More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1867 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3959  voltage-gated chloride channel family protein  99.34 
 
 		 453 aa  878    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.536311 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1867  chloride channel, core  100 
 
 		 453 aa  883    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.144395 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3825  Chloride channel core  54.41 
 
 		 447 aa  363  5.0000000000000005e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04784  chloride channel  51.66 
 
 		 464 aa  356  5e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147054  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0608  Chloride channel core  46.6 
 
 		 468 aa  348  1e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.277563  hitchhiker  0.00926023 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3051  chloride channel core  43.17 
 
 		 449 aa  310  4e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156315  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0350  voltage gated chloride channel family protein  43.2 
 
 		 451 aa  295  1e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.973552  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0957  chloride channel core  43.93 
 
 		 442 aa  295  1e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0796788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0318  voltage gated chloride channel family protein  43.2 
 
 		 490 aa  294  2e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5405  Chloride channel core  45.76 
 
 		 437 aa  292  1e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0213924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0773  Chloride channel core  45.26 
 
 		 444 aa  291  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.80393  normal  0.191961 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3157  chloride channel core  46 
 
 		 441 aa  291  2e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.236304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3353  Chloride channel core  45.54 
 
 		 441 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1059  Chloride channel core  41.14 
 
 		 474 aa  289  7e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0948  chloride channel core  43.39 
 
 		 520 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5041  putative H(+)/Cl(-) exchange transporter  45.89 
 
 		 445 aa  287  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0509  Cl- channel, voltage gated  43.39 
 
 		 518 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0988  Cl- channel, voltage-gated family protein  43.39 
 
 		 518 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170879  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0848  Cl- channel, voltage-gated family protein  42.82 
 
 		 521 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.17126  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6686  Chloride channel core  47.03 
 
 		 438 aa  286  4e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.709238  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3481  Chloride channel core  45.54 
 
 		 441 aa  286  5e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.429207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3760  chloride channel core  42.22 
 
 		 459 aa  285  8e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.503672  normal  0.147153 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4091  Cl- channel, voltage gated  42.13 
 
 		 513 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0815105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0860  chloride channel core  43.13 
 
 		 565 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.442414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4474  Chloride channel core  43.31 
 
 		 424 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.125667  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7107  Chloride channel core  44.08 
 
 		 447 aa  281  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.134894 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1139  chloride channel protein  43.63 
 
 		 440 aa  281  2e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1046  Cl- channel, voltage gated  43.2 
 
 		 449 aa  281  2e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.0017165  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3980  Chloride channel core  44.53 
 
 		 435 aa  280  5e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3866  Chloride channel core  44.53 
 
 		 435 aa  280  5e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1573  voltage gated chloride channel family protein  43.06 
 
 		 563 aa  276  4e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.556285  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2411  chloride channel core  43.9 
 
 		 517 aa  276  5e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1638  Cl- channel, voltage-gated family protein  38.79 
 
 		 436 aa  276  7e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4258  Chloride channel core  45.76 
 
 		 445 aa  276  7e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2667  putative chloride-channel protein  42.21 
 
 		 447 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3037  Cl- channel, voltage-gated family protein  45.66 
 
 		 441 aa  270  4e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5971  Chloride channel core  43.09 
 
 		 447 aa  266  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306058  normal  0.236498 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5024  chloride channel core  42.92 
 
 		 435 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.283632  normal  0.200334 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6573  Cl- channel, voltage gated  41.05 
 
 		 439 aa  260  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.939375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1977  chloride channel (ClC) family protein  42.04 
 
 		 560 aa  260  4e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2109  voltage gated chloride channel family protein  42.04 
 
 		 551 aa  260  4e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.732554  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3062  voltage gated chloride channel family protein  42.04 
 
 		 576 aa  260  4e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0803  chloride channel (ClC) family protein  42.04 
 
 		 576 aa  260  4e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.781584  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2635  chloride channel (ClC) family protein  42.04 
 
 		 560 aa  260  4e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6166  chloride channel core  45.61 
 
 		 438 aa  260  4e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0747104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3029  chloride channel (ClC) family protein  43.19 
 
 		 578 aa  259  6e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0660  chloride channel core  44.44 
 
 		 485 aa  259  8e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1380  Chloride channel core  40.88 
 
 		 523 aa  259  8e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.332238  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2964  voltage gated chloride channel family protein  43.19 
 
 		 562 aa  259  9e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0110  voltage gated chloride channel family protein  42.67 
 
 		 485 aa  256  7e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0419274  hitchhiker  0.00996162 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1500  Cl- channel, voltage gated  44.63 
 
 		 433 aa  252  8.000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3213  Cl- channel, voltage gated  42.51 
 
 		 522 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4712  Cl- channel, voltage-gated family protein  41.15 
 
 		 470 aa  246  6.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6367  Chloride channel core  40.57 
 
 		 441 aa  238  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1155  Cl- channel, voltage gated  41.65 
 
 		 440 aa  238  2e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.599671  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6335  Chloride channel core  40.45 
 
 		 456 aa  236  7e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3820  Cl- channel, voltage-gated family protein  39.05 
 
 		 454 aa  228  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0706898  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3055  Cl- channel, voltage gated  40.81 
 
 		 506 aa  225  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.938884  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5838  chloride channel core  40.19 
 
 		 485 aa  225  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.697782 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0697  Cl- channel, voltage gated  39.58 
 
 		 439 aa  207  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3257  chloride channel core  37.56 
 
 		 446 aa  185  1.0000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5803  Cl- channel voltage-gated family protein  35.32 
 
 		 466 aa  179  7e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0706283  normal  0.393732 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3116  chloride channel protein  30 
 
 		 453 aa  177  3e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.958796 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  31.79 
 
 		 569 aa  140  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  32.28 
 
 		 859 aa  121  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  33.78 
 
 		 897 aa  120  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4719  Cl- channel, voltage-gated family protein  32.02 
 
 		 439 aa  120  7e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3525  Chloride channel core  32.01 
 
 		 533 aa  114  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  31.64 
 
 		 473 aa  110  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  31.64 
 
 		 473 aa  110  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  31.64 
 
 		 473 aa  110  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  31.42 
 
 		 473 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  31.42 
 
 		 473 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  30.02 
 
 		 615 aa  108  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2009  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.62 
 
 		 443 aa  106  8e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0782  chloride channel protein  28.34 
 
 		 479 aa  105  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.12239 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1576  chloride channel protein  31.46 
 
 		 463 aa  106  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.803836 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  31.03 
 
 		 626 aa  105  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4427  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.51 
 
 		 439 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.292219 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4200  Cl- channel, voltage gated  31.51 
 
 		 439 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.419413  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4266  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.51 
 
 		 439 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal  0.948351 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0681  Chloride channel core  26.3 
 
 		 538 aa  105  2e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  36.28 
 
 		 608 aa  104  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3102  chloride channel protein  32.26 
 
 		 471 aa  103  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3329  chloride channel protein  30.28 
 
 		 478 aa  104  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  32.29 
 
 		 582 aa  103  5e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2188  Chloride channel core  28.32 
 
 		 563 aa  103  6e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000751746  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0993  chloride channel protein  30.07 
 
 		 478 aa  103  7e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3458  chloride channel protein  30.07 
 
 		 478 aa  103  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.41349  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  27.01 
 
 		 584 aa  102  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  32.9 
 
 		 862 aa  100  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  25.42 
 
 		 519 aa  100  5e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  30.19 
 
 		 669 aa  100  7e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0832  chloride channel  34.46 
 
 		 585 aa  97.8  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2409  Chloride channel core  33.15 
 
 		 435 aa  97.8  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0695  chloride channel protein  28.67 
 
 		 466 aa  97.4  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.750689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2446  chloride channel core  28.76 
 
 		 603 aa  97.4  5e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14511  chloride channel  30.94 
 
 		 455 aa  97.1  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2810  chloride channel protein  33.93 
 
 		 472 aa  95.9  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  25.49 
 
 		 519 aa  96.3  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>