More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A3055 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A3055  Cl- channel, voltage gated  100 
 
 
506 aa  1003    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.938884  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3213  Cl- channel, voltage gated  77.49 
 
 
522 aa  708    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0608  Chloride channel core  42.22 
 
 
468 aa  264  3e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.277563  hitchhiker  0.00926023 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3825  Chloride channel core  43.61 
 
 
447 aa  257  3e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3353  Chloride channel core  42.62 
 
 
441 aa  251  2e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641112  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04784  chloride channel  43.58 
 
 
464 aa  249  7e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147054  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1380  Chloride channel core  42.43 
 
 
523 aa  249  8e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.332238  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1139  chloride channel protein  40.64 
 
 
440 aa  248  2e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3051  chloride channel core  39.48 
 
 
449 aa  248  3e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156315  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3481  Chloride channel core  42.48 
 
 
441 aa  246  6.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.429207  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3157  chloride channel core  42.24 
 
 
441 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.236304  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3760  chloride channel core  41.01 
 
 
459 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.503672  normal  0.147153 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3820  Cl- channel, voltage-gated family protein  42.54 
 
 
454 aa  244  3.9999999999999997e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0706898  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0350  voltage gated chloride channel family protein  39.42 
 
 
451 aa  243  9e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.973552  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3959  voltage-gated chloride channel family protein  41.03 
 
 
453 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.536311 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0318  voltage gated chloride channel family protein  39.42 
 
 
490 aa  241  2e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1155  Cl- channel, voltage gated  40.74 
 
 
440 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.599671  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4712  Cl- channel, voltage-gated family protein  43.42 
 
 
470 aa  241  2.9999999999999997e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1867  chloride channel, core  41.03 
 
 
453 aa  240  5e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.144395 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1638  Cl- channel, voltage-gated family protein  37.32 
 
 
436 aa  239  5.999999999999999e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0110  voltage gated chloride channel family protein  41.56 
 
 
485 aa  236  8e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0419274  hitchhiker  0.00996162 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0773  Chloride channel core  40.76 
 
 
444 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.80393  normal  0.191961 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1573  voltage gated chloride channel family protein  39.21 
 
 
563 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.556285  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6686  Chloride channel core  46.49 
 
 
438 aa  233  5e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.709238  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0697  Cl- channel, voltage gated  42.82 
 
 
439 aa  232  1e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5405  Chloride channel core  41.67 
 
 
437 aa  232  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0213924  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6335  Chloride channel core  40.95 
 
 
456 aa  229  9e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0848  Cl- channel, voltage-gated family protein  39.39 
 
 
521 aa  229  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.17126  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0957  chloride channel core  39.39 
 
 
442 aa  228  2e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0796788  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7107  Chloride channel core  39.76 
 
 
447 aa  228  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.134894 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4091  Cl- channel, voltage gated  37.96 
 
 
513 aa  227  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0815105  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0860  chloride channel core  39.02 
 
 
565 aa  228  3e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.442414  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0948  chloride channel core  38.66 
 
 
520 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1046  Cl- channel, voltage gated  37.8 
 
 
449 aa  227  5.0000000000000005e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.0017165  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0509  Cl- channel, voltage gated  38.66 
 
 
518 aa  226  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4474  Chloride channel core  40.31 
 
 
424 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.125667  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0988  Cl- channel, voltage-gated family protein  38.66 
 
 
518 aa  226  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170879  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2411  chloride channel core  39.33 
 
 
517 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6166  chloride channel core  44.87 
 
 
438 aa  224  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0747104  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3866  Chloride channel core  38.85 
 
 
435 aa  224  4e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3980  Chloride channel core  38.85 
 
 
435 aa  224  4e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5971  Chloride channel core  40.33 
 
 
447 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306058  normal  0.236498 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0803  chloride channel (ClC) family protein  40.14 
 
 
576 aa  223  8e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.781584  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2109  voltage gated chloride channel family protein  40.14 
 
 
551 aa  223  9e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.732554  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2964  voltage gated chloride channel family protein  40.14 
 
 
562 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1977  chloride channel (ClC) family protein  40.14 
 
 
560 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3062  voltage gated chloride channel family protein  40.14 
 
 
576 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3029  chloride channel (ClC) family protein  40.14 
 
 
578 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2635  chloride channel (ClC) family protein  40.14 
 
 
560 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1059  Chloride channel core  37.86 
 
 
474 aa  221  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3037  Cl- channel, voltage-gated family protein  40 
 
 
441 aa  219  7e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0660  chloride channel core  38.86 
 
 
485 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5838  chloride channel core  41.04 
 
 
485 aa  214  2.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.697782 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5024  chloride channel core  39.18 
 
 
435 aa  211  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.283632  normal  0.200334 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6573  Cl- channel, voltage gated  38.14 
 
 
439 aa  211  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.939375  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2667  putative chloride-channel protein  38.7 
 
 
447 aa  210  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3257  chloride channel core  39.29 
 
 
446 aa  206  7e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1500  Cl- channel, voltage gated  38.93 
 
 
433 aa  206  8e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5041  putative H(+)/Cl(-) exchange transporter  41.02 
 
 
445 aa  206  9e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4258  Chloride channel core  38.46 
 
 
445 aa  204  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6367  Chloride channel core  37.13 
 
 
441 aa  200  6e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5803  Cl- channel voltage-gated family protein  31.12 
 
 
466 aa  153  8e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0706283  normal  0.393732 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  33.25 
 
 
569 aa  140  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3116  chloride channel protein  28.4 
 
 
453 aa  138  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.958796 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  33.91 
 
 
859 aa  131  3e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  29.26 
 
 
519 aa  119  9e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  32.14 
 
 
598 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1662  voltage-gated chloride channel family protein  31.23 
 
 
523 aa  116  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1400  chloride channel protein  31.23 
 
 
523 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.340394  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  28.75 
 
 
519 aa  114  6e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  30 
 
 
863 aa  113  9e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0695  chloride channel protein  30.37 
 
 
466 aa  113  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.750689  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1576  chloride channel protein  30.99 
 
 
463 aa  112  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.803836 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  31.87 
 
 
626 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3525  Chloride channel core  32.08 
 
 
533 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2944  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.66 
 
 
526 aa  110  6e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0120087  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  29.92 
 
 
473 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  29.92 
 
 
473 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  29.92 
 
 
473 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  33.43 
 
 
591 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  29.65 
 
 
473 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  31.19 
 
 
862 aa  108  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  29.65 
 
 
473 aa  108  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  29.44 
 
 
875 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6342  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  32.27 
 
 
589 aa  107  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867968  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1737  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  32.27 
 
 
589 aa  107  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.98 
 
 
589 aa  107  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2188  Chloride channel core  31.3 
 
 
563 aa  106  9e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000751746  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2680  Chloride channel core  30.6 
 
 
879 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2283  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.75 
 
 
591 aa  106  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3436  Chloride channel core  30.6 
 
 
879 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  33.43 
 
 
593 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  32.62 
 
 
593 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.42 
 
 
636 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.42 
 
 
579 aa  103  9e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.42 
 
 
579 aa  103  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.42 
 
 
579 aa  103  9e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  31.94 
 
 
897 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.86 
 
 
628 aa  103  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A25  chloride channel protein EriC  26.88 
 
 
510 aa  101  3e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>