  249  1e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0681  Chloride channel core  31.24 
 
 
538 aa  243  3.9999999999999997e-63  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0757  Chloride channel core  32.89 
 
 
528 aa  235  1.0000000000000001e-60  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.937422  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1346  chloride channel protein  34.34 
 
 
527 aa  223  6e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1588  Cl- channel, voltage gated  34.09 
 
 
539 aa  215  1.9999999999999998e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000108225  normal  0.782392 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3525  Chloride channel core  35.16 
 
 
533 aa  214  3.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2179  voltage-gated chloride channel  28.05 
 
 
528 aa  208  2e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0118  chloride transporter, ClC family  35.53 
 
 
455 aa  200  6e-50  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0449  Chloride channel core  33.49 
 
 
428 aa  199  9e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0487186  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3102  chloride channel protein  34.02 
 
 
471 aa  196  9e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0695  chloride channel protein  31.75 
 
 
466 aa  193  8e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.750689  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  32.09 
 
 
473 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  32.09 
 
 
473 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  32.09 
 
 
473 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  32.09 
 
 
473 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  32.09 
 
 
473 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2409  Chloride channel core  32.65 
 
 
435 aa  189  8e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0782  chloride channel protein  33.51 
 
 
479 aa  186  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.12239 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1576  chloride channel protein  29.84 
 
 
463 aa  179  1e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.803836 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0552  Cl- channel, voltage-gated family protein  33.88 
 
 
437 aa  178  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0212  chloride channel protein  34.83 
 
 
456 aa  177  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0993  chloride channel protein  30.65 
 
 
478 aa  168  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3458  chloride channel protein  30.65 
 
 
478 aa  168  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.41349  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3329  chloride channel protein  30.65 
 
 
478 aa  168  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000478  H(+)/Cl(-) exchange transporter ClcA  32.45 
 
 
467 aa  167  2.9999999999999998e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.791443  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0459  chloride channel protein  31.24 
 
 
468 aa  162  9e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.511438  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1698  chloride channel protein  31.28 
 
 
427 aa  159  1e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  31.03 
 
 
859 aa  159  1e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3026  chloride channel protein  34.94 
 
 
436 aa  159  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.139269  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1697  chloride channel protein  31.05 
 
 
427 aa  157  4e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2176  chloride channel protein  32.31 
 
 
466 aa  156  7e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.462447  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0866  chloride channel protein  29.84 
 
 
470 aa  154  4e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0280286  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06233  chloride channel protein  32.44 
 
 
468 aa  154  4e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0318  Chloride channel core  30.51 
 
 
511 aa  153  7e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000450379  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4719  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.37 
 
 
439 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2460  chloride channel core  33.9 
 
 
459 aa  151  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11718  normal  0.460638 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0165  chloride channel protein  33.33 
 
 
473 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0167  chloride channel protein  33.33 
 
 
473 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0159  chloride channel protein  33.33 
 
 
473 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00154  chloride channel protein  33.33 
 
 
473 aa  147  5e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0502549  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3447  Chloride channel core  33.33 
 
 
473 aa  147  5e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0160  chloride channel protein  33.33 
 
 
473 aa  147  5e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3504  chloride channel protein  33.33 
 
 
473 aa  147  5e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17992  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00153  hypothetical protein  33.33 
 
 
473 aa  147  5e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0410723  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0147  chloride channel protein  32.65 
 
 
473 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2366  Cl- channel voltage-gated family protein  26.83 
 
 
416 aa  144  4e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  28.52 
 
 
863 aa  143  8e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4427  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.86 
 
 
439 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.292219 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4200  Cl- channel, voltage gated  29.86 
 
 
439 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.419413  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4266  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.86 
 
 
439 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal  0.948351 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2810  chloride channel protein  31.21 
 
 
472 aa  140  6e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2009  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.64 
 
 
443 aa  137  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  30.28 
 
 
862 aa  134  5e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1638  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.22 
 
 
436 aa  133  6e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5126  Chloride channel core  30.73 
 
 
455 aa  130  7.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.967493 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  32.74 
 
 
606 aa  129  8.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4138  Chloride channel core  29.45 
 
 
455 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  32.87 
 
 
875 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3829  chloride channel core  29.38 
 
 
455 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2509  chloride channel protein  32.53 
 
 
455 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2680  Chloride channel core  32.63 
 
 
879 aa  123  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3436  Chloride channel core  32.63 
 
 
879 aa  123  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  28.33 
 
 
569 aa  123  7e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  29.95 
 
 
897 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  28.57 
 
 
863 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0773  Chloride channel core  31.68 
 
 
444 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.80393  normal  0.191961 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  26.02 
 
 
615 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  29.46 
 
 
598 aa  114  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  26.57 
 
 
608 aa  114  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  28.43 
 
 
584 aa  114  4.0000000000000004e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0608  Chloride channel core  27.02 
 
 
468 aa  114  4.0000000000000004e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.277563  hitchhiker  0.00926023 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0546  Cl- channel, voltage gated  26.67 
 
 
559 aa  111  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1622  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.55 
 
 
754 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3504  chloride channel family protein  27.79 
 
 
602 aa  110  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5971  Chloride channel core  30.06 
 
 
447 aa  110  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306058  normal  0.236498 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1071  hypothetical protein  25.22 
 
 
457 aa  110  9.000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7107  Chloride channel core  31.11 
 
 
447 aa  109  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.134894 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0367  Chloride channel core  28.72 
 
 
595 aa  109  1e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18921  putative chloride channel  28.46 
 
 
452 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  26.27 
 
 
626 aa  107  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2543  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.66 
 
 
591 aa  107  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.232119  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  25.77 
 
 
614 aa  106  8e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0690  Cl- channel, voltage-gated family protein  25.39 
 
 
591 aa  106  8e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.441434  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4624  voltage-gated chloride channel  28.74 
 
 
574 aa  106  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1794  putative chloride channel  28.2 
 
 
452 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>