More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1891 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1891  chloride channel protein EriC  100 
 
 		 534 aa  1063    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.85971e-16 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0391  chloride channel, core  43.58 
 
 		 516 aa  400  9.999999999999999e-111  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000201773  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A25  chloride channel protein EriC  42.8 
 
 		 510 aa  377  1e-103  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1107  voltage-gated chloride channel family protein  38.42 
 
 		 510 aa  344  2.9999999999999997e-93  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  36.57 
 
 		 519 aa  318  1e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  37.11 
 
 		 519 aa  317  5e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2944  Cl- channel, voltage-gated family protein  37.28 
 
 		 526 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0120087  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1147  chloride channel protein EriC  40.49 
 
 		 487 aa  309  6.999999999999999e-83  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.433892  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0845  chloride channel protein EriC  37.09 
 
 		 512 aa  298  1e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1662  voltage-gated chloride channel family protein  34.3 
 
 		 523 aa  296  8e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1400  chloride channel protein  34.1 
 
 		 523 aa  296  9e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.340394  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1830  chloride channel protein EriC  35.97 
 
 		 512 aa  291  2e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.116382  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0189  chloride channel, core  35.77 
 
 		 445 aa  286  7e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0386  chloride channel protein EriC  38.52 
 
 		 457 aa  285  2.0000000000000002e-75  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000543407 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0681  Chloride channel core  33.27 
 
 		 538 aa  276  5e-73  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2188  Chloride channel core  33.53 
 
 		 563 aa  274  3e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000751746  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0762  chloride channel core  35.28 
 
 		 518 aa  267  4e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000775923  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2179  voltage-gated chloride channel  32.75 
 
 		 528 aa  264  3e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1346  chloride channel protein  32.5 
 
 		 527 aa  233  6e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0757  Chloride channel core  31.66 
 
 		 528 aa  228  2e-58  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.937422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1588  Cl- channel, voltage gated  33.41 
 
 		 539 aa  200  3.9999999999999996e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000108225  normal  0.782392 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0118  chloride transporter, ClC family  31.15 
 
 		 455 aa  181  2e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1576  chloride channel protein  30.68 
 
 		 463 aa  180  4e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.803836 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0449  Chloride channel core  30.02 
 
 		 428 aa  178  3e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0487186  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3525  Chloride channel core  30.18 
 
 		 533 aa  178  3e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0782  chloride channel protein  32.6 
 
 		 479 aa  177  4e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.12239 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  30.72 
 
 		 473 aa  177  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3102  chloride channel protein  33.59 
 
 		 471 aa  177  6e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  30.49 
 
 		 473 aa  176  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  30.11 
 
 		 473 aa  176  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  30.11 
 
 		 473 aa  176  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  30.11 
 
 		 473 aa  176  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0695  chloride channel protein  30.41 
 
 		 466 aa  171  3e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.750689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0318  Chloride channel core  30 
 
 		 511 aa  162  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000450379  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3329  chloride channel protein  30.65 
 
 		 478 aa  159  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0993  chloride channel protein  30.65 
 
 		 478 aa  159  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3458  chloride channel protein  30.65 
 
 		 478 aa  159  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.41349  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0866  chloride channel protein  32.5 
 
 		 470 aa  157  3e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0280286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2409  Chloride channel core  32.63 
 
 		 435 aa  153  8e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0212  chloride channel protein  31.36 
 
 		 456 aa  150  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0459  chloride channel protein  31.48 
 
 		 468 aa  148  3e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.511438  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000478  H(+)/Cl(-) exchange transporter ClcA  31 
 
 		 467 aa  141  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.791443  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2366  Cl- channel voltage-gated family protein  27.25 
 
 		 416 aa  138  2e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06233  chloride channel protein  31.52 
 
 		 468 aa  139  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  30.66 
 
 		 859 aa  137  7.000000000000001e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2810  chloride channel protein  31.4 
 
 		 472 aa  136  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0147  chloride channel protein  29.84 
 
 		 473 aa  135  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5126  Chloride channel core  30.45 
 
 		 455 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.967493 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00154  chloride channel protein  30.07 
 
 		 473 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0502549  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3447  Chloride channel core  30.07 
 
 		 473 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0159  chloride channel protein  30.07 
 
 		 473 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3504  chloride channel protein  30.07 
 
 		 473 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00153  hypothetical protein  30.07 
 
 		 473 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0410723  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2460  chloride channel core  30.49 
 
 		 459 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11718  normal  0.460638 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0165  chloride channel protein  30.07 
 
 		 473 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0167  chloride channel protein  30.07 
 
 		 473 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0160  chloride channel protein  30.07 
 
 		 473 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4138  Chloride channel core  28.57 
 
 		 455 aa  135  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3829  chloride channel core  29.87 
 
 		 455 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2009  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.48 
 
 		 443 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2176  chloride channel protein  32.05 
 
 		 466 aa  131  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.462447  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0552  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.41 
 
 		 437 aa  130  8.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4719  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.74 
 
 		 439 aa  127  6e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4427  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.23 
 
 		 439 aa  126  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.292219 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4200  Cl- channel, voltage gated  27.23 
 
 		 439 aa  126  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.419413  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4266  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.23 
 
 		 439 aa  126  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal  0.948351 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1698  chloride channel protein  29.44 
 
 		 427 aa  121  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  29.17 
 
 		 606 aa  119  9e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1697  chloride channel protein  28.76 
 
 		 427 aa  119  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3026  chloride channel protein  31.02 
 
 		 436 aa  117  6e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.139269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  29.31 
 
 		 862 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1638  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.86 
 
 		 436 aa  116  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  25 
 
 		 569 aa  114  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2509  chloride channel protein  30.99 
 
 		 455 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01900  conserved hypothetical protein  26.13 
 
 		 873 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00397821  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  26.98 
 
 		 863 aa  110  6e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  26.94 
 
 		 875 aa  110  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2297  putative chloride channel  26.36 
 
 		 460 aa  109  2e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.73973  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1130  Chloride channel core  23.79 
 
 		 617 aa  107  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.711755  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.73 
 
 		 587 aa  105  3e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18351  putative chloride channel  26.15 
 
 		 452 aa  103  9e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1448  Chloride channel core  26.71 
 
 		 627 aa  103  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.132053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  25.71 
 
 		 470 aa  103  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  25.45 
 
 		 613 aa  101  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  24.35 
 
 		 614 aa  100  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53364  voltage-gated chloride channel  25.94 
 
 		 764 aa  100  9e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18921  putative chloride channel  29.32 
 
 		 452 aa  97.4  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  25.11 
 
 		 863 aa  97.1  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4507  Cl- channel, voltage-gated family protein  23.81 
 
 		 594 aa  97.1  7e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21821  putative chloride channel  27.54 
 
 		 452 aa  97.1  8e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.607028 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1639  Cl- channel voltage-gated family protein  26.83 
 
 		 597 aa  97.1  8e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  24.94 
 
 		 615 aa  96.7  9e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  26.69 
 
 		 584 aa  96.3  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  30.73 
 
 		 897 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19111  putative chloride channel  28.15 
 
 		 452 aa  95.5  2e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18921  putative chloride channel  26.77 
 
 		 452 aa  95.9  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.708029  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1794  putative chloride channel  27.96 
 
 		 452 aa  95.9  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.62 
 
 		 589 aa  95.5  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.73 
 
 		 589 aa  95.1  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.4 
 
 		 579 aa  95.1  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>