More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3213 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A3055  Cl- channel, voltage gated  77.49 
 
 		 506 aa  682    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.938884  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3213  Cl- channel, voltage gated  100 
 
 		 522 aa  1041    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0608  Chloride channel core  42.22 
 
 		 468 aa  259  8e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.277563  hitchhiker  0.00926023 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1380  Chloride channel core  42.68 
 
 		 523 aa  250  5e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.332238  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1638  Cl- channel, voltage-gated family protein  38.85 
 
 		 436 aa  249  1e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3959  voltage-gated chloride channel family protein  42.51 
 
 		 453 aa  247  4e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.536311 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3760  chloride channel core  43.13 
 
 		 459 aa  247  4e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.503672  normal  0.147153 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3051  chloride channel core  39.23 
 
 		 449 aa  246  8e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156315  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1867  chloride channel, core  42.51 
 
 		 453 aa  246  8e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.144395 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04784  chloride channel  43.2 
 
 		 464 aa  245  1.9999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147054  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0110  voltage gated chloride channel family protein  42.28 
 
 		 485 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0419274  hitchhiker  0.00996162 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3353  Chloride channel core  41.76 
 
 		 441 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6686  Chloride channel core  47.15 
 
 		 438 aa  239  9e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.709238  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0957  chloride channel core  40.09 
 
 		 442 aa  238  1e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0796788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3481  Chloride channel core  42.46 
 
 		 441 aa  238  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.429207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1573  voltage gated chloride channel family protein  39.69 
 
 		 563 aa  238  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.556285  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3825  Chloride channel core  41.12 
 
 		 447 aa  238  2e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3157  chloride channel core  42.23 
 
 		 441 aa  237  3e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.236304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0697  Cl- channel, voltage gated  43.29 
 
 		 439 aa  237  4e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0773  Chloride channel core  41.49 
 
 		 444 aa  236  7e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.80393  normal  0.191961 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1155  Cl- channel, voltage gated  39.9 
 
 		 440 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.599671  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0318  voltage gated chloride channel family protein  36.97 
 
 		 490 aa  235  1.0000000000000001e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3866  Chloride channel core  40.53 
 
 		 435 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0350  voltage gated chloride channel family protein  38.89 
 
 		 451 aa  235  2.0000000000000002e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.973552  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3980  Chloride channel core  40.53 
 
 		 435 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3820  Cl- channel, voltage-gated family protein  39.69 
 
 		 454 aa  234  3e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0706898  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0948  chloride channel core  39.58 
 
 		 520 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0509  Cl- channel, voltage gated  39.58 
 
 		 518 aa  233  9e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0988  Cl- channel, voltage-gated family protein  39.58 
 
 		 518 aa  233  9e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170879  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6335  Chloride channel core  39.82 
 
 		 456 aa  232  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4091  Cl- channel, voltage gated  38.66 
 
 		 513 aa  231  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0815105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4474  Chloride channel core  41.33 
 
 		 424 aa  231  3e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.125667  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4712  Cl- channel, voltage-gated family protein  40.09 
 
 		 470 aa  230  4e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0860  chloride channel core  39.49 
 
 		 565 aa  229  7e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.442414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1059  Chloride channel core  37.61 
 
 		 474 aa  229  9e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2411  chloride channel core  40.05 
 
 		 517 aa  228  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1139  chloride channel protein  40.7 
 
 		 440 aa  228  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0848  Cl- channel, voltage-gated family protein  38.89 
 
 		 521 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.17126  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5405  Chloride channel core  42.93 
 
 		 437 aa  228  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0213924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6166  chloride channel core  47.09 
 
 		 438 aa  224  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0747104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0660  chloride channel core  39.72 
 
 		 485 aa  224  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7107  Chloride channel core  39.1 
 
 		 447 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.134894 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1046  Cl- channel, voltage gated  36.72 
 
 		 449 aa  219  7e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.0017165  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2635  chloride channel (ClC) family protein  40.5 
 
 		 560 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2109  voltage gated chloride channel family protein  40.5 
 
 		 551 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.732554  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3062  voltage gated chloride channel family protein  39.91 
 
 		 576 aa  219  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0803  chloride channel (ClC) family protein  40.5 
 
 		 576 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.781584  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3029  chloride channel (ClC) family protein  40.5 
 
 		 578 aa  219  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1977  chloride channel (ClC) family protein  40.5 
 
 		 560 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2964  voltage gated chloride channel family protein  40.5 
 
 		 562 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6573  Cl- channel, voltage gated  38.84 
 
 		 439 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.939375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5041  putative H(+)/Cl(-) exchange transporter  42.25 
 
 		 445 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1500  Cl- channel, voltage gated  39.81 
 
 		 433 aa  213  5.999999999999999e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5971  Chloride channel core  39 
 
 		 447 aa  212  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306058  normal  0.236498 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5838  chloride channel core  39.46 
 
 		 485 aa  211  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.697782 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6367  Chloride channel core  38.04 
 
 		 441 aa  209  7e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5024  chloride channel core  38.18 
 
 		 435 aa  209  9e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.283632  normal  0.200334 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3037  Cl- channel, voltage-gated family protein  37.99 
 
 		 441 aa  207  3e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2667  putative chloride-channel protein  37.59 
 
 		 447 aa  204  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4258  Chloride channel core  40.43 
 
 		 445 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3257  chloride channel core  37.42 
 
 		 446 aa  192  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5803  Cl- channel voltage-gated family protein  31.39 
 
 		 466 aa  160  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0706283  normal  0.393732 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3116  chloride channel protein  30.1 
 
 		 453 aa  149  9e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.958796 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  34.4 
 
 		 859 aa  135  1.9999999999999998e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  32.05 
 
 		 569 aa  133  7.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0695  chloride channel protein  30.73 
 
 		 466 aa  123  7e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.750689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  28.99 
 
 		 519 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  32.29 
 
 		 626 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  28.75 
 
 		 519 aa  116  8.999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2944  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.96 
 
 		 526 aa  114  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0120087  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2188  Chloride channel core  31 
 
 		 563 aa  114  6e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000751746  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3525  Chloride channel core  31.94 
 
 		 533 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  29.81 
 
 		 473 aa  110  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  29.81 
 
 		 473 aa  110  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  29.81 
 
 		 473 aa  110  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  29.54 
 
 		 473 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  29.54 
 
 		 473 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A25  chloride channel protein EriC  28.1 
 
 		 510 aa  109  2e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1662  voltage-gated chloride channel family protein  30.02 
 
 		 523 aa  108  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  30.59 
 
 		 863 aa  108  4e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1400  chloride channel protein  30.02 
 
 		 523 aa  107  5e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.340394  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14511  chloride channel  30.69 
 
 		 455 aa  103  7e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2543  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.55 
 
 		 591 aa  103  8e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.232119  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1830  chloride channel protein EriC  26.97 
 
 		 512 aa  103  1e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.116382  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  30.93 
 
 		 897 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  34.69 
 
 		 608 aa  102  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3102  chloride channel protein  29.05 
 
 		 471 aa  101  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30 
 
 		 598 aa  101  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11720  Chloride channel core  28.76 
 
 		 402 aa  99.8  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000807988  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0782  chloride channel protein  27.24 
 
 		 479 aa  99.8  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.12239 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0757  Chloride channel core  27.23 
 
 		 528 aa  99  2e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.937422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.33 
 
 		 587 aa  98.6  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1576  chloride channel protein  29.65 
 
 		 463 aa  98.6  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.803836 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2446  chloride channel core  29.27 
 
 		 603 aa  98.6  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3436  Chloride channel core  30.4 
 
 		 879 aa  97.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2680  Chloride channel core  30.4 
 
 		 879 aa  97.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  30.34 
 
 		 584 aa  97.1  7e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0681  Chloride channel core  29.67 
 
 		 538 aa  97.1  7e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6434  Chloride channel core  31.57 
 
 		 600 aa  95.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0552  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.37 
 
 		 437 aa  95.9  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>