More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4474 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4474  Chloride channel core  100 
 
 		 424 aa  825    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.125667  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5041  putative H(+)/Cl(-) exchange transporter  69.67 
 
 		 445 aa  508  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0957  chloride channel core  55.94 
 
 		 442 aa  421  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0796788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5405  Chloride channel core  54.81 
 
 		 437 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0213924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3157  chloride channel core  55.66 
 
 		 441 aa  392  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.236304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6686  Chloride channel core  59.95 
 
 		 438 aa  390  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.709238  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3481  Chloride channel core  55.42 
 
 		 441 aa  388  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.429207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3353  Chloride channel core  55.66 
 
 		 441 aa  387  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4258  Chloride channel core  55.22 
 
 		 445 aa  378  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3760  chloride channel core  55.01 
 
 		 459 aa  379  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.503672  normal  0.147153 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0773  Chloride channel core  53.06 
 
 		 444 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.80393  normal  0.191961 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6166  chloride channel core  58.6 
 
 		 438 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0747104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3051  chloride channel core  47.99 
 
 		 449 aa  347  2e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156315  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7107  Chloride channel core  49.07 
 
 		 447 aa  347  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.134894 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1046  Cl- channel, voltage gated  46.81 
 
 		 449 aa  344  2e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.0017165  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0350  voltage gated chloride channel family protein  46.54 
 
 		 451 aa  340  4e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.973552  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0608  Chloride channel core  47.07 
 
 		 468 aa  339  5.9999999999999996e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.277563  hitchhiker  0.00926023 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0318  voltage gated chloride channel family protein  46.98 
 
 		 490 aa  339  5.9999999999999996e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1139  chloride channel protein  47.7 
 
 		 440 aa  330  2e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5971  Chloride channel core  48.36 
 
 		 447 aa  330  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306058  normal  0.236498 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1638  Cl- channel, voltage-gated family protein  44.28 
 
 		 436 aa  325  1e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0509  Cl- channel, voltage gated  43.72 
 
 		 518 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0988  Cl- channel, voltage-gated family protein  43.72 
 
 		 518 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170879  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0948  chloride channel core  43.72 
 
 		 520 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4091  Cl- channel, voltage gated  42.29 
 
 		 513 aa  299  6e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0815105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1573  voltage gated chloride channel family protein  43.62 
 
 		 563 aa  298  1e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.556285  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3037  Cl- channel, voltage-gated family protein  48.11 
 
 		 441 aa  297  3e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04784  chloride channel  44.36 
 
 		 464 aa  295  1e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147054  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0848  Cl- channel, voltage-gated family protein  42.33 
 
 		 521 aa  295  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.17126  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0860  chloride channel core  42.33 
 
 		 565 aa  292  9e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.442414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3825  Chloride channel core  45 
 
 		 447 aa  290  5.0000000000000004e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2411  chloride channel core  41.63 
 
 		 517 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1059  Chloride channel core  40.69 
 
 		 474 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1380  Chloride channel core  48.05 
 
 		 523 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.332238  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2109  voltage gated chloride channel family protein  44.32 
 
 		 551 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.732554  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3866  Chloride channel core  43.87 
 
 		 435 aa  284  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3980  Chloride channel core  43.87 
 
 		 435 aa  284  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3062  voltage gated chloride channel family protein  44.32 
 
 		 576 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3029  chloride channel (ClC) family protein  44.32 
 
 		 578 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0803  chloride channel (ClC) family protein  44.32 
 
 		 576 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.781584  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2964  voltage gated chloride channel family protein  44.32 
 
 		 562 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2635  chloride channel (ClC) family protein  44.32 
 
 		 560 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1977  chloride channel (ClC) family protein  44.32 
 
 		 560 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1867  chloride channel, core  43.07 
 
 		 453 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.144395 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3959  voltage-gated chloride channel family protein  42.82 
 
 		 453 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.536311 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6573  Cl- channel, voltage gated  41.36 
 
 		 439 aa  269  5e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.939375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2667  putative chloride-channel protein  42.03 
 
 		 447 aa  267  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0660  chloride channel core  42.37 
 
 		 485 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1500  Cl- channel, voltage gated  46.63 
 
 		 433 aa  263  4.999999999999999e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5024  chloride channel core  41.55 
 
 		 435 aa  256  4e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.283632  normal  0.200334 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6367  Chloride channel core  42.07 
 
 		 441 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1155  Cl- channel, voltage gated  41.59 
 
 		 440 aa  247  4e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.599671  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0697  Cl- channel, voltage gated  42.31 
 
 		 439 aa  243  3e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0110  voltage gated chloride channel family protein  44.84 
 
 		 485 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0419274  hitchhiker  0.00996162 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4712  Cl- channel, voltage-gated family protein  42.14 
 
 		 470 aa  239  1e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3820  Cl- channel, voltage-gated family protein  40 
 
 		 454 aa  236  6e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0706898  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6335  Chloride channel core  43.69 
 
 		 456 aa  234  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3213  Cl- channel, voltage gated  39.34 
 
 		 522 aa  223  6e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5838  chloride channel core  42.08 
 
 		 485 aa  219  8.999999999999998e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.697782 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3257  chloride channel core  40 
 
 		 446 aa  210  4e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3055  Cl- channel, voltage gated  38.1 
 
 		 506 aa  205  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.938884  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3116  chloride channel protein  31.02 
 
 		 453 aa  182  1e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.958796 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5803  Cl- channel voltage-gated family protein  35.09 
 
 		 466 aa  170  5e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0706283  normal  0.393732 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  34.82 
 
 		 569 aa  147  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3525  Chloride channel core  34.85 
 
 		 533 aa  142  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  32.97 
 
 		 626 aa  136  8e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  32.28 
 
 		 591 aa  124  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2188  Chloride channel core  32.66 
 
 		 563 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000751746  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3102  chloride channel protein  32.89 
 
 		 471 aa  121  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  30.79 
 
 		 615 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1830  chloride channel protein EriC  29.01 
 
 		 512 aa  120  4.9999999999999996e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.116382  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.29 
 
 		 577 aa  120  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A25  chloride channel protein EriC  27.55 
 
 		 510 aa  118  1.9999999999999998e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  32.24 
 
 		 863 aa  118  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  29.95 
 
 		 584 aa  117  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  28.5 
 
 		 519 aa  118  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  32.97 
 
 		 859 aa  117  3.9999999999999997e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0681  Chloride channel core  28.65 
 
 		 538 aa  117  5e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  28.07 
 
 		 519 aa  116  6e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  32.87 
 
 		 606 aa  116  7.999999999999999e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.38 
 
 		 579 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.69 
 
 		 636 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.38 
 
 		 579 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.38 
 
 		 579 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2944  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.03 
 
 		 526 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0120087  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.79 
 
 		 628 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0695  chloride channel protein  30.27 
 
 		 466 aa  111  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.750689  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  32.28 
 
 		 614 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  27.92 
 
 		 470 aa  109  7.000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2283  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  32.76 
 
 		 591 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1639  Cl- channel voltage-gated family protein  31.41 
 
 		 597 aa  107  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  34.77 
 
 		 613 aa  107  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14511  chloride channel  30.18 
 
 		 455 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.91 
 
 		 598 aa  107  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  29.27 
 
 		 473 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1400  chloride channel protein  28.77 
 
 		 523 aa  107  4e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.340394  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  29.27 
 
 		 473 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  29.27 
 
 		 473 aa  107  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  29.27 
 
 		 473 aa  107  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  29.27 
 
 		 473 aa  107  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>