More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5971 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0773  Chloride channel core  82.83 
 
 		 444 aa  672    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.80393  normal  0.191961 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5971  Chloride channel core  100 
 
 		 447 aa  870    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306058  normal  0.236498 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7107  Chloride channel core  93.29 
 
 		 447 aa  751    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.134894 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3051  chloride channel core  66.14 
 
 		 449 aa  567  1e-160  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156315  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0318  voltage gated chloride channel family protein  66.14 
 
 		 490 aa  562  1.0000000000000001e-159  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0350  voltage gated chloride channel family protein  66.14 
 
 		 451 aa  563  1.0000000000000001e-159  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.973552  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1139  chloride channel protein  69.32 
 
 		 440 aa  543  1e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1046  Cl- channel, voltage gated  63.66 
 
 		 449 aa  496  1e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.0017165  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3037  Cl- channel, voltage-gated family protein  58.64 
 
 		 441 aa  419  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4474  Chloride channel core  48.83 
 
 		 424 aa  332  7.000000000000001e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.125667  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5041  putative H(+)/Cl(-) exchange transporter  52.7 
 
 		 445 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3760  chloride channel core  48.05 
 
 		 459 aa  322  9.000000000000001e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.503672  normal  0.147153 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0608  Chloride channel core  46.71 
 
 		 468 aa  312  6.999999999999999e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.277563  hitchhiker  0.00926023 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0957  chloride channel core  48.66 
 
 		 442 aa  303  3.0000000000000004e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0796788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4258  Chloride channel core  46.56 
 
 		 445 aa  300  3e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3157  chloride channel core  45.52 
 
 		 441 aa  288  1e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.236304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0948  chloride channel core  43.26 
 
 		 520 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3353  Chloride channel core  45.23 
 
 		 441 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1059  Chloride channel core  41.95 
 
 		 474 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4091  Cl- channel, voltage gated  42.32 
 
 		 513 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0815105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0509  Cl- channel, voltage gated  42.05 
 
 		 518 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0988  Cl- channel, voltage-gated family protein  42.05 
 
 		 518 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170879  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3481  Chloride channel core  44.84 
 
 		 441 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.429207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5405  Chloride channel core  47.8 
 
 		 437 aa  283  6.000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0213924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0848  Cl- channel, voltage-gated family protein  41.61 
 
 		 521 aa  276  8e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.17126  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0860  chloride channel core  40.68 
 
 		 565 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.442414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1573  voltage gated chloride channel family protein  41.27 
 
 		 563 aa  272  1e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.556285  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1638  Cl- channel, voltage-gated family protein  41.25 
 
 		 436 aa  270  5e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2411  chloride channel core  40.45 
 
 		 517 aa  268  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3980  Chloride channel core  43.26 
 
 		 435 aa  268  2e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3866  Chloride channel core  43.26 
 
 		 435 aa  268  2e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6166  chloride channel core  51.48 
 
 		 438 aa  266  4e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0747104  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3959  voltage-gated chloride channel family protein  43.09 
 
 		 453 aa  266  5e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.536311 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6686  Chloride channel core  49.45 
 
 		 438 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.709238  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1867  chloride channel, core  43.09 
 
 		 453 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.144395 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1380  Chloride channel core  45.06 
 
 		 523 aa  262  8.999999999999999e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.332238  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2667  putative chloride-channel protein  41.55 
 
 		 447 aa  262  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3825  Chloride channel core  44.02 
 
 		 447 aa  261  2e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2109  voltage gated chloride channel family protein  41.53 
 
 		 551 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.732554  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0803  chloride channel (ClC) family protein  41.53 
 
 		 576 aa  257  3e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.781584  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2964  voltage gated chloride channel family protein  41.53 
 
 		 562 aa  256  4e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3029  chloride channel (ClC) family protein  41.59 
 
 		 578 aa  256  4e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3062  voltage gated chloride channel family protein  41.59 
 
 		 576 aa  256  5e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1977  chloride channel (ClC) family protein  41.53 
 
 		 560 aa  256  5e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2635  chloride channel (ClC) family protein  41.53 
 
 		 560 aa  256  5e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04784  chloride channel  42.89 
 
 		 464 aa  256  7e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147054  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0660  chloride channel core  40.81 
 
 		 485 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5024  chloride channel core  40.98 
 
 		 435 aa  248  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.283632  normal  0.200334 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6367  Chloride channel core  40.68 
 
 		 441 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0697  Cl- channel, voltage gated  43.59 
 
 		 439 aa  241  2.9999999999999997e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6573  Cl- channel, voltage gated  37.84 
 
 		 439 aa  234  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.939375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1500  Cl- channel, voltage gated  40.82 
 
 		 433 aa  233  6e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0110  voltage gated chloride channel family protein  39.37 
 
 		 485 aa  229  6e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0419274  hitchhiker  0.00996162 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6335  Chloride channel core  38.55 
 
 		 456 aa  228  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1155  Cl- channel, voltage gated  37.79 
 
 		 440 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.599671  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3820  Cl- channel, voltage-gated family protein  37.77 
 
 		 454 aa  216  8e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0706898  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4712  Cl- channel, voltage-gated family protein  40.42 
 
 		 470 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3055  Cl- channel, voltage gated  40.57 
 
 		 506 aa  212  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.938884  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3213  Cl- channel, voltage gated  38.76 
 
 		 522 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5838  chloride channel core  38.95 
 
 		 485 aa  207  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.697782 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3257  chloride channel core  38.04 
 
 		 446 aa  196  8.000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3116  chloride channel protein  30.16 
 
 		 453 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.958796 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5803  Cl- channel voltage-gated family protein  31.74 
 
 		 466 aa  158  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0706283  normal  0.393732 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  32.79 
 
 		 473 aa  142  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  32.79 
 
 		 473 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  32.79 
 
 		 473 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  32.79 
 
 		 473 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  32.79 
 
 		 473 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  33.15 
 
 		 569 aa  136  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2188  Chloride channel core  29.81 
 
 		 563 aa  135  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000751746  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1830  chloride channel protein EriC  31.65 
 
 		 512 aa  134  3e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.116382  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A25  chloride channel protein EriC  31.03 
 
 		 510 aa  132  9e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3525  Chloride channel core  31.22 
 
 		 533 aa  130  6e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  28.68 
 
 		 519 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0757  Chloride channel core  31.08 
 
 		 528 aa  127  3e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.937422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0782  chloride channel protein  29.47 
 
 		 479 aa  127  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.12239 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0695  chloride channel protein  30.47 
 
 		 466 aa  125  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.750689  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  32.72 
 
 		 859 aa  124  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2944  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.67 
 
 		 526 aa  125  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0120087  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  27.74 
 
 		 519 aa  125  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3102  chloride channel protein  30.85 
 
 		 471 aa  125  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1107  voltage-gated chloride channel family protein  30.34 
 
 		 510 aa  123  7e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6434  Chloride channel core  29.1 
 
 		 600 aa  120  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  31.56 
 
 		 863 aa  120  6e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  30.67 
 
 		 606 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0993  chloride channel protein  27.53 
 
 		 478 aa  116  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3458  chloride channel protein  27.53 
 
 		 478 aa  116  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.41349  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  30.81 
 
 		 626 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3329  chloride channel protein  27.53 
 
 		 478 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0147  chloride channel protein  31.07 
 
 		 473 aa  114  3e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14511  chloride channel  28.54 
 
 		 455 aa  114  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1147  chloride channel protein EriC  29.33 
 
 		 487 aa  114  4.0000000000000004e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.433892  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0165  chloride channel protein  31.07 
 
 		 473 aa  113  9e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0167  chloride channel protein  31.07 
 
 		 473 aa  113  9e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3447  Chloride channel core  30.84 
 
 		 473 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00153  hypothetical protein  30.84 
 
 		 473 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0410723  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3504  chloride channel protein  30.84 
 
 		 473 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0681  Chloride channel core  26.32 
 
 		 538 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0762  chloride channel core  29.77 
 
 		 518 aa  112  1.0000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000775923  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0160  chloride channel protein  30.84 
 
 		 473 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>