More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0660 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_0660  chloride channel core  100 
 
 
485 aa  959    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4091  Cl- channel, voltage gated  80 
 
 
513 aa  658    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0815105  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0948  chloride channel core  78.89 
 
 
520 aa  656    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1059  Chloride channel core  76.39 
 
 
474 aa  676    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2411  chloride channel core  78.42 
 
 
517 aa  649    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0509  Cl- channel, voltage gated  75.65 
 
 
518 aa  656    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0848  Cl- channel, voltage-gated family protein  79.29 
 
 
521 aa  652    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.17126  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0988  Cl- channel, voltage-gated family protein  75.65 
 
 
518 aa  656    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170879  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0860  chloride channel core  76.34 
 
 
565 aa  651    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.442414  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1573  voltage gated chloride channel family protein  77.67 
 
 
563 aa  628  1e-179  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.556285  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0803  chloride channel (ClC) family protein  73.36 
 
 
576 aa  622  1e-177  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.781584  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1977  chloride channel (ClC) family protein  73.36 
 
 
560 aa  622  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2635  chloride channel (ClC) family protein  73.36 
 
 
560 aa  622  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3062  voltage gated chloride channel family protein  73.5 
 
 
576 aa  620  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2109  voltage gated chloride channel family protein  73.29 
 
 
551 aa  616  1e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.732554  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3029  chloride channel (ClC) family protein  77.55 
 
 
578 aa  615  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2964  voltage gated chloride channel family protein  77.55 
 
 
562 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2667  putative chloride-channel protein  70.02 
 
 
447 aa  570  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5024  chloride channel core  70.26 
 
 
435 aa  560  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.283632  normal  0.200334 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6367  Chloride channel core  70.8 
 
 
441 aa  558  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6573  Cl- channel, voltage gated  68.88 
 
 
439 aa  548  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.939375  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3866  Chloride channel core  61.26 
 
 
435 aa  468  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3980  Chloride channel core  61.26 
 
 
435 aa  468  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0608  Chloride channel core  43.49 
 
 
468 aa  322  7e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.277563  hitchhiker  0.00926023 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0110  voltage gated chloride channel family protein  43.02 
 
 
485 aa  301  2e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0419274  hitchhiker  0.00996162 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1155  Cl- channel, voltage gated  44.02 
 
 
440 aa  300  5e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.599671  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0697  Cl- channel, voltage gated  44.02 
 
 
439 aa  298  1e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4712  Cl- channel, voltage-gated family protein  41.19 
 
 
470 aa  295  9e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6335  Chloride channel core  43.25 
 
 
456 aa  290  3e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3760  chloride channel core  45.09 
 
 
459 aa  288  1e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.503672  normal  0.147153 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1046  Cl- channel, voltage gated  41.85 
 
 
449 aa  288  2e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.0017165  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3820  Cl- channel, voltage-gated family protein  41.96 
 
 
454 aa  284  2.0000000000000002e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0706898  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0773  Chloride channel core  43.2 
 
 
444 aa  282  8.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.80393  normal  0.191961 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5838  chloride channel core  42.76 
 
 
485 aa  282  9e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.697782 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3959  voltage-gated chloride channel family protein  43.33 
 
 
453 aa  276  9e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.536311 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1867  chloride channel, core  43.33 
 
 
453 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.144395 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1380  Chloride channel core  41.83 
 
 
523 aa  271  2e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.332238  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04784  chloride channel  38.71 
 
 
464 aa  271  2.9999999999999997e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147054  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7107  Chloride channel core  41.06 
 
 
447 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.134894 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0957  chloride channel core  44.23 
 
 
442 aa  270  5.9999999999999995e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0796788  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4474  Chloride channel core  42.75 
 
 
424 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.125667  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3051  chloride channel core  40.32 
 
 
449 aa  266  5.999999999999999e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156315  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6686  Chloride channel core  45.03 
 
 
438 aa  264  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.709238  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0350  voltage gated chloride channel family protein  41 
 
 
451 aa  265  2e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.973552  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0318  voltage gated chloride channel family protein  41 
 
 
490 aa  264  2e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3825  Chloride channel core  40.67 
 
 
447 aa  264  3e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3157  chloride channel core  44.13 
 
 
441 aa  264  3e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.236304  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3353  Chloride channel core  44.88 
 
 
441 aa  263  6e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641112  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5971  Chloride channel core  40.27 
 
 
447 aa  263  6.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306058  normal  0.236498 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3481  Chloride channel core  44.08 
 
 
441 aa  261  3e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.429207  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1139  chloride channel protein  39.73 
 
 
440 aa  257  4e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5405  Chloride channel core  44.26 
 
 
437 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0213924  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4258  Chloride channel core  42.82 
 
 
445 aa  254  3e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6166  chloride channel core  44.86 
 
 
438 aa  253  6e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0747104  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5041  putative H(+)/Cl(-) exchange transporter  43.53 
 
 
445 aa  250  3e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1638  Cl- channel, voltage-gated family protein  37.12 
 
 
436 aa  250  4e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3257  chloride channel core  41.9 
 
 
446 aa  245  9.999999999999999e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3037  Cl- channel, voltage-gated family protein  40.54 
 
 
441 aa  236  6e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3213  Cl- channel, voltage gated  39.28 
 
 
522 aa  225  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1500  Cl- channel, voltage gated  38.23 
 
 
433 aa  215  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3055  Cl- channel, voltage gated  38.27 
 
 
506 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.938884  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5803  Cl- channel voltage-gated family protein  34.34 
 
 
466 aa  189  8e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0706283  normal  0.393732 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3116  chloride channel protein  33.72 
 
 
453 aa  169  9e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.958796 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3525  Chloride channel core  34.04 
 
 
533 aa  133  6e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  31.97 
 
 
569 aa  121  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  31.78 
 
 
859 aa  120  4.9999999999999996e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14511  chloride channel  32.12 
 
 
455 aa  117  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3102  chloride channel protein  32.49 
 
 
471 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  29.85 
 
 
473 aa  114  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  29.85 
 
 
473 aa  114  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  29.85 
 
 
473 aa  114  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1576  chloride channel protein  31.85 
 
 
463 aa  114  5e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.803836 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  29.85 
 
 
473 aa  114  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  29.85 
 
 
473 aa  114  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2944  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.61 
 
 
526 aa  114  6e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0120087  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  26.88 
 
 
519 aa  113  8.000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  27 
 
 
519 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0695  chloride channel protein  28.14 
 
 
466 aa  110  5e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.750689  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  31.14 
 
 
606 aa  109  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0782  chloride channel protein  26.69 
 
 
479 aa  106  8e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.12239 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1830  chloride channel protein EriC  27.2 
 
 
512 aa  106  8e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.116382  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0757  Chloride channel core  26.71 
 
 
528 aa  106  1e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.937422  normal 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A25  chloride channel protein EriC  26.92 
 
 
510 aa  105  3e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2810  chloride channel protein  33.76 
 
 
472 aa  103  7e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2409  Chloride channel core  33.15 
 
 
435 aa  103  9e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0681  Chloride channel core  25.12 
 
 
538 aa  102  2e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1107  voltage-gated chloride channel family protein  27.16 
 
 
510 aa  100  8e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  29.77 
 
 
863 aa  99.4  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1588  Cl- channel, voltage gated  29.9 
 
 
539 aa  98.6  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000108225  normal  0.782392 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3329  chloride channel protein  28.16 
 
 
478 aa  99  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4719  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.3 
 
 
439 aa  99  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3458  chloride channel protein  28.12 
 
 
478 aa  97.4  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.41349  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0993  chloride channel protein  28.12 
 
 
478 aa  97.4  5e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1662  voltage-gated chloride channel family protein  27.53 
 
 
523 aa  96.3  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1400  chloride channel protein  27.53 
 
 
523 aa  96.3  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.340394  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2188  Chloride channel core  29.95 
 
 
563 aa  95.5  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000751746  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1147  chloride channel protein EriC  28.03 
 
 
487 aa  95.5  2e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.433892  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4427  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.12 
 
 
439 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.292219 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  31.54 
 
 
669 aa  95.1  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4200  Cl- channel, voltage gated  31.12 
 
 
439 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.419413  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>