More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3825 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04784  chloride channel  81.74 
 
 		 464 aa  662    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147054  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3825  Chloride channel core  100 
 
 		 447 aa  867    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1867  chloride channel, core  54.41 
 
 		 453 aa  363  4e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.144395 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3959  voltage-gated chloride channel family protein  54.17 
 
 		 453 aa  362  8e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.536311 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0608  Chloride channel core  46.77 
 
 		 468 aa  350  3e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.277563  hitchhiker  0.00926023 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3760  chloride channel core  48.5 
 
 		 459 aa  325  9e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.503672  normal  0.147153 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3157  chloride channel core  49.88 
 
 		 441 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.236304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3481  Chloride channel core  49.88 
 
 		 441 aa  306  6e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.429207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3353  Chloride channel core  49.4 
 
 		 441 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5405  Chloride channel core  47.18 
 
 		 437 aa  301  1e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0213924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4474  Chloride channel core  44.6 
 
 		 424 aa  297  2e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.125667  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1059  Chloride channel core  42.96 
 
 		 474 aa  291  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4258  Chloride channel core  46.72 
 
 		 445 aa  286  5e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0957  chloride channel core  45.79 
 
 		 442 aa  282  1e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0796788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0948  chloride channel core  42.54 
 
 		 520 aa  282  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0509  Cl- channel, voltage gated  42.54 
 
 		 518 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0988  Cl- channel, voltage-gated family protein  42.54 
 
 		 518 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170879  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4091  Cl- channel, voltage gated  41.61 
 
 		 513 aa  278  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0815105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0848  Cl- channel, voltage-gated family protein  40.92 
 
 		 521 aa  277  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.17126  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0860  chloride channel core  41.55 
 
 		 565 aa  276  8e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.442414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6573  Cl- channel, voltage gated  42.73 
 
 		 439 aa  274  3e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.939375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2411  chloride channel core  42.44 
 
 		 517 aa  273  3e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2667  putative chloride-channel protein  42.69 
 
 		 447 aa  272  7e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5024  chloride channel core  42.65 
 
 		 435 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.283632  normal  0.200334 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1573  voltage gated chloride channel family protein  40.43 
 
 		 563 aa  271  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.556285  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1139  chloride channel protein  44.66 
 
 		 440 aa  269  5.9999999999999995e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6686  Chloride channel core  48.89 
 
 		 438 aa  268  1e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.709238  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3051  chloride channel core  39.68 
 
 		 449 aa  268  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156315  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0350  voltage gated chloride channel family protein  40.38 
 
 		 451 aa  266  5.999999999999999e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.973552  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1046  Cl- channel, voltage gated  42.56 
 
 		 449 aa  266  7e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.0017165  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0318  voltage gated chloride channel family protein  40.38 
 
 		 490 aa  266  7e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3866  Chloride channel core  42.46 
 
 		 435 aa  265  1e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3980  Chloride channel core  42.46 
 
 		 435 aa  265  1e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1638  Cl- channel, voltage-gated family protein  39.27 
 
 		 436 aa  263  4.999999999999999e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6367  Chloride channel core  40.82 
 
 		 441 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0773  Chloride channel core  43.58 
 
 		 444 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.80393  normal  0.191961 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5971  Chloride channel core  44.31 
 
 		 447 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306058  normal  0.236498 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1380  Chloride channel core  44.87 
 
 		 523 aa  261  2e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.332238  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5041  putative H(+)/Cl(-) exchange transporter  43.31 
 
 		 445 aa  261  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7107  Chloride channel core  43.58 
 
 		 447 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.134894 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2109  voltage gated chloride channel family protein  41.39 
 
 		 551 aa  257  4e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.732554  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0803  chloride channel (ClC) family protein  41.39 
 
 		 576 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.781584  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1977  chloride channel (ClC) family protein  41.39 
 
 		 560 aa  256  5e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3029  chloride channel (ClC) family protein  41.39 
 
 		 578 aa  256  5e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2635  chloride channel (ClC) family protein  41.39 
 
 		 560 aa  256  5e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3062  voltage gated chloride channel family protein  41.39 
 
 		 576 aa  256  6e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2964  voltage gated chloride channel family protein  41.39 
 
 		 562 aa  256  6e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0660  chloride channel core  40.92 
 
 		 485 aa  253  7e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4712  Cl- channel, voltage-gated family protein  40.32 
 
 		 470 aa  251  1e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6166  chloride channel core  47.98 
 
 		 438 aa  251  1e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0747104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6335  Chloride channel core  39.82 
 
 		 456 aa  249  8e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3055  Cl- channel, voltage gated  43.61 
 
 		 506 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.938884  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1500  Cl- channel, voltage gated  43.28 
 
 		 433 aa  247  3e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0110  voltage gated chloride channel family protein  42.11 
 
 		 485 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0419274  hitchhiker  0.00996162 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3213  Cl- channel, voltage gated  41.32 
 
 		 522 aa  243  6e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1155  Cl- channel, voltage gated  42.38 
 
 		 440 aa  240  5e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.599671  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3037  Cl- channel, voltage-gated family protein  43.78 
 
 		 441 aa  235  1.0000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3820  Cl- channel, voltage-gated family protein  38.94 
 
 		 454 aa  233  4.0000000000000004e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0706898  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5838  chloride channel core  41.11 
 
 		 485 aa  233  4.0000000000000004e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.697782 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0697  Cl- channel, voltage gated  42.12 
 
 		 439 aa  228  2e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3257  chloride channel core  38.12 
 
 		 446 aa  206  5e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3116  chloride channel protein  30.96 
 
 		 453 aa  162  9e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.958796 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5803  Cl- channel voltage-gated family protein  33.98 
 
 		 466 aa  158  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0706283  normal  0.393732 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  34.09 
 
 		 569 aa  127  5e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1639  Cl- channel voltage-gated family protein  31.33 
 
 		 597 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  31.91 
 
 		 859 aa  116  8.999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  34.58 
 
 		 897 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14511  chloride channel  30.66 
 
 		 455 aa  113  6e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  28.71 
 
 		 519 aa  113  6e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  28.47 
 
 		 519 aa  112  9e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0386  chloride channel protein EriC  27.67 
 
 		 457 aa  111  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000543407 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2409  Chloride channel core  33.88 
 
 		 435 aa  110  5e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0695  chloride channel protein  30.9 
 
 		 466 aa  110  7.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.750689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3525  Chloride channel core  30.88 
 
 		 533 aa  109  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  30 
 
 		 473 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  29.2 
 
 		 473 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  29.2 
 
 		 473 aa  108  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  29.2 
 
 		 473 aa  108  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  29.2 
 
 		 473 aa  108  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  30.41 
 
 		 863 aa  107  4e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.62 
 
 		 582 aa  107  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2188  Chloride channel core  28.63 
 
 		 563 aa  107  6e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000751746  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1830  chloride channel protein EriC  29.3 
 
 		 512 aa  106  8e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.116382  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0552  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.05 
 
 		 437 aa  106  9e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  30.95 
 
 		 626 aa  104  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  30.22 
 
 		 470 aa  102  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3102  chloride channel protein  31.37 
 
 		 471 aa  101  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2285  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  34.14 
 
 		 426 aa  101  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397915  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2944  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.29 
 
 		 526 aa  101  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0120087  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1576  chloride channel protein  30.26 
 
 		 463 aa  99.8  9e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.803836 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.48 
 
 		 598 aa  98.6  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0455  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  35.49 
 
 		 560 aa  98.6  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2176  chloride channel protein  29.05 
 
 		 466 aa  98.6  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.462447  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  30.35 
 
 		 584 aa  98.2  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2543  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.97 
 
 		 591 aa  97.8  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.232119  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3329  chloride channel protein  28.16 
 
 		 478 aa  97.8  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  33.7 
 
 		 875 aa  97.8  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1867  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.25 
 
 		 414 aa  97.8  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.396231  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3458  chloride channel protein  28.4 
 
 		 478 aa  97.4  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.41349  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0993  chloride channel protein  28.4 
 
 		 478 aa  97.4  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>