More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0449 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0449  Chloride channel core  100 
 
 
428 aa  829    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0487186  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A25  chloride channel protein EriC  32.41 
 
 
510 aa  217  2.9999999999999998e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2944  Cl- channel, voltage-gated family protein  35.43 
 
 
526 aa  210  3e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0120087  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1107  voltage-gated chloride channel family protein  33.49 
 
 
510 aa  203  5e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1662  voltage-gated chloride channel family protein  34.87 
 
 
523 aa  196  6e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1830  chloride channel protein EriC  38.16 
 
 
512 aa  196  6e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.116382  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1400  chloride channel protein  35.11 
 
 
523 aa  196  9e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.340394  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  33.33 
 
 
519 aa  195  1e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2188  Chloride channel core  34.58 
 
 
563 aa  195  2e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000751746  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  33.16 
 
 
519 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1147  chloride channel protein EriC  33.5 
 
 
487 aa  176  9e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.433892  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2179  voltage-gated chloride channel  31.71 
 
 
528 aa  175  9.999999999999999e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1891  chloride channel protein EriC  29.79 
 
 
534 aa  174  1.9999999999999998e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  8.85971e-16 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0845  chloride channel protein EriC  35.07 
 
 
512 aa  170  4e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0757  Chloride channel core  32.34 
 
 
528 aa  170  5e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.937422  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0681  Chloride channel core  34.54 
 
 
538 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0386  chloride channel protein EriC  32.21 
 
 
457 aa  165  1.0000000000000001e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000543407 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0762  chloride channel core  31.97 
 
 
518 aa  164  3e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000775923  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0695  chloride channel protein  30.19 
 
 
466 aa  161  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.750689  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0391  chloride channel, core  31.81 
 
 
516 aa  161  2e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000201773  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  30.64 
 
 
473 aa  160  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  31.48 
 
 
473 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  31.48 
 
 
473 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  31.48 
 
 
473 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  31.48 
 
 
473 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3525  Chloride channel core  31.95 
 
 
533 aa  157  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3102  chloride channel protein  27.89 
 
 
471 aa  157  4e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1576  chloride channel protein  29.12 
 
 
463 aa  155  2e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.803836 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0459  chloride channel protein  31.81 
 
 
468 aa  153  5.9999999999999996e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.511438  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0189  chloride channel, core  27.82 
 
 
445 aa  150  6e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000478  H(+)/Cl(-) exchange transporter ClcA  32.03 
 
 
467 aa  146  5e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.791443  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0118  chloride transporter, ClC family  29.06 
 
 
455 aa  147  5e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2176  chloride channel protein  31.01 
 
 
466 aa  146  7.0000000000000006e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.462447  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0782  chloride channel protein  28 
 
 
479 aa  145  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.12239 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0866  chloride channel protein  29.95 
 
 
470 aa  144  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0280286  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3329  chloride channel protein  29.37 
 
 
478 aa  142  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0993  chloride channel protein  29.37 
 
 
478 aa  142  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3458  chloride channel protein  29.37 
 
 
478 aa  142  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.41349  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0159  chloride channel protein  33.01 
 
 
473 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3504  chloride channel protein  33.01 
 
 
473 aa  140  6e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17992  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00154  chloride channel protein  33.01 
 
 
473 aa  140  6e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0502549  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3447  Chloride channel core  33.01 
 
 
473 aa  140  6e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0160  chloride channel protein  33.01 
 
 
473 aa  140  6e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00153  hypothetical protein  33.01 
 
 
473 aa  140  6e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0410723  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0165  chloride channel protein  32.77 
 
 
473 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0167  chloride channel protein  32.77 
 
 
473 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0212  chloride channel protein  30.88 
 
 
456 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0147  chloride channel protein  32.77 
 
 
473 aa  138  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  32.04 
 
 
863 aa  137  4e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1346  chloride channel protein  27.29 
 
 
527 aa  133  6e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4719  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.06 
 
 
439 aa  133  6e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0552  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.55 
 
 
437 aa  133  7.999999999999999e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06233  chloride channel protein  32.38 
 
 
468 aa  131  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2810  chloride channel protein  26.8 
 
 
472 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2366  Cl- channel voltage-gated family protein  25.77 
 
 
416 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  32.7 
 
 
859 aa  128  2.0000000000000002e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1588  Cl- channel, voltage gated  31.07 
 
 
539 aa  127  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000108225  normal  0.782392 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  27.57 
 
 
569 aa  126  6e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  30.19 
 
 
897 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2409  Chloride channel core  29.19 
 
 
435 aa  123  5e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  28.41 
 
 
875 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  27.97 
 
 
614 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  27.21 
 
 
863 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0318  Chloride channel core  26.95 
 
 
511 aa  118  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000450379  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6434  Chloride channel core  29.45 
 
 
600 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2009  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.76 
 
 
443 aa  116  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2460  chloride channel core  29.66 
 
 
459 aa  116  8.999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11718  normal  0.460638 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4266  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.85 
 
 
439 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal  0.948351 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3026  chloride channel protein  30.5 
 
 
436 aa  115  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.139269  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4200  Cl- channel, voltage gated  29.85 
 
 
439 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.419413  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4427  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.85 
 
 
439 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.292219 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  30.84 
 
 
862 aa  114  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  27.65 
 
 
613 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2509  chloride channel protein  29.97 
 
 
455 aa  110  7.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.61 
 
 
587 aa  109  8.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.49 
 
 
582 aa  108  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2437  chloride channel core  28.94 
 
 
629 aa  107  5e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.276438  normal  0.470563 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0630  Chloride channel core  30.49 
 
 
475 aa  105  1e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1638  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.34 
 
 
436 aa  105  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1448  Chloride channel core  30.81 
 
 
627 aa  105  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.132053  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  28.1 
 
 
626 aa  104  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3829  chloride channel core  27.83 
 
 
455 aa  104  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4402  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.17 
 
 
598 aa  104  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0824696  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  27.9 
 
 
584 aa  103  6e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4138  Chloride channel core  27.83 
 
 
455 aa  103  8e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1155  Cl- channel, voltage gated  29.44 
 
 
440 aa  102  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.599671  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3436  Chloride channel core  27.74 
 
 
879 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2680  Chloride channel core  27.74 
 
 
879 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  30.12 
 
 
608 aa  101  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  30.52 
 
 
669 aa  102  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1697  chloride channel protein  27.87 
 
 
427 aa  100  5e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4507  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.74 
 
 
594 aa  100  7e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1698  chloride channel protein  26.85 
 
 
427 aa  99.8  8e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0583  Chloride channel core  29.35 
 
 
462 aa  99.8  1e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5126  Chloride channel core  29.48 
 
 
455 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.967493 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  28.65 
 
 
615 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2446  chloride channel core  28.66 
 
 
603 aa  98.6  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  23.29 
 
 
470 aa  96.7  8e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1639  Cl- channel voltage-gated family protein  27.83 
 
 
597 aa  95.9  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  27.4 
 
 
606 aa  95.5  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>