More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5024 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_5024  chloride channel core  100 
 
 
435 aa  856    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.283632  normal  0.200334 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2667  putative chloride-channel protein  87.79 
 
 
447 aa  716    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6367  Chloride channel core  76.96 
 
 
441 aa  615  1e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6573  Cl- channel, voltage gated  75.46 
 
 
439 aa  600  1e-170  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.939375  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4091  Cl- channel, voltage gated  69.76 
 
 
513 aa  549  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0815105  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0948  chloride channel core  70.48 
 
 
520 aa  549  1e-155  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0509  Cl- channel, voltage gated  70.24 
 
 
518 aa  550  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0848  Cl- channel, voltage-gated family protein  69.29 
 
 
521 aa  548  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.17126  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0988  Cl- channel, voltage-gated family protein  70.24 
 
 
518 aa  550  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170879  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1059  Chloride channel core  69.76 
 
 
474 aa  546  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0660  chloride channel core  70.48 
 
 
485 aa  542  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2411  chloride channel core  69.52 
 
 
517 aa  543  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0860  chloride channel core  69.05 
 
 
565 aa  543  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.442414  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1573  voltage gated chloride channel family protein  68.81 
 
 
563 aa  524  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.556285  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2964  voltage gated chloride channel family protein  69.29 
 
 
562 aa  511  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0803  chloride channel (ClC) family protein  69.29 
 
 
576 aa  511  1e-144  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.781584  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2109  voltage gated chloride channel family protein  69.76 
 
 
551 aa  512  1e-144  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.732554  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1977  chloride channel (ClC) family protein  69.76 
 
 
560 aa  511  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3062  voltage gated chloride channel family protein  69.76 
 
 
576 aa  511  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2635  chloride channel (ClC) family protein  69.76 
 
 
560 aa  511  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3029  chloride channel (ClC) family protein  69.29 
 
 
578 aa  512  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3866  Chloride channel core  61.15 
 
 
435 aa  451  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3980  Chloride channel core  61.15 
 
 
435 aa  451  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0608  Chloride channel core  45.22 
 
 
468 aa  305  2.0000000000000002e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.277563  hitchhiker  0.00926023 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1155  Cl- channel, voltage gated  44.47 
 
 
440 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.599671  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4712  Cl- channel, voltage-gated family protein  45.1 
 
 
470 aa  293  6e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0697  Cl- channel, voltage gated  43.91 
 
 
439 aa  286  5.999999999999999e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0110  voltage gated chloride channel family protein  44.95 
 
 
485 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0419274  hitchhiker  0.00996162 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6335  Chloride channel core  43.46 
 
 
456 aa  280  4e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3760  chloride channel core  44.24 
 
 
459 aa  278  2e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.503672  normal  0.147153 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1046  Cl- channel, voltage gated  42.99 
 
 
449 aa  276  4e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.0017165  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3820  Cl- channel, voltage-gated family protein  43.12 
 
 
454 aa  276  7e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0706898  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5838  chloride channel core  43.4 
 
 
485 aa  267  2.9999999999999995e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.697782 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04784  chloride channel  43.27 
 
 
464 aa  262  8e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147054  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3051  chloride channel core  41.59 
 
 
449 aa  262  8e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156315  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3825  Chloride channel core  43.99 
 
 
447 aa  260  3e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0350  voltage gated chloride channel family protein  39.77 
 
 
451 aa  260  3e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.973552  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0318  voltage gated chloride channel family protein  39.77 
 
 
490 aa  260  3e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0773  Chloride channel core  42.2 
 
 
444 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.80393  normal  0.191961 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3353  Chloride channel core  42.86 
 
 
441 aa  256  8e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641112  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5041  putative H(+)/Cl(-) exchange transporter  45.77 
 
 
445 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7107  Chloride channel core  39.24 
 
 
447 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.134894 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6686  Chloride channel core  43.41 
 
 
438 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.709238  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3257  chloride channel core  44.16 
 
 
446 aa  250  4e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1867  chloride channel, core  43.19 
 
 
453 aa  250  4e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.144395 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4474  Chloride channel core  42.74 
 
 
424 aa  249  5e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.125667  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3959  voltage-gated chloride channel family protein  42.96 
 
 
453 aa  249  6e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.536311 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1380  Chloride channel core  44.21 
 
 
523 aa  247  3e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.332238  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3157  chloride channel core  42.04 
 
 
441 aa  246  4e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.236304  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4258  Chloride channel core  42.37 
 
 
445 aa  246  6e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3481  Chloride channel core  42.04 
 
 
441 aa  246  6e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.429207  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5971  Chloride channel core  39.09 
 
 
447 aa  244  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306058  normal  0.236498 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0957  chloride channel core  40.42 
 
 
442 aa  241  1e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0796788  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5405  Chloride channel core  45.12 
 
 
437 aa  241  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0213924  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6166  chloride channel core  42.82 
 
 
438 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0747104  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3037  Cl- channel, voltage-gated family protein  41.76 
 
 
441 aa  235  1.0000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1139  chloride channel protein  38.83 
 
 
440 aa  233  4.0000000000000004e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1638  Cl- channel, voltage-gated family protein  36.87 
 
 
436 aa  226  8e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1500  Cl- channel, voltage gated  40.24 
 
 
433 aa  217  2.9999999999999998e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3213  Cl- channel, voltage gated  38.18 
 
 
522 aa  205  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3055  Cl- channel, voltage gated  38.71 
 
 
506 aa  190  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.938884  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5803  Cl- channel voltage-gated family protein  34.4 
 
 
466 aa  171  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0706283  normal  0.393732 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3116  chloride channel protein  33.1 
 
 
453 aa  162  1e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.958796 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  35.15 
 
 
859 aa  133  5e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3525  Chloride channel core  31.7 
 
 
533 aa  130  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  33.51 
 
 
569 aa  123  6e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0695  chloride channel protein  28.97 
 
 
466 aa  115  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.750689  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  27.57 
 
 
473 aa  113  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  27.57 
 
 
473 aa  114  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  27.57 
 
 
473 aa  114  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  27.57 
 
 
473 aa  114  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  27.57 
 
 
473 aa  114  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  31.54 
 
 
863 aa  111  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0993  chloride channel protein  29.4 
 
 
478 aa  108  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0762  chloride channel core  31.74 
 
 
518 aa  107  3e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000775923  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3458  chloride channel protein  29.4 
 
 
478 aa  108  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.41349  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3329  chloride channel protein  29.4 
 
 
478 aa  108  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  34.36 
 
 
863 aa  106  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3102  chloride channel protein  28.9 
 
 
471 aa  106  9e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2944  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.15 
 
 
526 aa  106  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0120087  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0782  chloride channel protein  27.19 
 
 
479 aa  105  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.12239 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0681  Chloride channel core  28.42 
 
 
538 aa  105  2e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1576  chloride channel protein  30.35 
 
 
463 aa  105  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.803836 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  34.36 
 
 
897 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4719  Cl- channel, voltage-gated family protein  32.35 
 
 
439 aa  104  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4427  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.91 
 
 
439 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.292219 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4200  Cl- channel, voltage gated  31.91 
 
 
439 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.419413  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4266  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.91 
 
 
439 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal  0.948351 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2409  Chloride channel core  33.51 
 
 
435 aa  101  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  27.11 
 
 
519 aa  102  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  33.51 
 
 
875 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  26.14 
 
 
519 aa  99.8  9e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14511  chloride channel  27.64 
 
 
455 aa  99.8  9e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  30.71 
 
 
584 aa  99.4  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4138  Chloride channel core  28.87 
 
 
455 aa  99  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3829  chloride channel core  29.37 
 
 
455 aa  99  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A25  chloride channel protein EriC  28.54 
 
 
510 aa  98.2  3e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1662  voltage-gated chloride channel family protein  28.41 
 
 
523 aa  97.4  4e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0552  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.64 
 
 
437 aa  97.4  5e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1400  chloride channel protein  28.18 
 
 
523 aa  95.9  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.340394  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>