More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1638 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1638  Cl- channel, voltage-gated family protein  100 
 
 
436 aa  863    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0608  Chloride channel core  43.65 
 
 
468 aa  332  7.000000000000001e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.277563  hitchhiker  0.00926023 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4474  Chloride channel core  45.97 
 
 
424 aa  307  3e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.125667  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0957  chloride channel core  42.65 
 
 
442 aa  300  4e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0796788  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3481  Chloride channel core  44.28 
 
 
441 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.429207  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3353  Chloride channel core  44.04 
 
 
441 aa  288  2e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641112  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3157  chloride channel core  43.8 
 
 
441 aa  287  2e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.236304  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5405  Chloride channel core  43.28 
 
 
437 aa  286  5e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0213924  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3760  chloride channel core  41.37 
 
 
459 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.503672  normal  0.147153 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5041  putative H(+)/Cl(-) exchange transporter  44.5 
 
 
445 aa  281  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0350  voltage gated chloride channel family protein  41.16 
 
 
451 aa  280  3e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.973552  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0318  voltage gated chloride channel family protein  41.71 
 
 
490 aa  280  5e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4258  Chloride channel core  42.58 
 
 
445 aa  279  8e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3051  chloride channel core  42.59 
 
 
449 aa  276  3e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156315  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1139  chloride channel protein  43.33 
 
 
440 aa  271  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1046  Cl- channel, voltage gated  41.53 
 
 
449 aa  271  2e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.0017165  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1380  Chloride channel core  41.61 
 
 
523 aa  265  8.999999999999999e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.332238  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6686  Chloride channel core  41.23 
 
 
438 aa  262  8e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.709238  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0773  Chloride channel core  41.9 
 
 
444 aa  258  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.80393  normal  0.191961 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3959  voltage-gated chloride channel family protein  39.02 
 
 
453 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.536311 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7107  Chloride channel core  42.55 
 
 
447 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.134894 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3980  Chloride channel core  40.62 
 
 
435 aa  251  2e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3866  Chloride channel core  40.62 
 
 
435 aa  251  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1867  chloride channel, core  38.79 
 
 
453 aa  250  4e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.144395 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04784  chloride channel  40.19 
 
 
464 aa  248  1e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147054  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1059  Chloride channel core  37.41 
 
 
474 aa  246  4e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5971  Chloride channel core  41.35 
 
 
447 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306058  normal  0.236498 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1573  voltage gated chloride channel family protein  38.61 
 
 
563 aa  238  1e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.556285  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3037  Cl- channel, voltage-gated family protein  44.52 
 
 
441 aa  238  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6166  chloride channel core  43.16 
 
 
438 aa  237  3e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0747104  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0948  chloride channel core  37.59 
 
 
520 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4091  Cl- channel, voltage gated  37.59 
 
 
513 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0815105  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3825  Chloride channel core  39.27 
 
 
447 aa  234  2.0000000000000002e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0509  Cl- channel, voltage gated  37.59 
 
 
518 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0988  Cl- channel, voltage-gated family protein  37.59 
 
 
518 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170879  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2109  voltage gated chloride channel family protein  39.15 
 
 
551 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.732554  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0803  chloride channel (ClC) family protein  39.15 
 
 
576 aa  231  3e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.781584  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2635  chloride channel (ClC) family protein  39.15 
 
 
560 aa  230  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1977  chloride channel (ClC) family protein  39.15 
 
 
560 aa  230  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3062  voltage gated chloride channel family protein  39.15 
 
 
576 aa  230  4e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0848  Cl- channel, voltage-gated family protein  37.1 
 
 
521 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.17126  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2964  voltage gated chloride channel family protein  39.33 
 
 
562 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3029  chloride channel (ClC) family protein  39.33 
 
 
578 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0860  chloride channel core  37.71 
 
 
565 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.442414  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2411  chloride channel core  37.75 
 
 
517 aa  226  6e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0660  chloride channel core  37.99 
 
 
485 aa  224  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3213  Cl- channel, voltage gated  38.65 
 
 
522 aa  224  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2667  putative chloride-channel protein  38.55 
 
 
447 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1500  Cl- channel, voltage gated  37.62 
 
 
433 aa  214  2.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6367  Chloride channel core  38.08 
 
 
441 aa  212  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6573  Cl- channel, voltage gated  36.89 
 
 
439 aa  211  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.939375  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5024  chloride channel core  36.87 
 
 
435 aa  208  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.283632  normal  0.200334 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6335  Chloride channel core  39.86 
 
 
456 aa  205  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4712  Cl- channel, voltage-gated family protein  37.67 
 
 
470 aa  205  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3055  Cl- channel, voltage gated  36.97 
 
 
506 aa  204  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.938884  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5838  chloride channel core  38.13 
 
 
485 aa  200  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.697782 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1155  Cl- channel, voltage gated  35.76 
 
 
440 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.599671  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3820  Cl- channel, voltage-gated family protein  36.28 
 
 
454 aa  193  6e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0706898  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0110  voltage gated chloride channel family protein  38.68 
 
 
485 aa  189  8e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0419274  hitchhiker  0.00996162 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0697  Cl- channel, voltage gated  38.92 
 
 
439 aa  186  6e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3257  chloride channel core  34.56 
 
 
446 aa  167  4e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3116  chloride channel protein  27.94 
 
 
453 aa  152  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.958796 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5803  Cl- channel voltage-gated family protein  30.05 
 
 
466 aa  150  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0706283  normal  0.393732 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  30.42 
 
 
569 aa  140  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  29.47 
 
 
519 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  29.47 
 
 
519 aa  134  5e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1576  chloride channel protein  29.78 
 
 
463 aa  133  6e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.803836 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2188  Chloride channel core  26.97 
 
 
563 aa  126  8.000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000751746  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1400  chloride channel protein  30.05 
 
 
523 aa  124  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.340394  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  29.76 
 
 
473 aa  124  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1662  voltage-gated chloride channel family protein  29.79 
 
 
523 aa  124  4e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  29.76 
 
 
473 aa  124  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  29.76 
 
 
473 aa  124  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  29.76 
 
 
473 aa  124  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  29.76 
 
 
473 aa  123  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0695  chloride channel protein  29.42 
 
 
466 aa  123  8e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.750689  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1107  voltage-gated chloride channel family protein  27.22 
 
 
510 aa  121  3e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3525  Chloride channel core  31.28 
 
 
533 aa  121  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1830  chloride channel protein EriC  28.42 
 
 
512 aa  120  3e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.116382  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  31.13 
 
 
859 aa  121  3e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3102  chloride channel protein  30.41 
 
 
471 aa  120  7e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2944  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.03 
 
 
526 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0120087  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0552  Cl- channel, voltage-gated family protein  29 
 
 
437 aa  117  3e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0212  chloride channel protein  31.91 
 
 
456 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A25  chloride channel protein EriC  25.69 
 
 
510 aa  115  2.0000000000000002e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0757  Chloride channel core  28.86 
 
 
528 aa  114  4.0000000000000004e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.937422  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  32.97 
 
 
897 aa  112  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1697  chloride channel protein  29.89 
 
 
427 aa  112  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  28.77 
 
 
626 aa  111  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.97 
 
 
582 aa  110  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  29.74 
 
 
584 aa  109  9.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0681  Chloride channel core  26.5 
 
 
538 aa  109  1e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1698  chloride channel protein  28.54 
 
 
427 aa  109  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0762  chloride channel core  28.12 
 
 
518 aa  108  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000775923  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0866  chloride channel protein  30.37 
 
 
470 aa  108  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0280286  normal 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  31.48 
 
 
863 aa  107  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2009  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.41 
 
 
443 aa  106  7e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4719  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.26 
 
 
439 aa  104  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3447  Chloride channel core  29.95 
 
 
473 aa  103  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3504  chloride channel protein  29.95 
 
 
473 aa  103  4e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17992  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>