More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3980 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_3980  Chloride channel core  100 
 
 		 435 aa  858    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3866  Chloride channel core  100 
 
 		 435 aa  858    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4091  Cl- channel, voltage gated  65.14 
 
 		 513 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0815105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2411  chloride channel core  65.14 
 
 		 517 aa  512  1e-144  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0509  Cl- channel, voltage gated  65.14 
 
 		 518 aa  511  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0988  Cl- channel, voltage-gated family protein  65.14 
 
 		 518 aa  511  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170879  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0948  chloride channel core  65.14 
 
 		 520 aa  511  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0860  chloride channel core  63.7 
 
 		 565 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.442414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0848  Cl- channel, voltage-gated family protein  63.7 
 
 		 521 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.17126  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1059  Chloride channel core  64 
 
 		 474 aa  498  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1573  voltage gated chloride channel family protein  63.46 
 
 		 563 aa  487  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.556285  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0803  chloride channel (ClC) family protein  63.7 
 
 		 576 aa  474  1e-132  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.781584  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2109  voltage gated chloride channel family protein  63.7 
 
 		 551 aa  474  1e-132  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.732554  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1977  chloride channel (ClC) family protein  63.7 
 
 		 560 aa  474  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3062  voltage gated chloride channel family protein  63.7 
 
 		 576 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3029  chloride channel (ClC) family protein  63.7 
 
 		 578 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2635  chloride channel (ClC) family protein  63.7 
 
 		 560 aa  474  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2964  voltage gated chloride channel family protein  63.7 
 
 		 562 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2667  putative chloride-channel protein  61.06 
 
 		 447 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0660  chloride channel core  61.78 
 
 		 485 aa  455  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5024  chloride channel core  61.3 
 
 		 435 aa  457  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.283632  normal  0.200334 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6573  Cl- channel, voltage gated  58.08 
 
 		 439 aa  442  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.939375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6367  Chloride channel core  57.48 
 
 		 441 aa  427  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0608  Chloride channel core  45.33 
 
 		 468 aa  317  2e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.277563  hitchhiker  0.00926023 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3353  Chloride channel core  46.49 
 
 		 441 aa  291  2e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0697  Cl- channel, voltage gated  46.51 
 
 		 439 aa  290  5.0000000000000004e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0773  Chloride channel core  45 
 
 		 444 aa  289  8e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.80393  normal  0.191961 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0350  voltage gated chloride channel family protein  44 
 
 		 451 aa  288  2e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.973552  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3760  chloride channel core  45.58 
 
 		 459 aa  287  2e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.503672  normal  0.147153 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0318  voltage gated chloride channel family protein  44 
 
 		 490 aa  287  2.9999999999999996e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3051  chloride channel core  43.91 
 
 		 449 aa  287  2.9999999999999996e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156315  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3157  chloride channel core  45.76 
 
 		 441 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.236304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1155  Cl- channel, voltage gated  43.06 
 
 		 440 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.599671  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3481  Chloride channel core  46 
 
 		 441 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.429207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5838  chloride channel core  44.65 
 
 		 485 aa  284  3.0000000000000004e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.697782 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1380  Chloride channel core  43.69 
 
 		 523 aa  280  3e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.332238  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3820  Cl- channel, voltage-gated family protein  42.66 
 
 		 454 aa  279  6e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0706898  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4474  Chloride channel core  44.13 
 
 		 424 aa  279  7e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.125667  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0110  voltage gated chloride channel family protein  44.21 
 
 		 485 aa  279  8e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0419274  hitchhiker  0.00996162 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6335  Chloride channel core  44.76 
 
 		 456 aa  279  8e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5405  Chloride channel core  46.8 
 
 		 437 aa  278  9e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0213924  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3959  voltage-gated chloride channel family protein  44.06 
 
 		 453 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.536311 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1867  chloride channel, core  44.19 
 
 		 453 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.144395 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04784  chloride channel  43.54 
 
 		 464 aa  276  4e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147054  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6166  chloride channel core  47.27 
 
 		 438 aa  276  7e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0747104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6686  Chloride channel core  44.84 
 
 		 438 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.709238  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1046  Cl- channel, voltage gated  42.29 
 
 		 449 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.0017165  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4712  Cl- channel, voltage-gated family protein  44.44 
 
 		 470 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7107  Chloride channel core  42.95 
 
 		 447 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.134894 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1638  Cl- channel, voltage-gated family protein  40.62 
 
 		 436 aa  274  3e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0957  chloride channel core  43.87 
 
 		 442 aa  270  2.9999999999999997e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0796788  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5971  Chloride channel core  43.32 
 
 		 447 aa  269  7e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306058  normal  0.236498 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5041  putative H(+)/Cl(-) exchange transporter  46.23 
 
 		 445 aa  262  8.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1139  chloride channel protein  42.47 
 
 		 440 aa  261  1e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4258  Chloride channel core  42.86 
 
 		 445 aa  258  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3037  Cl- channel, voltage-gated family protein  44.74 
 
 		 441 aa  257  3e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3825  Chloride channel core  42.54 
 
 		 447 aa  255  1.0000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3257  chloride channel core  43.39 
 
 		 446 aa  247  3e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3213  Cl- channel, voltage gated  39.64 
 
 		 522 aa  228  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1500  Cl- channel, voltage gated  39 
 
 		 433 aa  221  1.9999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3055  Cl- channel, voltage gated  38.46 
 
 		 506 aa  204  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.938884  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5803  Cl- channel voltage-gated family protein  35.62 
 
 		 466 aa  187  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0706283  normal  0.393732 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3116  chloride channel protein  37 
 
 		 453 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.958796 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  35.15 
 
 		 859 aa  139  1e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3525  Chloride channel core  33.18 
 
 		 533 aa  130  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  34.65 
 
 		 862 aa  119  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  33.24 
 
 		 569 aa  117  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  34.52 
 
 		 897 aa  116  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1830  chloride channel protein EriC  31.27 
 
 		 512 aa  115  1.0000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.116382  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  31.31 
 
 		 584 aa  114  4.0000000000000004e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  27.62 
 
 		 519 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  32.41 
 
 		 863 aa  112  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0695  chloride channel protein  29.01 
 
 		 466 aa  112  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.750689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  28.54 
 
 		 519 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1576  chloride channel protein  31.49 
 
 		 463 aa  110  4.0000000000000004e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.803836 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  29.98 
 
 		 473 aa  109  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  30.21 
 
 		 473 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  29.98 
 
 		 473 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  30.21 
 
 		 473 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  30.21 
 
 		 473 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6434  Chloride channel core  31.05 
 
 		 600 aa  104  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A25  chloride channel protein EriC  28.27 
 
 		 510 aa  104  3e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  32.87 
 
 		 875 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1588  Cl- channel, voltage gated  32.12 
 
 		 539 aa  103  8e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000108225  normal  0.782392 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2944  Cl- channel, voltage-gated family protein  32.14 
 
 		 526 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0120087  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  28.22 
 
 		 626 aa  102  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.82 
 
 		 582 aa  102  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0189  chloride channel, core  26.04 
 
 		 445 aa  101  3e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1588  CBS  33.82 
 
 		 859 aa  100  4e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.497223  normal  0.185787 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4719  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.78 
 
 		 439 aa  100  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3102  chloride channel protein  30.4 
 
 		 471 aa  100  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14511  chloride channel  28.44 
 
 		 455 aa  100  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0782  chloride channel protein  28.74 
 
 		 479 aa  100  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.12239 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1147  chloride channel protein EriC  29.89 
 
 		 487 aa  99  1e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.433892  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0681  Chloride channel core  28.13 
 
 		 538 aa  98.6  2e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4427  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.48 
 
 		 439 aa  99  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.292219 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4200  Cl- channel, voltage gated  29.48 
 
 		 439 aa  99  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.419413  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4266  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.48 
 
 		 439 aa  99  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal  0.948351 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  32.98 
 
 		 863 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0455  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.52 
 
 		 560 aa  98.2  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>