More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1662 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1662  voltage-gated chloride channel family protein  100 
 
 		 523 aa  1015    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1400  chloride channel protein  99.43 
 
 		 523 aa  1010    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.340394  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  46.38 
 
 		 519 aa  458  1e-127  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  46.38 
 
 		 519 aa  454  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2944  Cl- channel, voltage-gated family protein  48.61 
 
 		 526 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0120087  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0762  chloride channel core  43.73 
 
 		 518 aa  381  1e-104  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000775923  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1830  chloride channel protein EriC  44.8 
 
 		 512 aa  365  1e-99  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.116382  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A25  chloride channel protein EriC  40.4 
 
 		 510 aa  358  9.999999999999999e-98  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2188  Chloride channel core  40.35 
 
 		 563 aa  352  8.999999999999999e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000751746  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0757  Chloride channel core  41.01 
 
 		 528 aa  338  9.999999999999999e-92  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.937422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0681  Chloride channel core  39.01 
 
 		 538 aa  324  2e-87  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2179  voltage-gated chloride channel  35.85 
 
 		 528 aa  320  5e-86  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0391  chloride channel, core  36.72 
 
 		 516 aa  316  8e-85  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000201773  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1346  chloride channel protein  37.67 
 
 		 527 aa  315  9.999999999999999e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1107  voltage-gated chloride channel family protein  35.8 
 
 		 510 aa  308  1.0000000000000001e-82  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1588  Cl- channel, voltage gated  43.61 
 
 		 539 aa  302  1e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000108225  normal  0.782392 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1891  chloride channel protein EriC  34.48 
 
 		 534 aa  301  1e-80  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.85971e-16 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0845  chloride channel protein EriC  38.24 
 
 		 512 aa  293  5e-78  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1147  chloride channel protein EriC  39.47 
 
 		 487 aa  278  2e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.433892  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3525  Chloride channel core  34.4 
 
 		 533 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0118  chloride transporter, ClC family  37.42 
 
 		 455 aa  238  2e-61  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0386  chloride channel protein EriC  38.29 
 
 		 457 aa  236  6e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000543407 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0189  chloride channel, core  34.7 
 
 		 445 aa  230  4e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3102  chloride channel protein  33.95 
 
 		 471 aa  219  1e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  32.15 
 
 		 473 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  34.28 
 
 		 473 aa  210  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  34.28 
 
 		 473 aa  210  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  34.28 
 
 		 473 aa  210  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  34.28 
 
 		 473 aa  210  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0449  Chloride channel core  37.96 
 
 		 428 aa  202  9e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0487186  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0695  chloride channel protein  33.77 
 
 		 466 aa  202  9.999999999999999e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.750689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2409  Chloride channel core  34.06 
 
 		 435 aa  197  5.000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0318  Chloride channel core  35.66 
 
 		 511 aa  192  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000450379  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0782  chloride channel protein  31.7 
 
 		 479 aa  190  5.999999999999999e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.12239 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1576  chloride channel protein  31.33 
 
 		 463 aa  189  1e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.803836 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0552  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.44 
 
 		 437 aa  181  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3458  chloride channel protein  35.47 
 
 		 478 aa  179  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.41349  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0993  chloride channel protein  35.47 
 
 		 478 aa  179  1e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4719  Cl- channel, voltage-gated family protein  32 
 
 		 439 aa  179  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3329  chloride channel protein  35.47 
 
 		 478 aa  179  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2366  Cl- channel voltage-gated family protein  30.71 
 
 		 416 aa  175  1.9999999999999998e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0212  chloride channel protein  32.9 
 
 		 456 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0866  chloride channel protein  32.92 
 
 		 470 aa  172  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0280286  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  33.33 
 
 		 859 aa  170  7e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0459  chloride channel protein  33.95 
 
 		 468 aa  166  6.9999999999999995e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.511438  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2176  chloride channel protein  33.81 
 
 		 466 aa  166  1.0000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.462447  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4427  Cl- channel, voltage-gated family protein  32.68 
 
 		 439 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.292219 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4266  Cl- channel, voltage-gated family protein  32.68 
 
 		 439 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal  0.948351 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4200  Cl- channel, voltage gated  32.68 
 
 		 439 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.419413  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2810  chloride channel protein  31.84 
 
 		 472 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5126  Chloride channel core  32.35 
 
 		 455 aa  163  8.000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.967493 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2009  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.98 
 
 		 443 aa  162  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.482502 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00154  chloride channel protein  31.12 
 
 		 473 aa  158  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0502549  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3447  Chloride channel core  31.12 
 
 		 473 aa  158  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3504  chloride channel protein  31.12 
 
 		 473 aa  158  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0167  chloride channel protein  31.12 
 
 		 473 aa  158  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0160  chloride channel protein  31.12 
 
 		 473 aa  158  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4138  Chloride channel core  31.61 
 
 		 455 aa  158  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0165  chloride channel protein  31.12 
 
 		 473 aa  158  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00153  hypothetical protein  31.12 
 
 		 473 aa  158  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0410723  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  32.14 
 
 		 862 aa  157  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0159  chloride channel protein  30.87 
 
 		 473 aa  157  4e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0147  chloride channel protein  32.65 
 
 		 473 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3829  chloride channel core  31.86 
 
 		 455 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1698  chloride channel protein  31.65 
 
 		 427 aa  156  8e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1697  chloride channel protein  31.65 
 
 		 427 aa  156  1e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  31.96 
 
 		 863 aa  154  2.9999999999999998e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2460  chloride channel core  32.52 
 
 		 459 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11718  normal  0.460638 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  31.54 
 
 		 584 aa  153  7e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000478  H(+)/Cl(-) exchange transporter ClcA  30.41 
 
 		 467 aa  153  8.999999999999999e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.791443  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  29.61 
 
 		 569 aa  152  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3026  chloride channel protein  36.11 
 
 		 436 aa  147  5e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.139269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1638  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.32 
 
 		 436 aa  146  7.0000000000000006e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2509  chloride channel protein  36.99 
 
 		 455 aa  145  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0546  Cl- channel, voltage gated  28.09 
 
 		 559 aa  144  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18921  putative chloride channel  32.02 
 
 		 452 aa  140  6e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.708029  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3116  chloride channel protein  29.26 
 
 		 453 aa  136  8e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.958796 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18921  putative chloride channel  30.73 
 
 		 452 aa  134  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4624  voltage-gated chloride channel  33.12 
 
 		 574 aa  134  3.9999999999999996e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.69 
 
 		 582 aa  134  3.9999999999999996e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1794  putative chloride channel  29.05 
 
 		 452 aa  134  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06233  chloride channel protein  30.07 
 
 		 468 aa  134  5e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  29.77 
 
 		 875 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19111  putative chloride channel  28.82 
 
 		 452 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  31.79 
 
 		 608 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  32.04 
 
 		 897 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.29 
 
 		 587 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  33.06 
 
 		 863 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  27.47 
 
 		 470 aa  126  8.000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  26.71 
 
 		 598 aa  126  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.83 
 
 		 579 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.83 
 
 		 579 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.83 
 
 		 636 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.83 
 
 		 579 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.53 
 
 		 628 aa  125  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.11 
 
 		 589 aa  124  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  28.6 
 
 		 669 aa  124  6e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1139  chloride channel protein  31.84 
 
 		 440 aa  122  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1352  Cl- channel, voltage gated  28.85 
 
 		 577 aa  123  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  27.43 
 
 		 606 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>