More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0988 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0948  chloride channel core  94.62 
 
 		 520 aa  910    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3029  chloride channel (ClC) family protein  81.84 
 
 		 578 aa  699    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2109  voltage gated chloride channel family protein  81.61 
 
 		 551 aa  715    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.732554  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1059  Chloride channel core  76.09 
 
 		 474 aa  665    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3062  voltage gated chloride channel family protein  81.84 
 
 		 576 aa  707    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0860  chloride channel core  84.13 
 
 		 565 aa  796    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.442414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4091  Cl- channel, voltage gated  89 
 
 		 513 aa  809    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0815105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0803  chloride channel (ClC) family protein  81.61 
 
 		 576 aa  715    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.781584  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1573  voltage gated chloride channel family protein  80.54 
 
 		 563 aa  714    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.556285  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1977  chloride channel (ClC) family protein  81.61 
 
 		 560 aa  716    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0509  Cl- channel, voltage gated  100 
 
 		 518 aa  1016    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2411  chloride channel core  84.75 
 
 		 517 aa  794    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0848  Cl- channel, voltage-gated family protein  86.83 
 
 		 521 aa  815    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.17126  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2964  voltage gated chloride channel family protein  81.84 
 
 		 562 aa  699    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0988  Cl- channel, voltage-gated family protein  100 
 
 		 518 aa  1016    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170879  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2635  chloride channel (ClC) family protein  81.61 
 
 		 560 aa  716    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0660  chloride channel core  75.65 
 
 		 485 aa  631  1e-179  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5024  chloride channel core  70.5 
 
 		 435 aa  545  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.283632  normal  0.200334 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2667  putative chloride-channel protein  69.06 
 
 		 447 aa  546  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6367  Chloride channel core  67.93 
 
 		 441 aa  525  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6573  Cl- channel, voltage gated  66.67 
 
 		 439 aa  524  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.939375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3866  Chloride channel core  65.13 
 
 		 435 aa  499  1e-140  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3980  Chloride channel core  65.13 
 
 		 435 aa  499  1e-140  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0608  Chloride channel core  45.76 
 
 		 468 aa  330  4e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.277563  hitchhiker  0.00926023 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0110  voltage gated chloride channel family protein  45.81 
 
 		 485 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0419274  hitchhiker  0.00996162 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1155  Cl- channel, voltage gated  44.47 
 
 		 440 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.599671  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3760  chloride channel core  46.01 
 
 		 459 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.503672  normal  0.147153 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6335  Chloride channel core  45.12 
 
 		 456 aa  299  8e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0697  Cl- channel, voltage gated  44.95 
 
 		 439 aa  294  2e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0773  Chloride channel core  44.47 
 
 		 444 aa  293  6e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.80393  normal  0.191961 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4712  Cl- channel, voltage-gated family protein  42.67 
 
 		 470 aa  293  7e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4474  Chloride channel core  44.25 
 
 		 424 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.125667  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3820  Cl- channel, voltage-gated family protein  43.66 
 
 		 454 aa  285  2.0000000000000002e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0706898  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5838  chloride channel core  44.55 
 
 		 485 aa  281  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.697782 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3157  chloride channel core  45.92 
 
 		 441 aa  280  4e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.236304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1046  Cl- channel, voltage gated  42.65 
 
 		 449 aa  280  6e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.0017165  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7107  Chloride channel core  43.13 
 
 		 447 aa  279  7e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.134894 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3481  Chloride channel core  45.92 
 
 		 441 aa  278  2e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.429207  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5971  Chloride channel core  42.14 
 
 		 447 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306058  normal  0.236498 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3959  voltage-gated chloride channel family protein  42.86 
 
 		 453 aa  274  3e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.536311 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3825  Chloride channel core  41.88 
 
 		 447 aa  274  3e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4258  Chloride channel core  43.96 
 
 		 445 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04784  chloride channel  41.49 
 
 		 464 aa  273  5.000000000000001e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147054  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3353  Chloride channel core  44.73 
 
 		 441 aa  273  7e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1867  chloride channel, core  42.86 
 
 		 453 aa  273  7e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.144395 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6686  Chloride channel core  46.39 
 
 		 438 aa  272  8.000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.709238  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0350  voltage gated chloride channel family protein  40.95 
 
 		 451 aa  272  1e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.973552  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0318  voltage gated chloride channel family protein  40.95 
 
 		 490 aa  271  2e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1380  Chloride channel core  42.93 
 
 		 523 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.332238  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3051  chloride channel core  40.32 
 
 		 449 aa  271  2.9999999999999997e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156315  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5405  Chloride channel core  45.95 
 
 		 437 aa  268  1e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0213924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6166  chloride channel core  46.17 
 
 		 438 aa  266  8e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0747104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1139  chloride channel protein  41.88 
 
 		 440 aa  266  8.999999999999999e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0957  chloride channel core  41.57 
 
 		 442 aa  263  6.999999999999999e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0796788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5041  putative H(+)/Cl(-) exchange transporter  42.2 
 
 		 445 aa  256  8e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3257  chloride channel core  43.75 
 
 		 446 aa  253  5.000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3037  Cl- channel, voltage-gated family protein  43.67 
 
 		 441 aa  251  2e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1638  Cl- channel, voltage-gated family protein  37.59 
 
 		 436 aa  248  2e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3213  Cl- channel, voltage gated  39.58 
 
 		 522 aa  216  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1500  Cl- channel, voltage gated  37 
 
 		 433 aa  199  9e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3055  Cl- channel, voltage gated  38.66 
 
 		 506 aa  193  7e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.938884  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5803  Cl- channel voltage-gated family protein  34.74 
 
 		 466 aa  172  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0706283  normal  0.393732 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3116  chloride channel protein  33.41 
 
 		 453 aa  169  8e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.958796 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  33.26 
 
 		 569 aa  130  6e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  32.08 
 
 		 859 aa  127  7e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  29.89 
 
 		 473 aa  121  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  29.89 
 
 		 473 aa  121  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  29.89 
 
 		 473 aa  121  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  29.89 
 
 		 473 aa  121  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  29.89 
 
 		 473 aa  121  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0695  chloride channel protein  29.67 
 
 		 466 aa  119  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.750689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3525  Chloride channel core  31.68 
 
 		 533 aa  117  6e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2944  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.89 
 
 		 526 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0120087  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  31.57 
 
 		 863 aa  115  3e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  28.14 
 
 		 519 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  26.92 
 
 		 519 aa  111  3e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0782  chloride channel protein  28.64 
 
 		 479 aa  111  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.12239 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3102  chloride channel protein  31.14 
 
 		 471 aa  111  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1147  chloride channel protein EriC  31.23 
 
 		 487 aa  109  1e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.433892  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3458  chloride channel protein  28.99 
 
 		 478 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.41349  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3329  chloride channel protein  28.99 
 
 		 478 aa  109  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A25  chloride channel protein EriC  28.86 
 
 		 510 aa  108  2e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0993  chloride channel protein  28.99 
 
 		 478 aa  108  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2810  chloride channel protein  31.65 
 
 		 472 aa  108  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14511  chloride channel  29.95 
 
 		 455 aa  108  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  30.82 
 
 		 862 aa  107  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1662  voltage-gated chloride channel family protein  27.32 
 
 		 523 aa  102  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  30.28 
 
 		 897 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1576  chloride channel protein  30.39 
 
 		 463 aa  102  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.803836 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1400  chloride channel protein  27.32 
 
 		 523 aa  102  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.340394  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0681  Chloride channel core  22.96 
 
 		 538 aa  101  3e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  32.15 
 
 		 863 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  29.98 
 
 		 626 aa  101  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4719  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.58 
 
 		 439 aa  101  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0757  Chloride channel core  28.04 
 
 		 528 aa  101  4e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.937422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1830  chloride channel protein EriC  29.97 
 
 		 512 aa  100  4e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.116382  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4427  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.85 
 
 		 439 aa  99.8  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.292219 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4200  Cl- channel, voltage gated  30.85 
 
 		 439 aa  99.8  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.419413  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4266  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.85 
 
 		 439 aa  99.8  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal  0.948351 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2188  Chloride channel core  29.3 
 
 		 563 aa  97.8  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000751746  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>