More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4091 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_2964  voltage gated chloride channel family protein  82.63 
 
 
562 aa  706    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1977  chloride channel (ClC) family protein  81.82 
 
 
560 aa  716    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2109  voltage gated chloride channel family protein  81.82 
 
 
551 aa  716    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.732554  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0803  chloride channel (ClC) family protein  81.82 
 
 
576 aa  716    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.781584  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3062  voltage gated chloride channel family protein  82.88 
 
 
576 aa  713    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0948  chloride channel core  89.42 
 
 
520 aa  854    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4091  Cl- channel, voltage gated  100 
 
 
513 aa  1004    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0815105  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3029  chloride channel (ClC) family protein  82.63 
 
 
578 aa  707    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0660  chloride channel core  75.69 
 
 
485 aa  635    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0860  chloride channel core  85.22 
 
 
565 aa  795    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.442414  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2411  chloride channel core  83.75 
 
 
517 aa  780    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1573  voltage gated chloride channel family protein  81.13 
 
 
563 aa  714    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.556285  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0509  Cl- channel, voltage gated  89 
 
 
518 aa  835    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0848  Cl- channel, voltage-gated family protein  86.37 
 
 
521 aa  815    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.17126  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0988  Cl- channel, voltage-gated family protein  89 
 
 
518 aa  835    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170879  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1059  Chloride channel core  80.65 
 
 
474 aa  670    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2635  chloride channel (ClC) family protein  81.82 
 
 
560 aa  716    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2667  putative chloride-channel protein  69.3 
 
 
447 aa  548  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5024  chloride channel core  70.02 
 
 
435 aa  542  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.283632  normal  0.200334 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6367  Chloride channel core  69.12 
 
 
441 aa  534  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6573  Cl- channel, voltage gated  67.61 
 
 
439 aa  530  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.939375  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3866  Chloride channel core  65.13 
 
 
435 aa  500  1e-140  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3980  Chloride channel core  65.13 
 
 
435 aa  500  1e-140  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0608  Chloride channel core  45.43 
 
 
468 aa  328  1.0000000000000001e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.277563  hitchhiker  0.00926023 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0110  voltage gated chloride channel family protein  46.75 
 
 
485 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0419274  hitchhiker  0.00996162 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1155  Cl- channel, voltage gated  43.36 
 
 
440 aa  306  8.000000000000001e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.599671  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3760  chloride channel core  45.05 
 
 
459 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.503672  normal  0.147153 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0773  Chloride channel core  43.91 
 
 
444 aa  296  7e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.80393  normal  0.191961 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6335  Chloride channel core  44.14 
 
 
456 aa  296  8e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0697  Cl- channel, voltage gated  45.8 
 
 
439 aa  295  2e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4712  Cl- channel, voltage-gated family protein  43.08 
 
 
470 aa  295  2e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3820  Cl- channel, voltage-gated family protein  43.6 
 
 
454 aa  288  1e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0706898  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5838  chloride channel core  44.63 
 
 
485 aa  288  1e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.697782 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4474  Chloride channel core  43.22 
 
 
424 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.125667  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1046  Cl- channel, voltage gated  42.18 
 
 
449 aa  281  3e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.0017165  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7107  Chloride channel core  42.65 
 
 
447 aa  279  8e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.134894 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3157  chloride channel core  45.22 
 
 
441 aa  278  1e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.236304  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3051  chloride channel core  40.7 
 
 
449 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156315  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3481  Chloride channel core  44.99 
 
 
441 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.429207  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0350  voltage gated chloride channel family protein  41.19 
 
 
451 aa  273  4.0000000000000004e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.973552  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5971  Chloride channel core  41.46 
 
 
447 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306058  normal  0.236498 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3353  Chloride channel core  44.5 
 
 
441 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641112  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0318  voltage gated chloride channel family protein  41.19 
 
 
490 aa  273  6e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3959  voltage-gated chloride channel family protein  42.09 
 
 
453 aa  272  9e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.536311 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1867  chloride channel, core  41.54 
 
 
453 aa  272  1e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.144395 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3825  Chloride channel core  41.18 
 
 
447 aa  269  1e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04784  chloride channel  40.78 
 
 
464 aa  267  2.9999999999999995e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147054  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6686  Chloride channel core  45.35 
 
 
438 aa  267  4e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.709238  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1380  Chloride channel core  43.82 
 
 
523 aa  266  5.999999999999999e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.332238  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5405  Chloride channel core  45.56 
 
 
437 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0213924  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4258  Chloride channel core  42.51 
 
 
445 aa  265  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0957  chloride channel core  41.95 
 
 
442 aa  262  8.999999999999999e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0796788  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1139  chloride channel protein  40.96 
 
 
440 aa  261  2e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6166  chloride channel core  44.55 
 
 
438 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0747104  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5041  putative H(+)/Cl(-) exchange transporter  42.44 
 
 
445 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3037  Cl- channel, voltage-gated family protein  44.82 
 
 
441 aa  253  8.000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1638  Cl- channel, voltage-gated family protein  37.24 
 
 
436 aa  251  2e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3257  chloride channel core  43.06 
 
 
446 aa  251  2e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3213  Cl- channel, voltage gated  37.95 
 
 
522 aa  218  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1500  Cl- channel, voltage gated  37.3 
 
 
433 aa  202  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3055  Cl- channel, voltage gated  37.73 
 
 
506 aa  196  7e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.938884  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5803  Cl- channel voltage-gated family protein  33.85 
 
 
466 aa  174  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0706283  normal  0.393732 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3116  chloride channel protein  33.18 
 
 
453 aa  169  9e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.958796 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  32.3 
 
 
859 aa  130  4.0000000000000003e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  32.04 
 
 
569 aa  126  8.000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  30.34 
 
 
473 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  30.34 
 
 
473 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0695  chloride channel protein  30.52 
 
 
466 aa  126  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.750689  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  30.34 
 
 
473 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  30.34 
 
 
473 aa  126  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  30.34 
 
 
473 aa  126  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2944  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.94 
 
 
526 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0120087  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3525  Chloride channel core  31.85 
 
 
533 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3102  chloride channel protein  31.65 
 
 
471 aa  117  5e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  27.64 
 
 
519 aa  116  7.999999999999999e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  27.36 
 
 
519 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  32.8 
 
 
862 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A25  chloride channel protein EriC  27.23 
 
 
510 aa  111  4.0000000000000004e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  31.91 
 
 
863 aa  110  7.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0782  chloride channel protein  28.44 
 
 
479 aa  108  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.12239 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0757  Chloride channel core  28.54 
 
 
528 aa  108  2e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.937422  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1147  chloride channel protein EriC  30.41 
 
 
487 aa  108  3e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.433892  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1830  chloride channel protein EriC  27.48 
 
 
512 aa  107  4e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.116382  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14511  chloride channel  29.51 
 
 
455 aa  107  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0993  chloride channel protein  28.73 
 
 
478 aa  107  7e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3458  chloride channel protein  28.73 
 
 
478 aa  107  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.41349  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3329  chloride channel protein  28.73 
 
 
478 aa  106  8e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2810  chloride channel protein  31.03 
 
 
472 aa  105  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1576  chloride channel protein  31.6 
 
 
463 aa  105  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.803836 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1662  voltage-gated chloride channel family protein  26.14 
 
 
523 aa  103  6e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  33.04 
 
 
863 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1400  chloride channel protein  26.63 
 
 
523 aa  102  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.340394  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4719  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.85 
 
 
439 aa  102  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  31.03 
 
 
897 aa  101  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1588  Cl- channel, voltage gated  33.51 
 
 
539 aa  100  9e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000108225  normal  0.782392 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0681  Chloride channel core  25.53 
 
 
538 aa  99  2e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  30.81 
 
 
875 aa  96.7  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  29.12 
 
 
626 aa  96.3  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4200  Cl- channel, voltage gated  30.52 
 
 
439 aa  94.7  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.419413  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4427  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.52 
 
 
439 aa  94.7  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.292219 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>