More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0957 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_0957  chloride channel core  100 
 
 
442 aa  861    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0796788  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5405  Chloride channel core  62.01 
 
 
437 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0213924  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4258  Chloride channel core  59.25 
 
 
445 aa  436  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3760  chloride channel core  60.43 
 
 
459 aa  429  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.503672  normal  0.147153 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6686  Chloride channel core  61.54 
 
 
438 aa  427  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.709238  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3481  Chloride channel core  58.04 
 
 
441 aa  413  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.429207  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3157  chloride channel core  58.28 
 
 
441 aa  414  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.236304  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3353  Chloride channel core  58.28 
 
 
441 aa  413  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641112  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4474  Chloride channel core  56.43 
 
 
424 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.125667  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5041  putative H(+)/Cl(-) exchange transporter  56.84 
 
 
445 aa  404  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6166  chloride channel core  63.33 
 
 
438 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0747104  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0608  Chloride channel core  48.58 
 
 
468 aa  333  4e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.277563  hitchhiker  0.00926023 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1139  chloride channel protein  48.64 
 
 
440 aa  328  2.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0773  Chloride channel core  49.76 
 
 
444 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.80393  normal  0.191961 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1638  Cl- channel, voltage-gated family protein  42.65 
 
 
436 aa  320  3e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0350  voltage gated chloride channel family protein  48.93 
 
 
451 aa  319  6e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.973552  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0318  voltage gated chloride channel family protein  48.93 
 
 
490 aa  318  9e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3051  chloride channel core  48.22 
 
 
449 aa  315  9.999999999999999e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156315  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7107  Chloride channel core  49.02 
 
 
447 aa  301  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.134894 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5971  Chloride channel core  48.78 
 
 
447 aa  295  9e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306058  normal  0.236498 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1046  Cl- channel, voltage gated  46.23 
 
 
449 aa  295  1e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.0017165  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1867  chloride channel, core  45.39 
 
 
453 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.144395 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3959  voltage-gated chloride channel family protein  45.15 
 
 
453 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.536311 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04784  chloride channel  44.77 
 
 
464 aa  280  4e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147054  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3825  Chloride channel core  45.79 
 
 
447 aa  273  4.0000000000000004e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3037  Cl- channel, voltage-gated family protein  47.65 
 
 
441 aa  273  6e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1573  voltage gated chloride channel family protein  42.82 
 
 
563 aa  272  7e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.556285  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1059  Chloride channel core  43.45 
 
 
474 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0948  chloride channel core  41.72 
 
 
520 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4091  Cl- channel, voltage gated  41.04 
 
 
513 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0815105  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3866  Chloride channel core  43.87 
 
 
435 aa  266  5e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3980  Chloride channel core  43.87 
 
 
435 aa  266  5e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0509  Cl- channel, voltage gated  41.57 
 
 
518 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0988  Cl- channel, voltage-gated family protein  41.57 
 
 
518 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170879  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1380  Chloride channel core  44.75 
 
 
523 aa  265  1e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.332238  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0848  Cl- channel, voltage-gated family protein  41.57 
 
 
521 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.17126  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0860  chloride channel core  41.53 
 
 
565 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.442414  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1155  Cl- channel, voltage gated  41.83 
 
 
440 aa  261  2e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.599671  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0660  chloride channel core  44.23 
 
 
485 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1500  Cl- channel, voltage gated  42.79 
 
 
433 aa  259  8e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2411  chloride channel core  42.27 
 
 
517 aa  257  3e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2109  voltage gated chloride channel family protein  42.96 
 
 
551 aa  254  3e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.732554  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2964  voltage gated chloride channel family protein  42.96 
 
 
562 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3062  voltage gated chloride channel family protein  42.96 
 
 
576 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2635  chloride channel (ClC) family protein  42.96 
 
 
560 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0803  chloride channel (ClC) family protein  42.96 
 
 
576 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.781584  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1977  chloride channel (ClC) family protein  42.96 
 
 
560 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3029  chloride channel (ClC) family protein  42.96 
 
 
578 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6573  Cl- channel, voltage gated  41.96 
 
 
439 aa  247  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.939375  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2667  putative chloride-channel protein  41.19 
 
 
447 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6367  Chloride channel core  41.9 
 
 
441 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5024  chloride channel core  40.14 
 
 
435 aa  241  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.283632  normal  0.200334 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6335  Chloride channel core  39.48 
 
 
456 aa  230  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0697  Cl- channel, voltage gated  44.16 
 
 
439 aa  229  9e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3213  Cl- channel, voltage gated  40.33 
 
 
522 aa  229  9e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0110  voltage gated chloride channel family protein  44.26 
 
 
485 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0419274  hitchhiker  0.00996162 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4712  Cl- channel, voltage-gated family protein  38.36 
 
 
470 aa  222  9e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3820  Cl- channel, voltage-gated family protein  38.58 
 
 
454 aa  218  2e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0706898  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5838  chloride channel core  37.32 
 
 
485 aa  207  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.697782 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3055  Cl- channel, voltage gated  39.39 
 
 
506 aa  204  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.938884  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3257  chloride channel core  41.18 
 
 
446 aa  196  5.000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3116  chloride channel protein  33.73 
 
 
453 aa  191  2e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.958796 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5803  Cl- channel voltage-gated family protein  34.71 
 
 
466 aa  173  5e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0706283  normal  0.393732 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  34.44 
 
 
569 aa  143  6e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  34.11 
 
 
626 aa  138  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3525  Chloride channel core  31.5 
 
 
533 aa  133  6.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3102  chloride channel protein  31.95 
 
 
471 aa  126  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3329  chloride channel protein  30.05 
 
 
478 aa  120  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3458  chloride channel protein  30.05 
 
 
478 aa  120  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.41349  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0993  chloride channel protein  30.05 
 
 
478 aa  120  3.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  30.42 
 
 
473 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  30.42 
 
 
473 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  30.42 
 
 
473 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0695  chloride channel protein  29.73 
 
 
466 aa  119  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.750689  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  30.19 
 
 
473 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  30.19 
 
 
473 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  29.44 
 
 
519 aa  117  5e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  32.62 
 
 
859 aa  115  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  29.44 
 
 
519 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  29.82 
 
 
584 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  32.88 
 
 
582 aa  112  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0681  Chloride channel core  29.2 
 
 
538 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  31.13 
 
 
863 aa  110  7.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A25  chloride channel protein EriC  29.22 
 
 
510 aa  108  2e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0782  chloride channel protein  27.94 
 
 
479 aa  107  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.12239 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.18 
 
 
636 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.18 
 
 
579 aa  107  5e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1576  chloride channel protein  30.83 
 
 
463 aa  107  5e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.803836 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.18 
 
 
579 aa  107  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.18 
 
 
579 aa  107  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2413  chloride channel core  34.46 
 
 
579 aa  107  6e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.18 
 
 
628 aa  106  9e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2409  Chloride channel core  32.51 
 
 
435 aa  106  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2437  chloride channel core  29.03 
 
 
629 aa  103  5e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.276438  normal  0.470563 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0552  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.81 
 
 
437 aa  103  6e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  27.53 
 
 
470 aa  103  7e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  33.33 
 
 
862 aa  102  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1830  chloride channel protein EriC  29.63 
 
 
512 aa  102  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.116382  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0386  chloride channel protein EriC  28.91 
 
 
457 aa  102  2e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000543407 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.31 
 
 
589 aa  101  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.457794 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>