More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5803 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5803  Cl- channel voltage-gated family protein  100 
 
 		 466 aa  926    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0706283  normal  0.393732 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3116  chloride channel protein  47.32 
 
 		 453 aa  387  1e-106  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.958796 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0608  Chloride channel core  31.9 
 
 		 468 aa  189  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.277563  hitchhiker  0.00926023 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1059  Chloride channel core  36.24 
 
 		 474 aa  188  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0350  voltage gated chloride channel family protein  35.67 
 
 		 451 aa  186  7e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.973552  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0318  voltage gated chloride channel family protein  35.67 
 
 		 490 aa  186  9e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3051  chloride channel core  34.74 
 
 		 449 aa  177  5e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156315  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3980  Chloride channel core  34.84 
 
 		 435 aa  176  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0848  Cl- channel, voltage-gated family protein  34.91 
 
 		 521 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.17126  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3866  Chloride channel core  34.84 
 
 		 435 aa  176  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0860  chloride channel core  34.91 
 
 		 565 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.442414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2411  chloride channel core  35.1 
 
 		 517 aa  173  5e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4091  Cl- channel, voltage gated  34.16 
 
 		 513 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0815105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1573  voltage gated chloride channel family protein  34.86 
 
 		 563 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.556285  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1500  Cl- channel, voltage gated  35.12 
 
 		 433 aa  171  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0660  chloride channel core  34.13 
 
 		 485 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0509  Cl- channel, voltage gated  34.31 
 
 		 518 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0957  chloride channel core  34.33 
 
 		 442 aa  171  3e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0796788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0988  Cl- channel, voltage-gated family protein  34.31 
 
 		 518 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170879  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3760  chloride channel core  34.87 
 
 		 459 aa  170  4e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.503672  normal  0.147153 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0948  chloride channel core  34.09 
 
 		 520 aa  170  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4474  Chloride channel core  35.09 
 
 		 424 aa  169  9e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.125667  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0773  Chloride channel core  33.65 
 
 		 444 aa  167  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.80393  normal  0.191961 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1139  chloride channel protein  34.51 
 
 		 440 aa  167  4e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5405  Chloride channel core  34.03 
 
 		 437 aa  167  5e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0213924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1046  Cl- channel, voltage gated  32.51 
 
 		 449 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.0017165  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5041  putative H(+)/Cl(-) exchange transporter  34.23 
 
 		 445 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1638  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.05 
 
 		 436 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7107  Chloride channel core  34.05 
 
 		 447 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.134894 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2667  putative chloride-channel protein  34.19 
 
 		 447 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5024  chloride channel core  33.72 
 
 		 435 aa  161  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.283632  normal  0.200334 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2109  voltage gated chloride channel family protein  35.45 
 
 		 551 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.732554  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3062  voltage gated chloride channel family protein  35.45 
 
 		 576 aa  160  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2964  voltage gated chloride channel family protein  35.45 
 
 		 562 aa  160  4e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1867  chloride channel, core  35.1 
 
 		 453 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.144395 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3029  chloride channel (ClC) family protein  35.45 
 
 		 578 aa  160  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0803  chloride channel (ClC) family protein  35.45 
 
 		 576 aa  160  5e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.781584  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2635  chloride channel (ClC) family protein  35.45 
 
 		 560 aa  160  6e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1977  chloride channel (ClC) family protein  35.45 
 
 		 560 aa  160  6e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3959  voltage-gated chloride channel family protein  34.88 
 
 		 453 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.536311 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6367  Chloride channel core  32.9 
 
 		 441 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6573  Cl- channel, voltage gated  33.41 
 
 		 439 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.939375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3157  chloride channel core  34.66 
 
 		 441 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.236304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3481  Chloride channel core  34.43 
 
 		 441 aa  153  8e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.429207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3213  Cl- channel, voltage gated  31.39 
 
 		 522 aa  152  8.999999999999999e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6166  chloride channel core  35.02 
 
 		 438 aa  152  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0747104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6686  Chloride channel core  36.46 
 
 		 438 aa  150  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.709238  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1155  Cl- channel, voltage gated  32.33 
 
 		 440 aa  150  4e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.599671  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04784  chloride channel  34.29 
 
 		 464 aa  150  4e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147054  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3353  Chloride channel core  34.11 
 
 		 441 aa  149  9e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641112  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6335  Chloride channel core  34.16 
 
 		 456 aa  149  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3825  Chloride channel core  33.94 
 
 		 447 aa  149  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4258  Chloride channel core  32.29 
 
 		 445 aa  147  5e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0697  Cl- channel, voltage gated  32.81 
 
 		 439 aa  146  7.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5971  Chloride channel core  31.43 
 
 		 447 aa  145  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306058  normal  0.236498 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3037  Cl- channel, voltage-gated family protein  33.8 
 
 		 441 aa  141  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0110  voltage gated chloride channel family protein  33.65 
 
 		 485 aa  136  7.000000000000001e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0419274  hitchhiker  0.00996162 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  30.45 
 
 		 473 aa  133  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  30.45 
 
 		 473 aa  133  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  30.45 
 
 		 473 aa  133  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  30.45 
 
 		 473 aa  133  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  30.45 
 
 		 473 aa  133  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1380  Chloride channel core  31.22 
 
 		 523 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.332238  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0695  chloride channel protein  29.82 
 
 		 466 aa  131  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.750689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3055  Cl- channel, voltage gated  30.47 
 
 		 506 aa  130  6e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.938884  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3820  Cl- channel, voltage-gated family protein  32.81 
 
 		 454 aa  129  8.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0706898  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4712  Cl- channel, voltage-gated family protein  32.68 
 
 		 470 aa  124  4e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5838  chloride channel core  33.71 
 
 		 485 aa  121  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.697782 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  30.63 
 
 		 859 aa  119  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3525  Chloride channel core  30.73 
 
 		 533 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1576  chloride channel protein  29.76 
 
 		 463 aa  116  6.9999999999999995e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.803836 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3257  chloride channel core  30.5 
 
 		 446 aa  116  8.999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3102  chloride channel protein  28.98 
 
 		 471 aa  113  6e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3458  chloride channel protein  29.09 
 
 		 478 aa  112  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.41349  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3329  chloride channel protein  29.09 
 
 		 478 aa  112  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0993  chloride channel protein  29.09 
 
 		 478 aa  112  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0681  Chloride channel core  27.01 
 
 		 538 aa  111  3e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2944  Cl- channel, voltage-gated family protein  25.66 
 
 		 526 aa  110  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0120087  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2188  Chloride channel core  29.64 
 
 		 563 aa  107  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000751746  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2509  chloride channel protein  32.64 
 
 		 455 aa  106  7e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0782  chloride channel protein  29.12 
 
 		 479 aa  106  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.12239 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  31.52 
 
 		 862 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4719  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.79 
 
 		 439 aa  104  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal  1 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  31.05 
 
 		 863 aa  104  4e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  31.27 
 
 		 897 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2409  Chloride channel core  31.22 
 
 		 435 aa  102  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  24.05 
 
 		 519 aa  100  7e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  30.58 
 
 		 569 aa  100  8e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0459  chloride channel protein  27.79 
 
 		 468 aa  98.6  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.511438  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A25  chloride channel protein EriC  27.25 
 
 		 510 aa  97.1  7e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  23.54 
 
 		 519 aa  95.5  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00154  chloride channel protein  29.42 
 
 		 473 aa  95.1  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0502549  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3447  Chloride channel core  29.42 
 
 		 473 aa  95.1  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00153  hypothetical protein  29.42 
 
 		 473 aa  95.1  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0410723  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  29.12 
 
 		 606 aa  95.1  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0160  chloride channel protein  29.42 
 
 		 473 aa  95.1  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3504  chloride channel protein  29.42 
 
 		 473 aa  95.1  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0159  chloride channel protein  29.2 
 
 		 473 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0167  chloride channel protein  29.11 
 
 		 473 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0165  chloride channel protein  29.11 
 
 		 473 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>