247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_46097 on replicon NC_011677
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011677  PHATRDRAFT_46097  predicted protein  100 
 
 
980 aa  2018    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_52412  channel voltage activated chloride channel  32.73 
 
 
693 aa  239  2e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28245  voltage activated chloride channel CLC7 type  29.4 
 
 
768 aa  238  5.0000000000000005e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.385606  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34455  ClC family transporter: chloride ion channel  30.27 
 
 
802 aa  227  9e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_50496  ClC family transporter: chloride ion channel  29.33 
 
 
869 aa  219  2e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.913408  normal  0.293754 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14344  ClC family transporter: chloride ion channel  31.78 
 
 
718 aa  169  2.9999999999999998e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53364  voltage-gated chloride channel  25.93 
 
 
764 aa  166  2.0000000000000002e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06107  CLC channel [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q870M6]  26.02 
 
 
909 aa  160  1e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.20732  normal  0.131172 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02308  ClC chloride ion channel (Eurofung)  26.92 
 
 
828 aa  160  1e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.382711  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01900  conserved hypothetical protein  26.97 
 
 
873 aa  158  4e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00397821  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03790  voltage-gated chloride channel, putative  27.63 
 
 
897 aa  153  2e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06311  ClC chloride ion channel (Eurofung)  28.64 
 
 
793 aa  151  7e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57787  voltage-gated protein/chloride channel  24.32 
 
 
869 aa  144  7e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0658005  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83582  chloride channel, possibly voltage gated  26.15 
 
 
818 aa  144  8e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.172936  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  24.6 
 
 
859 aa  107  8e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  25.05 
 
 
875 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3436  Chloride channel core  26.13 
 
 
879 aa  95.1  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2680  Chloride channel core  26.13 
 
 
879 aa  95.1  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0695  chloride channel protein  23.85 
 
 
466 aa  94.7  7e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.750689  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  24.31 
 
 
519 aa  93.2  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1638  Cl- channel, voltage-gated family protein  24.86 
 
 
436 aa  93.6  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3525  Chloride channel core  24.65 
 
 
533 aa  90.9  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  25.15 
 
 
897 aa  89.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0681  Chloride channel core  20.95 
 
 
538 aa  82.4  0.00000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0386  chloride channel protein EriC  22.7 
 
 
457 aa  80.5  0.0000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000543407 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1622  Cl- channel, voltage-gated family protein  23.58 
 
 
754 aa  78.6  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  28.28 
 
 
863 aa  77.8  0.0000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3116  chloride channel protein  25.87 
 
 
453 aa  77.8  0.0000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.958796 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2176  chloride channel protein  25.79 
 
 
466 aa  77.8  0.0000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.462447  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  26.26 
 
 
473 aa  77.4  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A25  chloride channel protein EriC  20.95 
 
 
510 aa  75.9  0.000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  26.01 
 
 
473 aa  75.5  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  26.01 
 
 
473 aa  75.5  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  26.01 
 
 
473 aa  75.5  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  26.01 
 
 
473 aa  75.5  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2188  Chloride channel core  28.66 
 
 
563 aa  74.7  0.000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000751746  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1830  chloride channel protein EriC  30.95 
 
 
512 aa  74.3  0.000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.116382  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0608  Chloride channel core  24.61 
 
 
468 aa  73.9  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.277563  hitchhiker  0.00926023 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0782  chloride channel protein  27.37 
 
 
479 aa  73.6  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.12239 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0757  Chloride channel core  23.85 
 
 
528 aa  73.6  0.00000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.937422  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6434  Chloride channel core  26.6 
 
 
600 aa  73.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18921  putative chloride channel  23.55 
 
 
452 aa  73.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.708029  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0773  Chloride channel core  25.52 
 
 
444 aa  72.8  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.80393  normal  0.191961 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  33.18 
 
 
863 aa  72.8  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3329  chloride channel protein  28.1 
 
 
478 aa  72.8  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3458  chloride channel protein  28.1 
 
 
478 aa  72.4  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.41349  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0993  chloride channel protein  28.1 
 
 
478 aa  72.4  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1246  Cl- channel, voltage-gated family protein  23.17 
 
 
620 aa  72  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18921  putative chloride channel  23.21 
 
 
452 aa  70.9  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  28.9 
 
 
862 aa  70.5  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3102  chloride channel protein  29.76 
 
 
471 aa  70.5  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  23.68 
 
 
569 aa  69.3  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1794  putative chloride channel  23.02 
 
 
452 aa  68.6  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2437  chloride channel core  23.27 
 
 
629 aa  68.9  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.276438  normal  0.470563 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19111  putative chloride channel  21.86 
 
 
452 aa  68.6  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3051  chloride channel core  24.65 
 
 
449 aa  68.6  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156315  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4507  Cl- channel, voltage-gated family protein  21.22 
 
 
594 aa  68.6  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0318  voltage gated chloride channel family protein  25.4 
 
 
490 aa  68.2  0.0000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6335  Chloride channel core  25.1 
 
 
456 aa  68.2  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2179  voltage-gated chloride channel  28.33 
 
 
528 aa  67.8  0.0000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1147  chloride channel protein EriC  21.96 
 
 
487 aa  67.4  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.433892  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0159  chloride channel protein  24.55 
 
 
473 aa  67.4  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00154  chloride channel protein  24.55 
 
 
473 aa  67  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0502549  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3447  Chloride channel core  24.55 
 
 
473 aa  67  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0350  voltage gated chloride channel family protein  25.4 
 
 
451 aa  67  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.973552  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3504  chloride channel protein  24.55 
 
 
473 aa  67  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17992  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0165  chloride channel protein  24.55 
 
 
473 aa  66.6  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0160  chloride channel protein  24.55 
 
 
473 aa  67  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0167  chloride channel protein  24.55 
 
 
473 aa  66.6  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00153  hypothetical protein  24.55 
 
 
473 aa  67  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0410723  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4200  Cl- channel, voltage gated  30 
 
 
439 aa  67  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.419413  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4427  Cl- channel, voltage-gated family protein  30 
 
 
439 aa  67  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.292219 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4266  Cl- channel, voltage-gated family protein  30 
 
 
439 aa  67  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal  0.948351 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0147  chloride channel protein  24.35 
 
 
473 aa  65.9  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  23.43 
 
 
577 aa  65.5  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0509  Cl- channel, voltage gated  24.83 
 
 
518 aa  65.1  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0948  chloride channel core  24.83 
 
 
520 aa  65.1  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1891  chloride channel protein EriC  24.73 
 
 
534 aa  65.1  0.000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  8.85971e-16 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0988  Cl- channel, voltage-gated family protein  24.83 
 
 
518 aa  65.1  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170879  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  22.25 
 
 
598 aa  64.7  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1059  Chloride channel core  24.54 
 
 
474 aa  64.7  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1107  voltage-gated chloride channel family protein  30.86 
 
 
510 aa  64.3  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2944  Cl- channel, voltage-gated family protein  20.77 
 
 
526 aa  64.3  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0120087  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1588  Cl- channel, voltage gated  25 
 
 
539 aa  63.9  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000108225  normal  0.782392 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  30.82 
 
 
519 aa  63.9  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6367  Chloride channel core  25.11 
 
 
441 aa  64.3  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4138  Chloride channel core  30.92 
 
 
455 aa  63.2  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0449  Chloride channel core  30.64 
 
 
428 aa  63.5  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0487186  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1059  Chloride channel core  22.12 
 
 
625 aa  63.2  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  22.45 
 
 
589 aa  63.5  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0845  chloride channel protein EriC  37.09 
 
 
512 aa  63.2  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3829  chloride channel core  30.92 
 
 
455 aa  63.2  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2283  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  23.39 
 
 
591 aa  63.2  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0919  chloride channel, putative  23.86 
 
 
624 aa  63.2  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.870319  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  23.46 
 
 
591 aa  62.8  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1184  Chloride channel core  25.71 
 
 
628 aa  62.8  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0945746  normal  0.895336 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0552  Cl- channel, voltage-gated family protein  25.32 
 
 
437 aa  62  0.00000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0189  chloride channel, core  28.29 
 
 
445 aa  60.5  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2411  chloride channel core  24.1 
 
 
517 aa  60.8  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1576  chloride channel protein  31.29 
 
 
463 aa  60.8  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.803836 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>