More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_14511 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_14511  chloride channel  100 
 
 
455 aa  880    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0608  Chloride channel core  30.13 
 
 
468 aa  117  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.277563  hitchhiker  0.00926023 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1638  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.64 
 
 
436 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0660  chloride channel core  30.89 
 
 
485 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3051  chloride channel core  27.73 
 
 
449 aa  109  9.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156315  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1155  Cl- channel, voltage gated  33.08 
 
 
440 aa  109  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.599671  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4091  Cl- channel, voltage gated  29.76 
 
 
513 aa  107  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0815105  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0948  chloride channel core  30.08 
 
 
520 aa  107  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0509  Cl- channel, voltage gated  29.97 
 
 
518 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0988  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.97 
 
 
518 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170879  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0757  Chloride channel core  24.01 
 
 
528 aa  105  2e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.937422  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6367  Chloride channel core  31.69 
 
 
441 aa  104  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4474  Chloride channel core  30.18 
 
 
424 aa  104  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.125667  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0773  Chloride channel core  27.27 
 
 
444 aa  103  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.80393  normal  0.191961 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0350  voltage gated chloride channel family protein  27.47 
 
 
451 aa  102  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.973552  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1059  Chloride channel core  29.79 
 
 
474 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  29.27 
 
 
863 aa  102  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0318  voltage gated chloride channel family protein  27.47 
 
 
490 aa  102  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6573  Cl- channel, voltage gated  29.72 
 
 
439 aa  102  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.939375  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7107  Chloride channel core  28.39 
 
 
447 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.134894 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1573  voltage gated chloride channel family protein  30.69 
 
 
563 aa  102  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.556285  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04784  chloride channel  31.87 
 
 
464 aa  101  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147054  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3825  Chloride channel core  29.83 
 
 
447 aa  100  4e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  24.87 
 
 
519 aa  100  7e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0110  voltage gated chloride channel family protein  31.44 
 
 
485 aa  99.8  9e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0419274  hitchhiker  0.00996162 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1046  Cl- channel, voltage gated  27.53 
 
 
449 aa  99.8  9e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.0017165  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0860  chloride channel core  28.08 
 
 
565 aa  99.4  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.442414  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5971  Chloride channel core  28.68 
 
 
447 aa  98.6  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306058  normal  0.236498 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2667  putative chloride-channel protein  28.61 
 
 
447 aa  99  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3116  chloride channel protein  25.95 
 
 
453 aa  98.6  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.958796 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3980  Chloride channel core  27.38 
 
 
435 aa  98.6  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0848  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.01 
 
 
521 aa  98.6  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.17126  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2411  chloride channel core  29.19 
 
 
517 aa  98.2  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3866  Chloride channel core  27.38 
 
 
435 aa  98.6  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5024  chloride channel core  27.53 
 
 
435 aa  97.1  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.283632  normal  0.200334 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3029  chloride channel (ClC) family protein  30.69 
 
 
578 aa  96.7  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2964  voltage gated chloride channel family protein  30.69 
 
 
562 aa  96.7  8e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0803  chloride channel (ClC) family protein  30.69 
 
 
576 aa  96.3  9e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.781584  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1977  chloride channel (ClC) family protein  30.69 
 
 
560 aa  96.3  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2109  voltage gated chloride channel family protein  30.69 
 
 
551 aa  96.3  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.732554  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3062  voltage gated chloride channel family protein  30.69 
 
 
576 aa  96.3  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1500  Cl- channel, voltage gated  28.49 
 
 
433 aa  96.3  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2635  chloride channel (ClC) family protein  30.69 
 
 
560 aa  96.3  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3820  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.03 
 
 
454 aa  95.5  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0706898  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2188  Chloride channel core  27.11 
 
 
563 aa  95.1  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000751746  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  25.32 
 
 
519 aa  95.1  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0957  chloride channel core  29.21 
 
 
442 aa  93.2  8e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0796788  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  26.83 
 
 
569 aa  93.2  9e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4712  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.03 
 
 
470 aa  92.8  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  28.88 
 
 
473 aa  92.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  28.88 
 
 
473 aa  92.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  28.5 
 
 
473 aa  92  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  28.5 
 
 
473 aa  92  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  28.5 
 
 
473 aa  92  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1867  chloride channel, core  29.71 
 
 
453 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.144395 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3959  voltage-gated chloride channel family protein  29.57 
 
 
453 aa  90.1  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.536311 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  31.44 
 
 
859 aa  89.7  9e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6335  Chloride channel core  31.89 
 
 
456 aa  89.7  9e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1139  chloride channel protein  28.61 
 
 
440 aa  89  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5041  putative H(+)/Cl(-) exchange transporter  28.21 
 
 
445 aa  88.6  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3213  Cl- channel, voltage gated  30.45 
 
 
522 aa  86.7  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3458  chloride channel protein  26.7 
 
 
478 aa  85.9  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.41349  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0993  chloride channel protein  26.7 
 
 
478 aa  85.9  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A25  chloride channel protein EriC  26.44 
 
 
510 aa  85.9  0.000000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5838  chloride channel core  28.3 
 
 
485 aa  85.9  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.697782 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4719  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.88 
 
 
439 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4427  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.34 
 
 
439 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.292219 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4200  Cl- channel, voltage gated  28.34 
 
 
439 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.419413  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3329  chloride channel protein  26.7 
 
 
478 aa  85.5  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4266  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.34 
 
 
439 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal  0.948351 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6686  Chloride channel core  28.61 
 
 
438 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.709238  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3760  chloride channel core  28.79 
 
 
459 aa  84  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.503672  normal  0.147153 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3102  chloride channel protein  28.28 
 
 
471 aa  84  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1830  chloride channel protein EriC  26.32 
 
 
512 aa  83.2  0.000000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.116382  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0697  Cl- channel, voltage gated  29.09 
 
 
439 aa  83.2  0.000000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0695  chloride channel protein  28.77 
 
 
466 aa  83.2  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.750689  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1576  chloride channel protein  27.51 
 
 
463 aa  82.8  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.803836 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2437  chloride channel core  26.61 
 
 
629 aa  82  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.276438  normal  0.470563 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0782  chloride channel protein  26.91 
 
 
479 aa  82  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.12239 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2944  Cl- channel, voltage-gated family protein  25.47 
 
 
526 aa  82  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0120087  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3037  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.14 
 
 
441 aa  82.4  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0762  chloride channel core  26.36 
 
 
518 aa  81.3  0.00000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000775923  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5405  Chloride channel core  30.08 
 
 
437 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0213924  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4920  Cl- channel, voltage-gated family protein  20.76 
 
 
426 aa  79.7  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0681  Chloride channel core  25.14 
 
 
538 aa  79  0.0000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0189  chloride channel, core  25.51 
 
 
445 aa  78.2  0.0000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1380  Chloride channel core  29.44 
 
 
523 aa  78.2  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.332238  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0147  chloride channel protein  27.21 
 
 
473 aa  77.8  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5803  Cl- channel voltage-gated family protein  26.32 
 
 
466 aa  76.6  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0706283  normal  0.393732 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  29.4 
 
 
862 aa  75.1  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0866  chloride channel protein  25.54 
 
 
470 aa  75.9  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0280286  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4258  Chloride channel core  29.33 
 
 
445 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  27.99 
 
 
875 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2144  Cl- channel voltage-gated family protein  27.44 
 
 
604 aa  75.1  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2285  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.38 
 
 
426 aa  74.7  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397915  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  31.28 
 
 
897 aa  75.1  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0159  chloride channel protein  25.62 
 
 
473 aa  74.3  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0167  chloride channel protein  25.62 
 
 
473 aa  74.3  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0165  chloride channel protein  25.62 
 
 
473 aa  74.3  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0386  chloride channel protein EriC  24.32 
 
 
457 aa  74.3  0.000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000543407 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>