More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2460 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2460  chloride channel core  100 
 
 
459 aa  873    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11718  normal  0.460638 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5126  Chloride channel core  48.98 
 
 
455 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.967493 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4138  Chloride channel core  45.85 
 
 
455 aa  310  4e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3829  chloride channel core  46.33 
 
 
455 aa  307  3e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  40.85 
 
 
473 aa  279  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  41.32 
 
 
473 aa  279  7e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  40.85 
 
 
473 aa  279  8e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  40.85 
 
 
473 aa  279  8e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  40.85 
 
 
473 aa  279  8e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3102  chloride channel protein  42.29 
 
 
471 aa  277  4e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0459  chloride channel protein  42.73 
 
 
468 aa  268  2e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.511438  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0695  chloride channel protein  39.81 
 
 
466 aa  266  4e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.750689  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0782  chloride channel protein  41.89 
 
 
479 aa  265  1e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.12239 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1576  chloride channel protein  41.88 
 
 
463 aa  265  1e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.803836 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0866  chloride channel protein  40.57 
 
 
470 aa  261  2e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0280286  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1698  chloride channel protein  40.28 
 
 
427 aa  255  1.0000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1697  chloride channel protein  40.52 
 
 
427 aa  254  2.0000000000000002e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3329  chloride channel protein  41.12 
 
 
478 aa  252  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0993  chloride channel protein  41.12 
 
 
478 aa  252  1e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3458  chloride channel protein  41.12 
 
 
478 aa  252  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.41349  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2810  chloride channel protein  43.22 
 
 
472 aa  241  2.9999999999999997e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000478  H(+)/Cl(-) exchange transporter ClcA  38.38 
 
 
467 aa  240  2.9999999999999997e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.791443  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0212  chloride channel protein  38.29 
 
 
456 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2176  chloride channel protein  37.36 
 
 
466 aa  229  6e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.462447  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3525  Chloride channel core  39.15 
 
 
533 aa  229  1e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06233  chloride channel protein  35.46 
 
 
468 aa  215  9.999999999999999e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0165  chloride channel protein  37.69 
 
 
473 aa  213  7.999999999999999e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0167  chloride channel protein  37.69 
 
 
473 aa  213  7.999999999999999e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00154  chloride channel protein  37.69 
 
 
473 aa  212  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0502549  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3447  Chloride channel core  37.69 
 
 
473 aa  212  1e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0160  chloride channel protein  37.69 
 
 
473 aa  212  1e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3504  chloride channel protein  37.69 
 
 
473 aa  212  1e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17992  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00153  hypothetical protein  37.69 
 
 
473 aa  212  1e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0410723  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  33.7 
 
 
519 aa  212  1e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  33.25 
 
 
519 aa  212  1e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0159  chloride channel protein  37.47 
 
 
473 aa  212  1e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0147  chloride channel protein  37.47 
 
 
473 aa  211  2e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1588  Cl- channel, voltage gated  42.93 
 
 
539 aa  201  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000108225  normal  0.782392 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A25  chloride channel protein EriC  31.44 
 
 
510 aa  201  1.9999999999999998e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2944  Cl- channel, voltage-gated family protein  35 
 
 
526 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0120087  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1830  chloride channel protein EriC  30.54 
 
 
512 aa  186  8e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.116382  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2409  Chloride channel core  38.19 
 
 
435 aa  182  1e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1107  voltage-gated chloride channel family protein  32.03 
 
 
510 aa  178  2e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4200  Cl- channel, voltage gated  36.95 
 
 
439 aa  176  6e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.419413  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4427  Cl- channel, voltage-gated family protein  36.95 
 
 
439 aa  176  6e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.292219 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4266  Cl- channel, voltage-gated family protein  36.95 
 
 
439 aa  176  6e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal  0.948351 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2509  chloride channel protein  37.76 
 
 
455 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3026  chloride channel protein  40.49 
 
 
436 aa  175  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.139269  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2009  Cl- channel, voltage-gated family protein  39 
 
 
443 aa  171  4e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1147  chloride channel protein EriC  33.74 
 
 
487 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.433892  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1662  voltage-gated chloride channel family protein  33.15 
 
 
523 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1400  chloride channel protein  33.15 
 
 
523 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.340394  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4719  Cl- channel, voltage-gated family protein  36.26 
 
 
439 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0391  chloride channel, core  30.52 
 
 
516 aa  164  4.0000000000000004e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000201773  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0552  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.39 
 
 
437 aa  161  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1891  chloride channel protein EriC  29.1 
 
 
534 aa  162  2e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  8.85971e-16 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0845  chloride channel protein EriC  33.81 
 
 
512 aa  158  2e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0762  chloride channel core  31.47 
 
 
518 aa  157  3e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000775923  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2188  Chloride channel core  24.89 
 
 
563 aa  156  7e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000751746  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  31.44 
 
 
863 aa  151  2e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0386  chloride channel protein EriC  29.77 
 
 
457 aa  150  5e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000543407 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  33.52 
 
 
859 aa  149  1.0000000000000001e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0757  Chloride channel core  30.1 
 
 
528 aa  148  2.0000000000000003e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.937422  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0681  Chloride channel core  26.98 
 
 
538 aa  146  7.0000000000000006e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  34.17 
 
 
875 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0189  chloride channel, core  26.95 
 
 
445 aa  140  6e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0449  Chloride channel core  28.09 
 
 
428 aa  139  8.999999999999999e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0487186  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  33.64 
 
 
863 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  33.42 
 
 
862 aa  133  6e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  33.17 
 
 
897 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2179  voltage-gated chloride channel  30.79 
 
 
528 aa  131  3e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  33.49 
 
 
615 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0318  Chloride channel core  33.57 
 
 
511 aa  127  6e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000450379  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1622  Cl- channel, voltage-gated family protein  32.65 
 
 
754 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3436  Chloride channel core  32.62 
 
 
879 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2680  Chloride channel core  32.62 
 
 
879 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0546  Cl- channel, voltage gated  30.41 
 
 
559 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1346  chloride channel protein  31.47 
 
 
527 aa  119  9.999999999999999e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2144  Cl- channel voltage-gated family protein  31.83 
 
 
604 aa  116  1.0000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  27.05 
 
 
470 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  27.3 
 
 
613 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  31.92 
 
 
569 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  28.13 
 
 
608 aa  114  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  26.84 
 
 
614 aa  113  6e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0118  chloride transporter, ClC family  33.15 
 
 
455 aa  113  6e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1588  CBS  31.42 
 
 
859 aa  113  7.000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.497223  normal  0.185787 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6434  Chloride channel core  32.69 
 
 
600 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.3 
 
 
593 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1638  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.61 
 
 
436 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  28.41 
 
 
606 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.53 
 
 
598 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.3 
 
 
593 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.75 
 
 
589 aa  111  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  31.97 
 
 
626 aa  109  8.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.53 
 
 
589 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.53 
 
 
591 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6342  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.27 
 
 
589 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867968  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1737  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.27 
 
 
589 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.26 
 
 
582 aa  107  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.89 
 
 
587 aa  107  4e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>