239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_57787 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009043  PICST_57787  voltage-gated protein/chloride channel  100 
 
 		 869 aa  1786    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0658005  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06107  CLC channel [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q870M6]  35.71 
 
 		 909 aa  486  1e-136  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.20732  normal  0.131172 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03790  voltage-gated chloride channel, putative  29.41 
 
 		 897 aa  363  1e-98  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01900  conserved hypothetical protein  27.69 
 
 		 873 aa  281  4e-74  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00397821  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02308  ClC chloride ion channel (Eurofung)  29.97 
 
 		 828 aa  275  3e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.382711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53364  voltage-gated chloride channel  29.73 
 
 		 764 aa  271  5e-71  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06311  ClC chloride ion channel (Eurofung)  32.7 
 
 		 793 aa  228  4e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83582  chloride channel, possibly voltage gated  30.97 
 
 		 818 aa  189  2e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.172936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_52412  channel voltage activated chloride channel  27.99 
 
 		 693 aa  155  5e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28245  voltage activated chloride channel CLC7 type  28.23 
 
 		 768 aa  153  1e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.385606  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_50496  ClC family transporter: chloride ion channel  26.35 
 
 		 869 aa  135  3.9999999999999996e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.913408  normal  0.293754 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46097  predicted protein  24.74 
 
 		 980 aa  116  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  24.89 
 
 		 859 aa  113  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34455  ClC family transporter: chloride ion channel  25.2 
 
 		 802 aa  102  3e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  26.49 
 
 		 862 aa  101  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  24.06 
 
 		 863 aa  101  6e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  25.62 
 
 		 519 aa  98.2  6e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1830  chloride channel protein EriC  25.31 
 
 		 512 aa  97.4  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.116382  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1400  chloride channel protein  29.5 
 
 		 523 aa  96.3  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.340394  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1662  voltage-gated chloride channel family protein  29.5 
 
 		 523 aa  95.9  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A25  chloride channel protein EriC  25.62 
 
 		 510 aa  95.9  3e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  26.67 
 
 		 897 aa  95.5  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  24.49 
 
 		 519 aa  95.1  5e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  23.33 
 
 		 875 aa  93.6  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  25.89 
 
 		 569 aa  93.6  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1448  Chloride channel core  27.92 
 
 		 627 aa  92.8  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.132053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  25.94 
 
 		 470 aa  92  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  25 
 
 		 473 aa  91.3  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  25 
 
 		 473 aa  91.7  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  25 
 
 		 473 aa  91.3  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  25 
 
 		 473 aa  91.7  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  25 
 
 		 473 aa  91.3  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.18 
 
 		 579 aa  90.5  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.18 
 
 		 636 aa  90.9  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2188  Chloride channel core  24.58 
 
 		 563 aa  90.5  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000751746  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.18 
 
 		 579 aa  90.5  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0681  Chloride channel core  23.06 
 
 		 538 aa  90.1  1e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.18 
 
 		 579 aa  90.5  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.18 
 
 		 628 aa  89.7  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2944  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.9 
 
 		 526 aa  89  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0120087  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3102  chloride channel protein  25.3 
 
 		 471 aa  89  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1576  chloride channel protein  24.07 
 
 		 463 aa  87.4  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.803836 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  23.71 
 
 		 593 aa  84.3  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  22.34 
 
 		 598 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  23.98 
 
 		 593 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1638  Cl- channel, voltage-gated family protein  24.21 
 
 		 436 aa  83.6  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  23.12 
 
 		 589 aa  83.2  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0695  chloride channel protein  24.63 
 
 		 466 aa  82.4  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.750689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0782  chloride channel protein  25 
 
 		 479 aa  81.3  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.12239 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3525  Chloride channel core  22.79 
 
 		 533 aa  80.5  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  21.29 
 
 		 613 aa  79.7  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1400  chloride channel, putative  25.47 
 
 		 631 aa  79.3  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  22.43 
 
 		 577 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1891  chloride channel protein EriC  22.59 
 
 		 534 aa  79  0.0000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.85971e-16 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2283  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  23.24 
 
 		 591 aa  79.3  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0866  chloride channel protein  23.66 
 
 		 470 aa  78.2  0.0000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0280286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1573  voltage gated chloride channel family protein  29.23 
 
 		 563 aa  78.2  0.0000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.556285  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0386  chloride channel protein EriC  22.99 
 
 		 457 aa  78.2  0.0000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000543407 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1697  chloride channel protein  24.44 
 
 		 427 aa  77.8  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4427  Cl- channel, voltage-gated family protein  23.73 
 
 		 439 aa  77.8  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.292219 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4200  Cl- channel, voltage gated  23.73 
 
 		 439 aa  77.8  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.419413  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4266  Cl- channel, voltage-gated family protein  23.73 
 
 		 439 aa  77.8  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal  0.948351 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0757  Chloride channel core  23.22 
 
 		 528 aa  77  0.000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.937422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0189  chloride channel, core  22.86 
 
 		 445 aa  76.6  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  23.08 
 
 		 589 aa  76.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6342  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  23.08 
 
 		 589 aa  76.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867968  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1737  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  23.08 
 
 		 589 aa  76.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3458  chloride channel protein  22.55 
 
 		 478 aa  75.9  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.41349  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0993  chloride channel protein  22.55 
 
 		 478 aa  75.9  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1514  Chloride channel core  25.34 
 
 		 627 aa  76.3  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3329  chloride channel protein  22.55 
 
 		 478 aa  75.9  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1352  Cl- channel, voltage gated  23.73 
 
 		 577 aa  75.5  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2109  voltage gated chloride channel family protein  27.84 
 
 		 551 aa  75.1  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.732554  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0803  chloride channel (ClC) family protein  27.84 
 
 		 576 aa  75.1  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.781584  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1184  Chloride channel core  26.21 
 
 		 628 aa  74.7  0.000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0945746  normal  0.895336 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1698  chloride channel protein  24.19 
 
 		 427 aa  74.7  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1977  chloride channel (ClC) family protein  27.84 
 
 		 560 aa  75.1  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2635  chloride channel (ClC) family protein  27.84 
 
 		 560 aa  75.1  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3029  chloride channel (ClC) family protein  27.87 
 
 		 578 aa  74.7  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1059  Chloride channel core  26.49 
 
 		 474 aa  74.3  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3062  voltage gated chloride channel family protein  27.84 
 
 		 576 aa  74.3  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0948  chloride channel core  27.32 
 
 		 520 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  27.27 
 
 		 863 aa  73.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2964  voltage gated chloride channel family protein  27.84 
 
 		 562 aa  74.3  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  21.88 
 
 		 614 aa  72  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0509  Cl- channel, voltage gated  27.22 
 
 		 518 aa  72  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3436  Chloride channel core  23.33 
 
 		 879 aa  72.4  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0988  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.22 
 
 		 518 aa  72  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170879  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  24 
 
 		 582 aa  72  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2680  Chloride channel core  23.33 
 
 		 879 aa  72.4  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11720  Chloride channel core  24.61 
 
 		 402 aa  72  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000807988  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2176  chloride channel protein  24.69 
 
 		 466 aa  72  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.462447  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2179  voltage-gated chloride channel  21.88 
 
 		 528 aa  71.6  0.00000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4091  Cl- channel, voltage gated  27.27 
 
 		 513 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0815105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04784  chloride channel  25.3 
 
 		 464 aa  69.7  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147054  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0860  chloride channel core  26.48 
 
 		 565 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.442414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1639  Cl- channel voltage-gated family protein  24.26 
 
 		 597 aa  69.7  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2411  chloride channel core  27.3 
 
 		 517 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1246  Cl- channel, voltage-gated family protein  23.45 
 
 		 620 aa  69.3  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14344  ClC family transporter: chloride ion channel  23.93 
 
 		 718 aa  69.3  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>