More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I1573 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_2411  chloride channel core  79.83 
 
 
517 aa  712    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2964  voltage gated chloride channel family protein  87.08 
 
 
562 aa  826    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2109  voltage gated chloride channel family protein  87.23 
 
 
551 aa  837    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.732554  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3062  voltage gated chloride channel family protein  87.26 
 
 
576 aa  838    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4091  Cl- channel, voltage gated  85.34 
 
 
513 aa  703    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0815105  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1059  Chloride channel core  80.14 
 
 
474 aa  664    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2635  chloride channel (ClC) family protein  86.9 
 
 
560 aa  849    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1573  voltage gated chloride channel family protein  100 
 
 
563 aa  1115    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.556285  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1977  chloride channel (ClC) family protein  86.9 
 
 
560 aa  849    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0509  Cl- channel, voltage gated  81.14 
 
 
518 aa  721    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0803  chloride channel (ClC) family protein  86.9 
 
 
576 aa  851    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.781584  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0848  Cl- channel, voltage-gated family protein  74.73 
 
 
521 aa  716    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.17126  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0988  Cl- channel, voltage-gated family protein  81.14 
 
 
518 aa  721    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170879  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0948  chloride channel core  74.67 
 
 
520 aa  723    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0860  chloride channel core  80.12 
 
 
565 aa  709    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.442414  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3029  chloride channel (ClC) family protein  86.9 
 
 
578 aa  825    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0660  chloride channel core  77.67 
 
 
485 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2667  putative chloride-channel protein  68.51 
 
 
447 aa  535  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5024  chloride channel core  69.16 
 
 
435 aa  529  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.283632  normal  0.200334 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6367  Chloride channel core  68.41 
 
 
441 aa  522  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6573  Cl- channel, voltage gated  65.87 
 
 
439 aa  514  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.939375  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3866  Chloride channel core  63.5 
 
 
435 aa  476  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3980  Chloride channel core  63.5 
 
 
435 aa  476  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0608  Chloride channel core  44.18 
 
 
468 aa  325  2e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.277563  hitchhiker  0.00926023 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0110  voltage gated chloride channel family protein  45 
 
 
485 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0419274  hitchhiker  0.00996162 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1155  Cl- channel, voltage gated  45.67 
 
 
440 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.599671  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6335  Chloride channel core  45.56 
 
 
456 aa  308  2.0000000000000002e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3760  chloride channel core  43.6 
 
 
459 aa  303  6.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.503672  normal  0.147153 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0773  Chloride channel core  45.48 
 
 
444 aa  298  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.80393  normal  0.191961 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4712  Cl- channel, voltage-gated family protein  43.54 
 
 
470 aa  297  4e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3820  Cl- channel, voltage-gated family protein  44.84 
 
 
454 aa  296  9e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0706898  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5838  chloride channel core  44.79 
 
 
485 aa  288  2e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.697782 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0697  Cl- channel, voltage gated  44.08 
 
 
439 aa  286  5.999999999999999e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4474  Chloride channel core  45.01 
 
 
424 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.125667  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7107  Chloride channel core  43.02 
 
 
447 aa  280  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.134894 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3051  chloride channel core  41.18 
 
 
449 aa  278  2e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156315  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0957  chloride channel core  43.12 
 
 
442 aa  276  7e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0796788  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1046  Cl- channel, voltage gated  40 
 
 
449 aa  270  4e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.0017165  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0350  voltage gated chloride channel family protein  41.09 
 
 
451 aa  270  5e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.973552  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1380  Chloride channel core  41.27 
 
 
523 aa  270  5e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.332238  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0318  voltage gated chloride channel family protein  41.09 
 
 
490 aa  270  7e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5971  Chloride channel core  42.86 
 
 
447 aa  270  7e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306058  normal  0.236498 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3157  chloride channel core  43.44 
 
 
441 aa  268  1e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.236304  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3353  Chloride channel core  43.41 
 
 
441 aa  268  2e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641112  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3825  Chloride channel core  40.57 
 
 
447 aa  268  2e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04784  chloride channel  41.55 
 
 
464 aa  268  2e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147054  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1867  chloride channel, core  41.89 
 
 
453 aa  267  5e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.144395 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3481  Chloride channel core  43.21 
 
 
441 aa  265  1e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.429207  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3959  voltage-gated chloride channel family protein  42.4 
 
 
453 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.536311 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4258  Chloride channel core  43.17 
 
 
445 aa  265  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3257  chloride channel core  44 
 
 
446 aa  260  5.0000000000000005e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1638  Cl- channel, voltage-gated family protein  39.29 
 
 
436 aa  259  1e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1139  chloride channel protein  40.52 
 
 
440 aa  258  2e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5405  Chloride channel core  44.8 
 
 
437 aa  258  3e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0213924  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5041  putative H(+)/Cl(-) exchange transporter  44.25 
 
 
445 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6686  Chloride channel core  44.39 
 
 
438 aa  252  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.709238  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6166  chloride channel core  45.45 
 
 
438 aa  249  1e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0747104  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3037  Cl- channel, voltage-gated family protein  44.01 
 
 
441 aa  248  3e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3213  Cl- channel, voltage gated  38.19 
 
 
522 aa  231  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3055  Cl- channel, voltage gated  38.97 
 
 
506 aa  209  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.938884  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1500  Cl- channel, voltage gated  37.79 
 
 
433 aa  208  2e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3116  chloride channel protein  35.54 
 
 
453 aa  186  9e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.958796 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5803  Cl- channel voltage-gated family protein  35.09 
 
 
466 aa  182  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0706283  normal  0.393732 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  35.68 
 
 
859 aa  135  9.999999999999999e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  31.16 
 
 
569 aa  133  9e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3525  Chloride channel core  32.52 
 
 
533 aa  120  7.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A25  chloride channel protein EriC  27.36 
 
 
510 aa  117  3.9999999999999997e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1830  chloride channel protein EriC  31.34 
 
 
512 aa  117  6e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.116382  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  28.25 
 
 
519 aa  117  7.999999999999999e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  35.85 
 
 
862 aa  116  8.999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  28.36 
 
 
519 aa  114  5e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0681  Chloride channel core  26.19 
 
 
538 aa  113  8.000000000000001e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0695  chloride channel protein  28.96 
 
 
466 aa  112  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.750689  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2944  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.89 
 
 
526 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0120087  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  29.8 
 
 
473 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  29.8 
 
 
473 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  29.8 
 
 
473 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  29.8 
 
 
473 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  29.8 
 
 
473 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  31.22 
 
 
897 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0782  chloride channel protein  28.6 
 
 
479 aa  110  8.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.12239 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14511  chloride channel  30.69 
 
 
455 aa  109  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3102  chloride channel protein  31.52 
 
 
471 aa  108  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1576  chloride channel protein  31.19 
 
 
463 aa  108  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.803836 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2810  chloride channel protein  31.28 
 
 
472 aa  107  4e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  31.74 
 
 
863 aa  105  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3329  chloride channel protein  28.31 
 
 
478 aa  105  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3458  chloride channel protein  28.31 
 
 
478 aa  105  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.41349  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0993  chloride channel protein  28.31 
 
 
478 aa  105  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  31.92 
 
 
626 aa  103  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  30.56 
 
 
606 aa  100  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2188  Chloride channel core  28.15 
 
 
563 aa  99.4  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000751746  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  32.59 
 
 
863 aa  99.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4719  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.47 
 
 
439 aa  97.8  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  28.91 
 
 
584 aa  97.1  8e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0455  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.63 
 
 
560 aa  95.9  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1147  chloride channel protein EriC  29.04 
 
 
487 aa  95.5  2e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.433892  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3801  Chloride channel core  31.32 
 
 
464 aa  95.5  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3914  Chloride channel core  31.32 
 
 
464 aa  95.5  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1588  Cl- channel, voltage gated  31.36 
 
 
539 aa  95.1  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000108225  normal  0.782392 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>