269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_53364 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001307  ANIA_02308  ClC chloride ion channel (Eurofung)  45.29 
 
 		 828 aa  656    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.382711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53364  voltage-gated chloride channel  100 
 
 		 764 aa  1580    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01900  conserved hypothetical protein  42.13 
 
 		 873 aa  578  1.0000000000000001e-163  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00397821  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06311  ClC chloride ion channel (Eurofung)  31.85 
 
 		 793 aa  377  1e-103  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06107  CLC channel [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q870M6]  31.19 
 
 		 909 aa  358  1.9999999999999998e-97  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.20732  normal  0.131172 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03790  voltage-gated chloride channel, putative  38.02 
 
 		 897 aa  349  1e-94  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57787  voltage-gated protein/chloride channel  29.73 
 
 		 869 aa  271  4e-71  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0658005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83582  chloride channel, possibly voltage gated  29.91 
 
 		 818 aa  245  3e-63  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.172936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_52412  channel voltage activated chloride channel  25.04 
 
 		 693 aa  193  1e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28245  voltage activated chloride channel CLC7 type  24.12 
 
 		 768 aa  184  5.0000000000000004e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.385606  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  25.95 
 
 		 859 aa  164  5.0000000000000005e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  26.09 
 
 		 863 aa  154  4e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  25.17 
 
 		 862 aa  153  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2680  Chloride channel core  23.58 
 
 		 879 aa  132  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3436  Chloride channel core  23.58 
 
 		 879 aa  132  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  24.18 
 
 		 875 aa  127  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34455  ClC family transporter: chloride ion channel  23.85 
 
 		 802 aa  126  2e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46097  predicted protein  25.93 
 
 		 980 aa  124  5e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  23.98 
 
 		 863 aa  124  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_50496  ClC family transporter: chloride ion channel  28.81 
 
 		 869 aa  117  6.9999999999999995e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.913408  normal  0.293754 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1588  CBS  25.76 
 
 		 859 aa  114  6e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.497223  normal  0.185787 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  24.67 
 
 		 519 aa  105  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  25.05 
 
 		 519 aa  105  4e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3102  chloride channel protein  26.15 
 
 		 471 aa  102  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  25.92 
 
 		 473 aa  102  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  25.92 
 
 		 473 aa  102  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  25.92 
 
 		 473 aa  102  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  23.33 
 
 		 897 aa  101  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  25.65 
 
 		 473 aa  100  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  25.65 
 
 		 473 aa  100  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2188  Chloride channel core  27.08 
 
 		 563 aa  98.6  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000751746  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3525  Chloride channel core  24.19 
 
 		 533 aa  96.7  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3329  chloride channel protein  27.64 
 
 		 478 aa  95.9  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0993  chloride channel protein  27.37 
 
 		 478 aa  95.5  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3458  chloride channel protein  27.37 
 
 		 478 aa  95.5  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.41349  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14344  ClC family transporter: chloride ion channel  23.11 
 
 		 718 aa  95.1  4e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  22.93 
 
 		 613 aa  94.7  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0695  chloride channel protein  24.87 
 
 		 466 aa  94.7  6e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.750689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A25  chloride channel protein EriC  23.91 
 
 		 510 aa  94.4  7e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  22.71 
 
 		 614 aa  91.3  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4427  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.61 
 
 		 439 aa  89.7  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.292219 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4200  Cl- channel, voltage gated  27.61 
 
 		 439 aa  89.7  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.419413  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2176  chloride channel protein  25.74 
 
 		 466 aa  89.7  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.462447  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1891  chloride channel protein EriC  25.44 
 
 		 534 aa  89.7  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.85971e-16 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4266  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.61 
 
 		 439 aa  89.7  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal  0.948351 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0782  chloride channel protein  24.13 
 
 		 479 aa  89.4  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.12239 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1576  chloride channel protein  24.18 
 
 		 463 aa  89  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.803836 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  21.78 
 
 		 608 aa  87.8  7e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2944  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.49 
 
 		 526 aa  85.9  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0120087  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0147  chloride channel protein  25.93 
 
 		 473 aa  84.7  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0845  chloride channel protein EriC  25.7 
 
 		 512 aa  84.7  0.000000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  22.46 
 
 		 582 aa  83.6  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2509  chloride channel protein  26.98 
 
 		 455 aa  82  0.00000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1352  Cl- channel, voltage gated  25.63 
 
 		 577 aa  82  0.00000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1662  voltage-gated chloride channel family protein  25.18 
 
 		 523 aa  81.6  0.00000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00154  chloride channel protein  25.71 
 
 		 473 aa  81.3  0.00000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0502549  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3447  Chloride channel core  25.71 
 
 		 473 aa  81.3  0.00000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5126  Chloride channel core  24.49 
 
 		 455 aa  81.3  0.00000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.967493 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0160  chloride channel protein  25.71 
 
 		 473 aa  81.3  0.00000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00153  hypothetical protein  25.71 
 
 		 473 aa  81.3  0.00000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0410723  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0165  chloride channel protein  25.71 
 
 		 473 aa  81.3  0.00000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3504  chloride channel protein  25.71 
 
 		 473 aa  81.3  0.00000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0167  chloride channel protein  25.71 
 
 		 473 aa  81.3  0.00000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  23.98 
 
 		 669 aa  81.3  0.00000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1622  Cl- channel, voltage-gated family protein  21.53 
 
 		 754 aa  81.3  0.00000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0681  Chloride channel core  23.99 
 
 		 538 aa  80.9  0.00000000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1400  chloride channel protein  25.18 
 
 		 523 aa  80.9  0.00000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.340394  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  25.5 
 
 		 470 aa  80.5  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0159  chloride channel protein  25.49 
 
 		 473 aa  80.5  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  24.93 
 
 		 569 aa  80.5  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1257  chloride channel-like  24.88 
 
 		 615 aa  79.3  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.95023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0866  chloride channel protein  27.02 
 
 		 470 aa  79.3  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0280286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4719  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.34 
 
 		 439 aa  79.7  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  21.78 
 
 		 598 aa  79  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0525  Cl- channel voltage-gated family protein  21.66 
 
 		 579 aa  78.6  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0845  Chloride channel core  24.24 
 
 		 640 aa  77.8  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0525209 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0832  chloride channel  22.94 
 
 		 585 aa  77.4  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1697  chloride channel protein  26.96 
 
 		 427 aa  76.3  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0212  chloride channel protein  25.37 
 
 		 456 aa  76.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2810  chloride channel protein  23.75 
 
 		 472 aa  76.6  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1639  Cl- channel voltage-gated family protein  23.3 
 
 		 597 aa  75.9  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6390  Chloride channel core  22.71 
 
 		 604 aa  75.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.315587  normal  0.638262 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  25.4 
 
 		 626 aa  75.5  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2437  chloride channel core  25.2 
 
 		 629 aa  75.1  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.276438  normal  0.470563 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0386  chloride channel protein EriC  23.54 
 
 		 457 aa  75.5  0.000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000543407 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2409  Chloride channel core  25.31 
 
 		 435 aa  74.7  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0583  Chloride channel core  24.8 
 
 		 462 aa  74.7  0.000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0762  chloride channel core  22.91 
 
 		 518 aa  74.3  0.000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000775923  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0757  Chloride channel core  22.95 
 
 		 528 aa  73.9  0.00000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.937422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0189  chloride channel, core  25.13 
 
 		 445 aa  73.2  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1107  voltage-gated chloride channel family protein  24.74 
 
 		 510 aa  72  0.00000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1698  chloride channel protein  26.44 
 
 		 427 aa  72  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4138  Chloride channel core  23.69 
 
 		 455 aa  71.2  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3116  chloride channel protein  24.05 
 
 		 453 aa  71.6  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.958796 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  21.39 
 
 		 587 aa  71.6  0.00000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3829  chloride channel core  23.94 
 
 		 455 aa  70.9  0.00000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4507  Cl- channel, voltage-gated family protein  23.77 
 
 		 594 aa  70.9  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0449  Chloride channel core  46.25 
 
 		 428 aa  70.5  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0487186  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2950  Cl- channel, voltage gated  21.48 
 
 		 613 aa  70.1  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.952562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19111  putative chloride channel  26.11 
 
 		 452 aa  70.5  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>