More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4200 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_4427  Cl- channel, voltage-gated family protein  100 
 
 
439 aa  841    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.292219 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4200  Cl- channel, voltage gated  100 
 
 
439 aa  841    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.419413  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4266  Cl- channel, voltage-gated family protein  100 
 
 
439 aa  841    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal  0.948351 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4719  Cl- channel, voltage-gated family protein  65.43 
 
 
439 aa  492  9.999999999999999e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2009  Cl- channel, voltage-gated family protein  62.76 
 
 
443 aa  437  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0552  Cl- channel, voltage-gated family protein  37.56 
 
 
437 aa  266  5e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2409  Chloride channel core  41.75 
 
 
435 aa  237  4e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3525  Chloride channel core  38.82 
 
 
533 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  34.71 
 
 
519 aa  213  4.9999999999999996e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1576  chloride channel protein  35.08 
 
 
463 aa  211  2e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.803836 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  34.44 
 
 
519 aa  209  7e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A25  chloride channel protein EriC  31.06 
 
 
510 aa  181  2e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0459  chloride channel protein  35.2 
 
 
468 aa  180  4e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.511438  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1698  chloride channel protein  32.4 
 
 
427 aa  176  8e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  32.3 
 
 
473 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  32.94 
 
 
473 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  32.94 
 
 
473 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  32.94 
 
 
473 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  32.3 
 
 
473 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3102  chloride channel protein  34.43 
 
 
471 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2944  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.08 
 
 
526 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0120087  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4138  Chloride channel core  34.23 
 
 
455 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3829  chloride channel core  34.23 
 
 
455 aa  172  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1697  chloride channel protein  32.4 
 
 
427 aa  172  2e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5126  Chloride channel core  32.96 
 
 
455 aa  171  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.967493 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0212  chloride channel protein  30.65 
 
 
456 aa  169  7e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3026  chloride channel protein  39.95 
 
 
436 aa  169  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.139269  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2810  chloride channel protein  33.8 
 
 
472 aa  167  5e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0866  chloride channel protein  33.08 
 
 
470 aa  166  5e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0280286  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1830  chloride channel protein EriC  31.02 
 
 
512 aa  166  9e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.116382  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0782  chloride channel protein  32.39 
 
 
479 aa  164  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.12239 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000478  H(+)/Cl(-) exchange transporter ClcA  34.74 
 
 
467 aa  164  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.791443  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2176  chloride channel protein  33.61 
 
 
466 aa  164  4.0000000000000004e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.462447  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1588  Cl- channel, voltage gated  37.94 
 
 
539 aa  163  7e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000108225  normal  0.782392 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0762  chloride channel core  30.05 
 
 
518 aa  162  9e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000775923  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2188  Chloride channel core  33.51 
 
 
563 aa  162  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000751746  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2460  chloride channel core  37.85 
 
 
459 aa  159  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11718  normal  0.460638 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0695  chloride channel protein  29.93 
 
 
466 aa  155  9e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.750689  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0757  Chloride channel core  29.09 
 
 
528 aa  154  2.9999999999999998e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.937422  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1662  voltage-gated chloride channel family protein  34.15 
 
 
523 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1400  chloride channel protein  34.15 
 
 
523 aa  153  5e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.340394  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1107  voltage-gated chloride channel family protein  30.02 
 
 
510 aa  151  2e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0993  chloride channel protein  30.47 
 
 
478 aa  151  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3458  chloride channel protein  30.47 
 
 
478 aa  151  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.41349  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3329  chloride channel protein  30.47 
 
 
478 aa  151  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06233  chloride channel protein  32.63 
 
 
468 aa  150  4e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0681  Chloride channel core  29 
 
 
538 aa  150  4e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2509  chloride channel protein  36.55 
 
 
455 aa  150  5e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0386  chloride channel protein EriC  31 
 
 
457 aa  147  3e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000543407 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  31.28 
 
 
863 aa  142  9.999999999999999e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0391  chloride channel, core  30.07 
 
 
516 aa  140  6e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000201773  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1147  chloride channel protein EriC  33.42 
 
 
487 aa  139  1e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.433892  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0159  chloride channel protein  33.24 
 
 
473 aa  137  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00154  chloride channel protein  32.97 
 
 
473 aa  136  8e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0502549  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3447  Chloride channel core  32.97 
 
 
473 aa  136  8e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0167  chloride channel protein  32.97 
 
 
473 aa  136  8e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0160  chloride channel protein  32.97 
 
 
473 aa  136  8e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00153  hypothetical protein  32.97 
 
 
473 aa  136  8e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0410723  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3504  chloride channel protein  32.97 
 
 
473 aa  136  8e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17992  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0165  chloride channel protein  32.97 
 
 
473 aa  136  8e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  31.64 
 
 
569 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0147  chloride channel protein  32.88 
 
 
473 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0433  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.68 
 
 
575 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.346865  normal  0.0128311 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1891  chloride channel protein EriC  27.97 
 
 
534 aa  130  3e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  8.85971e-16 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  34.68 
 
 
875 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  34.63 
 
 
863 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0189  chloride channel, core  27.33 
 
 
445 aa  124  2e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  31.03 
 
 
859 aa  121  3e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2179  voltage-gated chloride channel  27.7 
 
 
528 aa  121  3e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3051  chloride channel core  31.18 
 
 
449 aa  120  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156315  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6434  Chloride channel core  30.07 
 
 
600 aa  120  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0845  chloride channel protein EriC  28.6 
 
 
512 aa  120  4.9999999999999996e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0358  Cl- channel, voltage gated  32.46 
 
 
575 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  30.24 
 
 
584 aa  117  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0449  Chloride channel core  29.97 
 
 
428 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0487186  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18351  putative chloride channel  28.92 
 
 
452 aa  117  5e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0318  voltage gated chloride channel family protein  30.98 
 
 
490 aa  117  5e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0350  voltage gated chloride channel family protein  30.98 
 
 
451 aa  117  6e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.973552  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0608  Chloride channel core  29.89 
 
 
468 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.277563  hitchhiker  0.00926023 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0318  Chloride channel core  31.08 
 
 
511 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000450379  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1638  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.13 
 
 
436 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29991  putative chloride channel  28.6 
 
 
450 aa  114  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.593355 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  27.85 
 
 
615 aa  114  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2543  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.34 
 
 
591 aa  114  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.232119  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  30.57 
 
 
626 aa  113  6e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2437  chloride channel core  31.88 
 
 
629 aa  112  9e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.276438  normal  0.470563 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.05 
 
 
582 aa  113  9e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0773  Chloride channel core  32.29 
 
 
444 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.80393  normal  0.191961 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1794  putative chloride channel  28.53 
 
 
452 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18921  putative chloride channel  27.38 
 
 
452 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  30.19 
 
 
470 aa  111  3e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3300  Cl- channel, voltage gated  30.65 
 
 
585 aa  111  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0616826  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0546  Cl- channel, voltage gated  23.86 
 
 
559 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.05 
 
 
579 aa  110  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.05 
 
 
579 aa  110  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.05 
 
 
579 aa  110  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.05 
 
 
636 aa  110  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  34.25 
 
 
897 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.02 
 
 
593 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.02 
 
 
593 aa  109  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>