More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5405 on replicon NC_011758
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011758  Mchl_5405  Chloride channel core  100 
 
 		 437 aa  844    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0213924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6686  Chloride channel core  69.23 
 
 		 438 aa  489  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.709238  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4258  Chloride channel core  64.73 
 
 		 445 aa  475  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6166  chloride channel core  67.9 
 
 		 438 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0747104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3353  Chloride channel core  68.05 
 
 		 441 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3481  Chloride channel core  68.05 
 
 		 441 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.429207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3157  chloride channel core  67.56 
 
 		 441 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.236304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3760  chloride channel core  64.65 
 
 		 459 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.503672  normal  0.147153 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0957  chloride channel core  62.01 
 
 		 442 aa  454  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0796788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4474  Chloride channel core  54.52 
 
 		 424 aa  398  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.125667  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5041  putative H(+)/Cl(-) exchange transporter  58.82 
 
 		 445 aa  397  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0608  Chloride channel core  49.17 
 
 		 468 aa  332  1e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.277563  hitchhiker  0.00926023 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0350  voltage gated chloride channel family protein  47.02 
 
 		 451 aa  325  1e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.973552  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1139  chloride channel protein  48.72 
 
 		 440 aa  324  2e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0318  voltage gated chloride channel family protein  47.53 
 
 		 490 aa  324  2e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3051  chloride channel core  47.75 
 
 		 449 aa  318  1e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156315  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1638  Cl- channel, voltage-gated family protein  43.28 
 
 		 436 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0773  Chloride channel core  49.38 
 
 		 444 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.80393  normal  0.191961 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1046  Cl- channel, voltage gated  45.73 
 
 		 449 aa  302  8.000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.0017165  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3825  Chloride channel core  47.18 
 
 		 447 aa  298  2e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04784  chloride channel  45.43 
 
 		 464 aa  296  7e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147054  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1867  chloride channel, core  47.22 
 
 		 453 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.144395 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3959  voltage-gated chloride channel family protein  46.97 
 
 		 453 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.536311 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5971  Chloride channel core  48.15 
 
 		 447 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306058  normal  0.236498 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7107  Chloride channel core  47.65 
 
 		 447 aa  282  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.134894 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4091  Cl- channel, voltage gated  45.79 
 
 		 513 aa  278  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0815105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0509  Cl- channel, voltage gated  46.15 
 
 		 518 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0948  chloride channel core  46.15 
 
 		 520 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0988  Cl- channel, voltage-gated family protein  46.15 
 
 		 518 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170879  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1059  Chloride channel core  46.08 
 
 		 474 aa  276  6e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3980  Chloride channel core  46.8 
 
 		 435 aa  275  9e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3866  Chloride channel core  46.8 
 
 		 435 aa  275  9e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2411  chloride channel core  45.41 
 
 		 517 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0848  Cl- channel, voltage-gated family protein  45.3 
 
 		 521 aa  272  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.17126  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1155  Cl- channel, voltage gated  44.82 
 
 		 440 aa  271  2e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.599671  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0860  chloride channel core  45.3 
 
 		 565 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.442414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3037  Cl- channel, voltage-gated family protein  46.15 
 
 		 441 aa  264  3e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1380  Chloride channel core  47.03 
 
 		 523 aa  263  4e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.332238  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1573  voltage gated chloride channel family protein  43.41 
 
 		 563 aa  260  4e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.556285  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1500  Cl- channel, voltage gated  45.27 
 
 		 433 aa  258  2e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0660  chloride channel core  45.05 
 
 		 485 aa  249  7e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2667  putative chloride-channel protein  43 
 
 		 447 aa  249  8e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5024  chloride channel core  43.41 
 
 		 435 aa  248  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.283632  normal  0.200334 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0110  voltage gated chloride channel family protein  46.08 
 
 		 485 aa  247  3e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0419274  hitchhiker  0.00996162 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2109  voltage gated chloride channel family protein  43.54 
 
 		 551 aa  246  4e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.732554  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3029  chloride channel (ClC) family protein  43.54 
 
 		 578 aa  246  6e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2635  chloride channel (ClC) family protein  43.54 
 
 		 560 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1977  chloride channel (ClC) family protein  43.54 
 
 		 560 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0803  chloride channel (ClC) family protein  43.54 
 
 		 576 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.781584  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2964  voltage gated chloride channel family protein  43.54 
 
 		 562 aa  245  9e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3062  voltage gated chloride channel family protein  43.54 
 
 		 576 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6573  Cl- channel, voltage gated  43.03 
 
 		 439 aa  241  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.939375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4712  Cl- channel, voltage-gated family protein  41.98 
 
 		 470 aa  232  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0697  Cl- channel, voltage gated  45.36 
 
 		 439 aa  231  1e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6335  Chloride channel core  42.13 
 
 		 456 aa  232  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6367  Chloride channel core  41.92 
 
 		 441 aa  231  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3820  Cl- channel, voltage-gated family protein  42.62 
 
 		 454 aa  231  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0706898  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3213  Cl- channel, voltage gated  41.18 
 
 		 522 aa  223  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5838  chloride channel core  40.5 
 
 		 485 aa  219  6e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.697782 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3055  Cl- channel, voltage gated  41.67 
 
 		 506 aa  211  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.938884  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3257  chloride channel core  39.77 
 
 		 446 aa  194  3e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3116  chloride channel protein  33.41 
 
 		 453 aa  186  5e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.958796 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5803  Cl- channel voltage-gated family protein  34.27 
 
 		 466 aa  172  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0706283  normal  0.393732 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  32.65 
 
 		 569 aa  130  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0695  chloride channel protein  31.5 
 
 		 466 aa  125  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.750689  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3102  chloride channel protein  32.28 
 
 		 471 aa  119  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  30.17 
 
 		 473 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  30.17 
 
 		 473 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  30.17 
 
 		 473 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  30.42 
 
 		 473 aa  117  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  30.42 
 
 		 473 aa  117  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0993  chloride channel protein  30.4 
 
 		 478 aa  116  6.9999999999999995e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3458  chloride channel protein  30.4 
 
 		 478 aa  116  6.9999999999999995e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.41349  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3329  chloride channel protein  30.4 
 
 		 478 aa  116  7.999999999999999e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  33.33 
 
 		 626 aa  114  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3525  Chloride channel core  32.24 
 
 		 533 aa  114  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  27.13 
 
 		 519 aa  110  5e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2409  Chloride channel core  33.8 
 
 		 435 aa  110  7.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  33.24 
 
 		 859 aa  108  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  25.82 
 
 		 519 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1830  chloride channel protein EriC  29.12 
 
 		 512 aa  108  2e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.116382  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  30.32 
 
 		 584 aa  108  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  34.15 
 
 		 897 aa  106  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0681  Chloride channel core  29.14 
 
 		 538 aa  105  2e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  33.24 
 
 		 875 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0552  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.35 
 
 		 437 aa  104  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0147  chloride channel protein  30.89 
 
 		 473 aa  104  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2188  Chloride channel core  28.67 
 
 		 563 aa  104  4e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000751746  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00154  chloride channel protein  30.89 
 
 		 473 aa  103  5e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0502549  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3447  Chloride channel core  30.89 
 
 		 473 aa  103  5e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0159  chloride channel protein  30.89 
 
 		 473 aa  103  5e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0165  chloride channel protein  30.89 
 
 		 473 aa  103  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0167  chloride channel protein  30.89 
 
 		 473 aa  103  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3504  chloride channel protein  30.89 
 
 		 473 aa  103  5e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00153  hypothetical protein  30.89 
 
 		 473 aa  103  5e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0410723  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0160  chloride channel protein  30.89 
 
 		 473 aa  103  5e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  32.34 
 
 		 863 aa  103  6e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0386  chloride channel protein EriC  27.03 
 
 		 457 aa  103  7e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000543407 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1697  chloride channel protein  29 
 
 		 427 aa  103  8e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1698  chloride channel protein  29.54 
 
 		 427 aa  102  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>