More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6335 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_6335  Chloride channel core  100 
 
 		 456 aa  880    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3820  Cl- channel, voltage-gated family protein  68.13 
 
 		 454 aa  549  1e-155  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0706898  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4712  Cl- channel, voltage-gated family protein  70.18 
 
 		 470 aa  549  1e-155  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5838  chloride channel core  68.98 
 
 		 485 aa  517  1.0000000000000001e-145  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.697782 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0110  voltage gated chloride channel family protein  61.67 
 
 		 485 aa  442  1e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0419274  hitchhiker  0.00996162 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1155  Cl- channel, voltage gated  57.7 
 
 		 440 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.599671  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3257  chloride channel core  59.27 
 
 		 446 aa  427  1e-118  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1059  Chloride channel core  44.24 
 
 		 474 aa  310  4e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0848  Cl- channel, voltage-gated family protein  45.54 
 
 		 521 aa  309  9e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.17126  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0860  chloride channel core  45.56 
 
 		 565 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.442414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1573  voltage gated chloride channel family protein  45.56 
 
 		 563 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.556285  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0509  Cl- channel, voltage gated  46.08 
 
 		 518 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0988  Cl- channel, voltage-gated family protein  46.08 
 
 		 518 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170879  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0948  chloride channel core  46.06 
 
 		 520 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2411  chloride channel core  46.41 
 
 		 517 aa  299  7e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4091  Cl- channel, voltage gated  44.66 
 
 		 513 aa  296  4e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0815105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2667  putative chloride-channel protein  44.63 
 
 		 447 aa  293  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1977  chloride channel (ClC) family protein  44.88 
 
 		 560 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0803  chloride channel (ClC) family protein  44.68 
 
 		 576 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.781584  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2635  chloride channel (ClC) family protein  44.88 
 
 		 560 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2109  voltage gated chloride channel family protein  44.88 
 
 		 551 aa  286  7e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.732554  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3062  voltage gated chloride channel family protein  44.88 
 
 		 576 aa  286  8e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2964  voltage gated chloride channel family protein  45.08 
 
 		 562 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3029  chloride channel (ClC) family protein  44.87 
 
 		 578 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0608  Chloride channel core  40.17 
 
 		 468 aa  278  2e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.277563  hitchhiker  0.00926023 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6367  Chloride channel core  44.47 
 
 		 441 aa  278  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5024  chloride channel core  43.68 
 
 		 435 aa  277  4e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.283632  normal  0.200334 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3866  Chloride channel core  45.01 
 
 		 435 aa  275  9e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3980  Chloride channel core  45.01 
 
 		 435 aa  275  9e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6573  Cl- channel, voltage gated  42.32 
 
 		 439 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.939375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0660  chloride channel core  44.12 
 
 		 485 aa  272  9e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0697  Cl- channel, voltage gated  44.94 
 
 		 439 aa  267  2.9999999999999995e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1380  Chloride channel core  43.22 
 
 		 523 aa  252  8.000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.332238  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0350  voltage gated chloride channel family protein  41.61 
 
 		 451 aa  247  3e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.973552  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0318  voltage gated chloride channel family protein  41.61 
 
 		 490 aa  247  3e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3051  chloride channel core  41.84 
 
 		 449 aa  246  6e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156315  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3760  chloride channel core  44.1 
 
 		 459 aa  243  5e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.503672  normal  0.147153 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0773  Chloride channel core  43.2 
 
 		 444 aa  243  7e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.80393  normal  0.191961 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3353  Chloride channel core  42.65 
 
 		 441 aa  242  9e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04784  chloride channel  42.55 
 
 		 464 aa  239  5.999999999999999e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147054  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3825  Chloride channel core  39.82 
 
 		 447 aa  239  8e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5041  putative H(+)/Cl(-) exchange transporter  44.62 
 
 		 445 aa  238  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4474  Chloride channel core  43.8 
 
 		 424 aa  237  3e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.125667  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7107  Chloride channel core  40 
 
 		 447 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.134894 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1638  Cl- channel, voltage-gated family protein  39.86 
 
 		 436 aa  230  3e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3481  Chloride channel core  43.4 
 
 		 441 aa  230  4e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.429207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3157  chloride channel core  42.69 
 
 		 441 aa  229  5e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.236304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5405  Chloride channel core  43.41 
 
 		 437 aa  229  7e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0213924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0957  chloride channel core  38.41 
 
 		 442 aa  229  7e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0796788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1139  chloride channel protein  40.5 
 
 		 440 aa  228  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1046  Cl- channel, voltage gated  40.28 
 
 		 449 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.0017165  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3959  voltage-gated chloride channel family protein  39.82 
 
 		 453 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.536311 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5971  Chloride channel core  38.94 
 
 		 447 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306058  normal  0.236498 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6686  Chloride channel core  44.2 
 
 		 438 aa  222  8e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.709238  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1867  chloride channel, core  40.09 
 
 		 453 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.144395 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3213  Cl- channel, voltage gated  39.82 
 
 		 522 aa  217  4e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4258  Chloride channel core  40.37 
 
 		 445 aa  212  9e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1500  Cl- channel, voltage gated  39.15 
 
 		 433 aa  211  2e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6166  chloride channel core  43.3 
 
 		 438 aa  209  6e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0747104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3055  Cl- channel, voltage gated  40.71 
 
 		 506 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.938884  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3037  Cl- channel, voltage-gated family protein  40.05 
 
 		 441 aa  196  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3116  chloride channel protein  29.1 
 
 		 453 aa  176  9.999999999999999e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.958796 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5803  Cl- channel voltage-gated family protein  33.86 
 
 		 466 aa  151  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0706283  normal  0.393732 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  35.23 
 
 		 569 aa  151  3e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4627  hypothetical protein  70.1 
 
 		 173 aa  131  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1576  chloride channel protein  32.22 
 
 		 463 aa  128  3e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.803836 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  31.37 
 
 		 859 aa  128  3e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  29.6 
 
 		 519 aa  125  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2188  Chloride channel core  28.1 
 
 		 563 aa  124  3e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000751746  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  28.15 
 
 		 519 aa  124  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2944  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.81 
 
 		 526 aa  124  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0120087  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3102  chloride channel protein  30.46 
 
 		 471 aa  124  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  30.91 
 
 		 473 aa  124  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  30.91 
 
 		 473 aa  124  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  30.87 
 
 		 473 aa  124  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  30.87 
 
 		 473 aa  124  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  30.91 
 
 		 473 aa  124  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal  1 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  31.07 
 
 		 863 aa  124  5e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3525  Chloride channel core  32.05 
 
 		 533 aa  122  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0782  chloride channel protein  30.11 
 
 		 479 aa  121  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.12239 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  34.85 
 
 		 862 aa  119  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0552  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.68 
 
 		 437 aa  119  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0695  chloride channel protein  29.72 
 
 		 466 aa  117  3.9999999999999997e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.750689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0681  Chloride channel core  25.67 
 
 		 538 aa  116  8.999999999999998e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A25  chloride channel protein EriC  27.25 
 
 		 510 aa  115  1.0000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1662  voltage-gated chloride channel family protein  28.12 
 
 		 523 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1400  chloride channel protein  28.12 
 
 		 523 aa  114  5e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.340394  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1830  chloride channel protein EriC  29.07 
 
 		 512 aa  114  5e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.116382  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2810  chloride channel protein  31.82 
 
 		 472 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1107  voltage-gated chloride channel family protein  27.1 
 
 		 510 aa  108  2e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0757  Chloride channel core  28.96 
 
 		 528 aa  107  3e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.937422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  32.7 
 
 		 589 aa  108  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3458  chloride channel protein  28.94 
 
 		 478 aa  107  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.41349  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0993  chloride channel protein  28.94 
 
 		 478 aa  107  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3329  chloride channel protein  28.94 
 
 		 478 aa  107  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  31.79 
 
 		 897 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  35.65 
 
 		 628 aa  106  7e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  32.06 
 
 		 598 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1588  Cl- channel, voltage gated  34.32 
 
 		 539 aa  105  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000108225  normal  0.782392 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0866  chloride channel protein  28.46 
 
 		 470 aa  104  4e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0280286  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>