More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6573 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6573  Cl- channel, voltage gated  100 
 
 
439 aa  863    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.939375  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6367  Chloride channel core  78.47 
 
 
441 aa  620  1e-176  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2667  putative chloride-channel protein  76.16 
 
 
447 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5024  chloride channel core  75.46 
 
 
435 aa  598  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.283632  normal  0.200334 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0848  Cl- channel, voltage-gated family protein  67.84 
 
 
521 aa  545  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.17126  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4091  Cl- channel, voltage gated  67.76 
 
 
513 aa  544  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0815105  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0860  chloride channel core  68.82 
 
 
565 aa  543  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.442414  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2411  chloride channel core  68.08 
 
 
517 aa  543  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1059  Chloride channel core  66.74 
 
 
474 aa  542  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0948  chloride channel core  66.9 
 
 
520 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0660  chloride channel core  69.14 
 
 
485 aa  536  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0509  Cl- channel, voltage gated  66.67 
 
 
518 aa  537  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0988  Cl- channel, voltage-gated family protein  66.67 
 
 
518 aa  537  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170879  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1573  voltage gated chloride channel family protein  65.56 
 
 
563 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.556285  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0803  chloride channel (ClC) family protein  66.75 
 
 
576 aa  508  1e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.781584  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2109  voltage gated chloride channel family protein  66.75 
 
 
551 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.732554  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3062  voltage gated chloride channel family protein  66.75 
 
 
576 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1977  chloride channel (ClC) family protein  66.75 
 
 
560 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3029  chloride channel (ClC) family protein  66.75 
 
 
578 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2635  chloride channel (ClC) family protein  66.75 
 
 
560 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2964  voltage gated chloride channel family protein  66.75 
 
 
562 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3866  Chloride channel core  58.07 
 
 
435 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3980  Chloride channel core  58.07 
 
 
435 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1155  Cl- channel, voltage gated  45.39 
 
 
440 aa  318  1e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.599671  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4712  Cl- channel, voltage-gated family protein  44.06 
 
 
470 aa  296  3e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0608  Chloride channel core  42.96 
 
 
468 aa  291  2e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.277563  hitchhiker  0.00926023 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0110  voltage gated chloride channel family protein  44.58 
 
 
485 aa  291  2e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0419274  hitchhiker  0.00996162 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6335  Chloride channel core  43.36 
 
 
456 aa  286  5.999999999999999e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0697  Cl- channel, voltage gated  44.39 
 
 
439 aa  286  7e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1046  Cl- channel, voltage gated  42.53 
 
 
449 aa  276  4e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.0017165  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3820  Cl- channel, voltage-gated family protein  41.72 
 
 
454 aa  276  4e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0706898  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3760  chloride channel core  43.2 
 
 
459 aa  276  6e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.503672  normal  0.147153 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5838  chloride channel core  43.17 
 
 
485 aa  271  2e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.697782 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3825  Chloride channel core  42.96 
 
 
447 aa  270  2.9999999999999997e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0773  Chloride channel core  42.14 
 
 
444 aa  270  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.80393  normal  0.191961 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0350  voltage gated chloride channel family protein  40.36 
 
 
451 aa  268  1e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.973552  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3051  chloride channel core  40.5 
 
 
449 aa  268  1e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156315  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4474  Chloride channel core  41.98 
 
 
424 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.125667  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0318  voltage gated chloride channel family protein  40.36 
 
 
490 aa  268  2e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04784  chloride channel  42.41 
 
 
464 aa  266  4e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147054  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7107  Chloride channel core  40.55 
 
 
447 aa  262  8.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.134894 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3959  voltage-gated chloride channel family protein  40.67 
 
 
453 aa  257  3e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.536311 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1867  chloride channel, core  40.67 
 
 
453 aa  256  7e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.144395 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0957  chloride channel core  41.49 
 
 
442 aa  255  1.0000000000000001e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0796788  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6686  Chloride channel core  44.08 
 
 
438 aa  252  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.709238  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1380  Chloride channel core  41.49 
 
 
523 aa  250  3e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.332238  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5041  putative H(+)/Cl(-) exchange transporter  45.01 
 
 
445 aa  248  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3353  Chloride channel core  42.93 
 
 
441 aa  247  3e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641112  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3481  Chloride channel core  42.29 
 
 
441 aa  246  6e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.429207  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3157  chloride channel core  42.04 
 
 
441 aa  246  6e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.236304  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3257  chloride channel core  45.21 
 
 
446 aa  243  5e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5971  Chloride channel core  38.71 
 
 
447 aa  242  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306058  normal  0.236498 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1638  Cl- channel, voltage-gated family protein  36.89 
 
 
436 aa  241  1e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5405  Chloride channel core  43.03 
 
 
437 aa  241  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0213924  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4258  Chloride channel core  40.9 
 
 
445 aa  237  3e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1139  chloride channel protein  39.09 
 
 
440 aa  235  1.0000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6166  chloride channel core  44.32 
 
 
438 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0747104  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3037  Cl- channel, voltage-gated family protein  39.32 
 
 
441 aa  225  1e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1500  Cl- channel, voltage gated  39.91 
 
 
433 aa  220  3e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3213  Cl- channel, voltage gated  38.84 
 
 
522 aa  216  5e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3055  Cl- channel, voltage gated  37.91 
 
 
506 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.938884  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3116  chloride channel protein  32.85 
 
 
453 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.958796 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5803  Cl- channel voltage-gated family protein  33.41 
 
 
466 aa  163  5.0000000000000005e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0706283  normal  0.393732 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  30.95 
 
 
473 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  30.95 
 
 
473 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  30.95 
 
 
473 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  30.95 
 
 
473 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  30.95 
 
 
473 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0695  chloride channel protein  29.81 
 
 
466 aa  130  6e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.750689  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3525  Chloride channel core  31.75 
 
 
533 aa  129  7.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  33.87 
 
 
859 aa  126  8.000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3102  chloride channel protein  32.63 
 
 
471 aa  125  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3329  chloride channel protein  29.26 
 
 
478 aa  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3458  chloride channel protein  29.26 
 
 
478 aa  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.41349  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0993  chloride channel protein  29.26 
 
 
478 aa  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  33.72 
 
 
863 aa  118  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  30.13 
 
 
569 aa  117  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  33.49 
 
 
897 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14511  chloride channel  29.72 
 
 
455 aa  112  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0681  Chloride channel core  29.47 
 
 
538 aa  110  6e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2810  chloride channel protein  30.62 
 
 
472 aa  108  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0782  chloride channel protein  28.44 
 
 
479 aa  105  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.12239 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  27.81 
 
 
519 aa  105  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  29.09 
 
 
584 aa  104  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  27.73 
 
 
519 aa  103  5e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4427  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.93 
 
 
439 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.292219 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4200  Cl- channel, voltage gated  31.93 
 
 
439 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.419413  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4266  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.93 
 
 
439 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal  0.948351 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4719  Cl- channel, voltage-gated family protein  32.26 
 
 
439 aa  102  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1576  chloride channel protein  30.65 
 
 
463 aa  101  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.803836 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2285  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.91 
 
 
426 aa  101  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397915  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  31.9 
 
 
875 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2944  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.73 
 
 
526 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0120087  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1107  voltage-gated chloride channel family protein  29.14 
 
 
510 aa  99.8  9e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0552  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.86 
 
 
437 aa  99.8  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  27.44 
 
 
606 aa  99  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2188  Chloride channel core  29.44 
 
 
563 aa  98.6  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000751746  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  28.5 
 
 
470 aa  97.8  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0762  chloride channel core  29.61 
 
 
518 aa  97.8  3e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000775923  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0386  chloride channel protein EriC  28.68 
 
 
457 aa  97.4  4e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000543407 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>