More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0697 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_0697  Cl- channel, voltage gated  100 
 
 
439 aa  853    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4091  Cl- channel, voltage gated  45.8 
 
 
513 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0815105  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0948  chloride channel core  45.82 
 
 
520 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0860  chloride channel core  45.41 
 
 
565 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.442414  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0848  Cl- channel, voltage-gated family protein  45.41 
 
 
521 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.17126  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0509  Cl- channel, voltage gated  44.95 
 
 
518 aa  306  6e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0988  Cl- channel, voltage-gated family protein  44.95 
 
 
518 aa  306  6e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170879  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2411  chloride channel core  45.41 
 
 
517 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0110  voltage gated chloride channel family protein  49.15 
 
 
485 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0419274  hitchhiker  0.00996162 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5024  chloride channel core  44.63 
 
 
435 aa  300  4e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.283632  normal  0.200334 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1059  Chloride channel core  43.54 
 
 
474 aa  300  5e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2667  putative chloride-channel protein  44.89 
 
 
447 aa  298  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3866  Chloride channel core  46.75 
 
 
435 aa  296  4e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0660  chloride channel core  44.6 
 
 
485 aa  296  4e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3980  Chloride channel core  46.75 
 
 
435 aa  296  4e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1573  voltage gated chloride channel family protein  43.85 
 
 
563 aa  293  5e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.556285  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0608  Chloride channel core  44.87 
 
 
468 aa  286  4e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.277563  hitchhiker  0.00926023 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6573  Cl- channel, voltage gated  44.39 
 
 
439 aa  285  8e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.939375  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1155  Cl- channel, voltage gated  46.31 
 
 
440 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.599671  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4712  Cl- channel, voltage-gated family protein  46.04 
 
 
470 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3820  Cl- channel, voltage-gated family protein  44.47 
 
 
454 aa  282  1e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0706898  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1977  chloride channel (ClC) family protein  45.17 
 
 
560 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2635  chloride channel (ClC) family protein  45.17 
 
 
560 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2109  voltage gated chloride channel family protein  45.17 
 
 
551 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.732554  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0803  chloride channel (ClC) family protein  45.17 
 
 
576 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.781584  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2964  voltage gated chloride channel family protein  45.17 
 
 
562 aa  280  4e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3062  voltage gated chloride channel family protein  45.17 
 
 
576 aa  280  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3029  chloride channel (ClC) family protein  45.17 
 
 
578 aa  280  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6335  Chloride channel core  44.55 
 
 
456 aa  277  3e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6367  Chloride channel core  45.56 
 
 
441 aa  275  8e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5838  chloride channel core  44.01 
 
 
485 aa  270  4e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.697782 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0773  Chloride channel core  45.67 
 
 
444 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.80393  normal  0.191961 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3051  chloride channel core  43.75 
 
 
449 aa  261  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156315  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0350  voltage gated chloride channel family protein  42.09 
 
 
451 aa  259  1e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.973552  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0318  voltage gated chloride channel family protein  42.09 
 
 
490 aa  258  2e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7107  Chloride channel core  44.15 
 
 
447 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.134894 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3760  chloride channel core  44.06 
 
 
459 aa  251  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.503672  normal  0.147153 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1046  Cl- channel, voltage gated  41.61 
 
 
449 aa  249  1e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.0017165  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1380  Chloride channel core  42.86 
 
 
523 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.332238  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5971  Chloride channel core  44.66 
 
 
447 aa  241  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306058  normal  0.236498 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4474  Chloride channel core  42.31 
 
 
424 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.125667  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04784  chloride channel  42.12 
 
 
464 aa  238  1e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147054  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3257  chloride channel core  42.55 
 
 
446 aa  238  1e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6686  Chloride channel core  46.99 
 
 
438 aa  236  8e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.709238  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3157  chloride channel core  46.76 
 
 
441 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.236304  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3481  Chloride channel core  47.25 
 
 
441 aa  234  3e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.429207  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0957  chloride channel core  42.07 
 
 
442 aa  232  9e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0796788  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3353  Chloride channel core  47 
 
 
441 aa  230  3e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641112  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5405  Chloride channel core  44.5 
 
 
437 aa  229  6e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0213924  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5041  putative H(+)/Cl(-) exchange transporter  42.69 
 
 
445 aa  229  8e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1139  chloride channel protein  42.2 
 
 
440 aa  227  3e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3825  Chloride channel core  42.08 
 
 
447 aa  225  1e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3213  Cl- channel, voltage gated  43.29 
 
 
522 aa  222  9e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3037  Cl- channel, voltage-gated family protein  43.16 
 
 
441 aa  220  3.9999999999999997e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6166  chloride channel core  45.66 
 
 
438 aa  218  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0747104  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1638  Cl- channel, voltage-gated family protein  38.13 
 
 
436 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4258  Chloride channel core  41.11 
 
 
445 aa  212  9e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1867  chloride channel, core  39.11 
 
 
453 aa  209  7e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.144395 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3959  voltage-gated chloride channel family protein  39.11 
 
 
453 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.536311 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3055  Cl- channel, voltage gated  42.57 
 
 
506 aa  203  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.938884  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1500  Cl- channel, voltage gated  39.58 
 
 
433 aa  200  5e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3116  chloride channel protein  34.04 
 
 
453 aa  175  9.999999999999999e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.958796 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5803  Cl- channel voltage-gated family protein  32.81 
 
 
466 aa  161  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0706283  normal  0.393732 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  31.83 
 
 
569 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  34.31 
 
 
859 aa  117  3e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0695  chloride channel protein  29.07 
 
 
466 aa  112  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.750689  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  27.64 
 
 
473 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3525  Chloride channel core  29.89 
 
 
533 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2944  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.22 
 
 
526 aa  110  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0120087  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  27.43 
 
 
473 aa  109  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  27.22 
 
 
473 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  27.22 
 
 
473 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  27.22 
 
 
473 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  35.87 
 
 
897 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  29.79 
 
 
606 aa  105  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0681  Chloride channel core  27.82 
 
 
538 aa  103  5e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3102  chloride channel protein  30.26 
 
 
471 aa  103  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  33.79 
 
 
862 aa  103  8e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  29.44 
 
 
863 aa  102  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4719  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.78 
 
 
439 aa  100  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  34.31 
 
 
875 aa  98.2  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0993  chloride channel protein  28.36 
 
 
478 aa  97.4  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3458  chloride channel protein  28.36 
 
 
478 aa  97.4  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.41349  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3329  chloride channel protein  28.36 
 
 
478 aa  97.4  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  33.68 
 
 
863 aa  96.7  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0782  chloride channel protein  27.82 
 
 
479 aa  95.5  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.12239 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A25  chloride channel protein EriC  28.15 
 
 
510 aa  95.1  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.81 
 
 
582 aa  95.5  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0757  Chloride channel core  27.53 
 
 
528 aa  94.7  3e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.937422  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1576  chloride channel protein  29.11 
 
 
463 aa  93.6  7e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.803836 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1400  chloride channel protein  28.1 
 
 
523 aa  91.7  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.340394  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2188  Chloride channel core  27.27 
 
 
563 aa  90.9  4e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000751746  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1662  voltage-gated chloride channel family protein  27.88 
 
 
523 aa  90.9  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1588  Cl- channel, voltage gated  30.34 
 
 
539 aa  90.5  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000108225  normal  0.782392 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  30.47 
 
 
584 aa  90.1  8e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1059  Chloride channel core  28.39 
 
 
625 aa  88.2  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0459  chloride channel protein  30.63 
 
 
468 aa  87.8  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.511438  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  28.83 
 
 
519 aa  87.8  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14511  chloride channel  29.31 
 
 
455 aa  87.4  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  29.61 
 
 
626 aa  86.7  8e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>