More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1139 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1139  chloride channel protein  100 
 
 		 440 aa  853    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0773  Chloride channel core  69.54 
 
 		 444 aa  532  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.80393  normal  0.191961 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7107  Chloride channel core  68.64 
 
 		 447 aa  523  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.134894 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5971  Chloride channel core  69.32 
 
 		 447 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306058  normal  0.236498 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0350  voltage gated chloride channel family protein  63.24 
 
 		 451 aa  504  1e-141  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.973552  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0318  voltage gated chloride channel family protein  63.24 
 
 		 490 aa  503  1e-141  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3051  chloride channel core  62.33 
 
 		 449 aa  498  1e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156315  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1046  Cl- channel, voltage gated  61.47 
 
 		 449 aa  478  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.0017165  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3037  Cl- channel, voltage-gated family protein  57.97 
 
 		 441 aa  402  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4474  Chloride channel core  49.75 
 
 		 424 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.125667  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0957  chloride channel core  48.64 
 
 		 442 aa  323  4e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0796788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5041  putative H(+)/Cl(-) exchange transporter  50.46 
 
 		 445 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5405  Chloride channel core  48.84 
 
 		 437 aa  312  6.999999999999999e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0213924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3353  Chloride channel core  48.99 
 
 		 441 aa  309  8e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3481  Chloride channel core  48.76 
 
 		 441 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.429207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4258  Chloride channel core  49.76 
 
 		 445 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3157  chloride channel core  48.53 
 
 		 441 aa  301  2e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.236304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0608  Chloride channel core  46.05 
 
 		 468 aa  301  2e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.277563  hitchhiker  0.00926023 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3760  chloride channel core  47.44 
 
 		 459 aa  294  2e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.503672  normal  0.147153 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1638  Cl- channel, voltage-gated family protein  43.33 
 
 		 436 aa  290  4e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6166  chloride channel core  51.6 
 
 		 438 aa  278  1e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0747104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6686  Chloride channel core  49.6 
 
 		 438 aa  278  1e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.709238  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1059  Chloride channel core  41.76 
 
 		 474 aa  273  3e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0948  chloride channel core  42.15 
 
 		 520 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0509  Cl- channel, voltage gated  42.15 
 
 		 518 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0988  Cl- channel, voltage-gated family protein  42.15 
 
 		 518 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170879  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3959  voltage-gated chloride channel family protein  43.63 
 
 		 453 aa  273  6e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.536311 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1867  chloride channel, core  43.63 
 
 		 453 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.144395 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4091  Cl- channel, voltage gated  41.22 
 
 		 513 aa  268  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0815105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1573  voltage gated chloride channel family protein  40.71 
 
 		 563 aa  266  4e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.556285  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0848  Cl- channel, voltage-gated family protein  40.52 
 
 		 521 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.17126  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04784  chloride channel  43.02 
 
 		 464 aa  264  3e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147054  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0860  chloride channel core  40.52 
 
 		 565 aa  264  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.442414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1380  Chloride channel core  46.15 
 
 		 523 aa  259  6e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.332238  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3980  Chloride channel core  42.63 
 
 		 435 aa  258  2e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3866  Chloride channel core  42.63 
 
 		 435 aa  258  2e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2411  chloride channel core  40.75 
 
 		 517 aa  258  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3825  Chloride channel core  44.89 
 
 		 447 aa  255  9e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0803  chloride channel (ClC) family protein  41.41 
 
 		 576 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.781584  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2109  voltage gated chloride channel family protein  41.41 
 
 		 551 aa  254  3e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.732554  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1977  chloride channel (ClC) family protein  41.41 
 
 		 560 aa  254  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3029  chloride channel (ClC) family protein  41.41 
 
 		 578 aa  254  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2964  voltage gated chloride channel family protein  41.41 
 
 		 562 aa  254  3e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2635  chloride channel (ClC) family protein  41.41 
 
 		 560 aa  254  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3062  voltage gated chloride channel family protein  41.41 
 
 		 576 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2667  putative chloride-channel protein  40.88 
 
 		 447 aa  250  4e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1155  Cl- channel, voltage gated  41.72 
 
 		 440 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.599671  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6367  Chloride channel core  41.15 
 
 		 441 aa  243  5e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0660  chloride channel core  39.72 
 
 		 485 aa  238  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5024  chloride channel core  38.94 
 
 		 435 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.283632  normal  0.200334 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0110  voltage gated chloride channel family protein  42.11 
 
 		 485 aa  233  6e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0419274  hitchhiker  0.00996162 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3820  Cl- channel, voltage-gated family protein  41.22 
 
 		 454 aa  231  3e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0706898  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4712  Cl- channel, voltage-gated family protein  40.82 
 
 		 470 aa  229  6e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6573  Cl- channel, voltage gated  39.23 
 
 		 439 aa  229  7e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.939375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5838  chloride channel core  41.96 
 
 		 485 aa  228  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.697782 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3055  Cl- channel, voltage gated  40.64 
 
 		 506 aa  228  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.938884  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6335  Chloride channel core  40.5 
 
 		 456 aa  228  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1500  Cl- channel, voltage gated  41.55 
 
 		 433 aa  227  3e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0697  Cl- channel, voltage gated  42.2 
 
 		 439 aa  221  3e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3213  Cl- channel, voltage gated  40.51 
 
 		 522 aa  219  5e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3257  chloride channel core  41.3 
 
 		 446 aa  204  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3116  chloride channel protein  32.48 
 
 		 453 aa  180  4e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.958796 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5803  Cl- channel voltage-gated family protein  34.5 
 
 		 466 aa  174  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0706283  normal  0.393732 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2944  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.38 
 
 		 526 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0120087  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  30.84 
 
 		 569 aa  127  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3525  Chloride channel core  31.23 
 
 		 533 aa  124  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1830  chloride channel protein EriC  30.49 
 
 		 512 aa  124  4e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.116382  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2188  Chloride channel core  31.23 
 
 		 563 aa  119  9e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000751746  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1662  voltage-gated chloride channel family protein  31.84 
 
 		 523 aa  116  6e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1400  chloride channel protein  31.84 
 
 		 523 aa  116  8.999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.340394  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3102  chloride channel protein  30.55 
 
 		 471 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  32.73 
 
 		 859 aa  114  3e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0757  Chloride channel core  30.5 
 
 		 528 aa  113  6e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.937422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  26.63 
 
 		 519 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0681  Chloride channel core  26.46 
 
 		 538 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  28.93 
 
 		 473 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  28.93 
 
 		 473 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  31.05 
 
 		 626 aa  110  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  28.93 
 
 		 473 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  28.93 
 
 		 473 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  28.93 
 
 		 473 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0695  chloride channel protein  30.51 
 
 		 466 aa  109  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.750689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  25.84 
 
 		 519 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1576  chloride channel protein  31.16 
 
 		 463 aa  107  3e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.803836 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A25  chloride channel protein EriC  29.02 
 
 		 510 aa  107  6e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0782  chloride channel protein  28.83 
 
 		 479 aa  106  7e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.12239 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0762  chloride channel core  29.31 
 
 		 518 aa  106  7e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000775923  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  32 
 
 		 613 aa  103  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2810  chloride channel protein  31.88 
 
 		 472 aa  102  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  28.47 
 
 		 584 aa  102  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2409  Chloride channel core  31.78 
 
 		 435 aa  100  6e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2009  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.37 
 
 		 443 aa  99.8  9e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0189  chloride channel, core  26.84 
 
 		 445 aa  99  1e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0552  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.68 
 
 		 437 aa  99  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.3 
 
 		 582 aa  99.8  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.72 
 
 		 587 aa  99  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3329  chloride channel protein  30.81 
 
 		 478 aa  98.2  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6434  Chloride channel core  29.95 
 
 		 600 aa  98.6  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3458  chloride channel protein  30.81 
 
 		 478 aa  98.2  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.41349  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0993  chloride channel protein  30.81 
 
 		 478 aa  98.2  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>