More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4719 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_4719  Cl- channel, voltage-gated family protein  100 
 
 
439 aa  833    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4427  Cl- channel, voltage-gated family protein  65.43 
 
 
439 aa  488  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.292219 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4200  Cl- channel, voltage gated  65.43 
 
 
439 aa  488  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.419413  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4266  Cl- channel, voltage-gated family protein  65.43 
 
 
439 aa  488  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal  0.948351 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2009  Cl- channel, voltage-gated family protein  69.54 
 
 
443 aa  487  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0552  Cl- channel, voltage-gated family protein  38.28 
 
 
437 aa  266  4e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2409  Chloride channel core  43.25 
 
 
435 aa  242  7.999999999999999e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3525  Chloride channel core  40.65 
 
 
533 aa  221  3e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1576  chloride channel protein  35.06 
 
 
463 aa  207  3e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.803836 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  31.58 
 
 
519 aa  187  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  31.58 
 
 
519 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0459  chloride channel protein  36.58 
 
 
468 aa  183  6e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.511438  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  35.68 
 
 
473 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  35.68 
 
 
473 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  35.68 
 
 
473 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2944  Cl- channel, voltage-gated family protein  32.31 
 
 
526 aa  180  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0120087  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  35.45 
 
 
473 aa  179  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  35.45 
 
 
473 aa  179  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0762  chloride channel core  30.51 
 
 
518 aa  178  2e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000775923  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0695  chloride channel protein  35.41 
 
 
466 aa  177  5e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.750689  normal 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A25  chloride channel protein EriC  30.75 
 
 
510 aa  173  5e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1662  voltage-gated chloride channel family protein  33.1 
 
 
523 aa  171  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3102  chloride channel protein  35.23 
 
 
471 aa  170  5e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1400  chloride channel protein  32.86 
 
 
523 aa  170  5e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.340394  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1830  chloride channel protein EriC  32.56 
 
 
512 aa  168  2e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.116382  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2176  chloride channel protein  35.08 
 
 
466 aa  164  3e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.462447  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2188  Chloride channel core  33.16 
 
 
563 aa  163  6e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000751746  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0212  chloride channel protein  31.53 
 
 
456 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1698  chloride channel protein  31.64 
 
 
427 aa  160  3e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0782  chloride channel protein  33.79 
 
 
479 aa  159  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.12239 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1697  chloride channel protein  31.87 
 
 
427 aa  157  2e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1107  voltage-gated chloride channel family protein  28.6 
 
 
510 aa  155  1e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000478  H(+)/Cl(-) exchange transporter ClcA  35.83 
 
 
467 aa  155  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.791443  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2810  chloride channel protein  35.21 
 
 
472 aa  154  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0866  chloride channel protein  32.41 
 
 
470 aa  153  5.9999999999999996e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0280286  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3829  chloride channel core  33.87 
 
 
455 aa  153  7e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3026  chloride channel protein  37.44 
 
 
436 aa  152  8e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.139269  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4138  Chloride channel core  33.41 
 
 
455 aa  152  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0757  Chloride channel core  29.4 
 
 
528 aa  151  2e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.937422  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1588  Cl- channel, voltage gated  35.98 
 
 
539 aa  150  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000108225  normal  0.782392 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5126  Chloride channel core  33.04 
 
 
455 aa  147  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.967493 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0386  chloride channel protein EriC  31.28 
 
 
457 aa  145  1e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000543407 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3329  chloride channel protein  32.79 
 
 
478 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3458  chloride channel protein  32.79 
 
 
478 aa  144  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.41349  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  35.31 
 
 
875 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0993  chloride channel protein  32.79 
 
 
478 aa  144  3e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06233  chloride channel protein  35.81 
 
 
468 aa  144  3e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1147  chloride channel protein EriC  30.54 
 
 
487 aa  144  4e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.433892  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2509  chloride channel protein  35.43 
 
 
455 aa  144  5e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  33.52 
 
 
569 aa  140  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2460  chloride channel core  36 
 
 
459 aa  140  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11718  normal  0.460638 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0159  chloride channel protein  33.87 
 
 
473 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00154  chloride channel protein  33.87 
 
 
473 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0502549  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3447  Chloride channel core  33.87 
 
 
473 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0165  chloride channel protein  33.87 
 
 
473 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0160  chloride channel protein  33.87 
 
 
473 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3504  chloride channel protein  33.87 
 
 
473 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17992  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00153  hypothetical protein  33.87 
 
 
473 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0410723  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0167  chloride channel protein  33.87 
 
 
473 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  32.64 
 
 
863 aa  138  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0147  chloride channel protein  33.87 
 
 
473 aa  138  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0391  chloride channel, core  28.9 
 
 
516 aa  137  4e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000201773  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0681  Chloride channel core  28.07 
 
 
538 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  31.1 
 
 
859 aa  135  9.999999999999999e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0449  Chloride channel core  27.71 
 
 
428 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0487186  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1891  chloride channel protein EriC  27.97 
 
 
534 aa  129  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  8.85971e-16 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  34.1 
 
 
863 aa  126  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0189  chloride channel, core  27.61 
 
 
445 aa  126  9e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2437  chloride channel core  32.43 
 
 
629 aa  125  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.276438  normal  0.470563 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0433  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.84 
 
 
575 aa  124  3e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.346865  normal  0.0128311 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2179  voltage-gated chloride channel  27.06 
 
 
528 aa  123  6e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0845  chloride channel protein EriC  31.99 
 
 
512 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2680  Chloride channel core  30.91 
 
 
879 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3436  Chloride channel core  30.91 
 
 
879 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0318  Chloride channel core  34.6 
 
 
511 aa  118  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000450379  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1638  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.26 
 
 
436 aa  114  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  28.14 
 
 
615 aa  114  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  28.61 
 
 
613 aa  113  6e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  30.75 
 
 
862 aa  113  8.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  34.06 
 
 
897 aa  112  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0773  Chloride channel core  31.3 
 
 
444 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.80393  normal  0.191961 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3051  chloride channel core  29.57 
 
 
449 aa  110  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156315  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  31.23 
 
 
626 aa  109  9.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0832  chloride channel  26.74 
 
 
585 aa  109  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0690  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.78 
 
 
591 aa  108  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.441434  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0546  Cl- channel, voltage gated  27.27 
 
 
559 aa  108  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.33 
 
 
593 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.33 
 
 
593 aa  108  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  28.54 
 
 
614 aa  107  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0358  Cl- channel, voltage gated  33.88 
 
 
575 aa  106  7e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5838  chloride channel core  31.45 
 
 
485 aa  106  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.697782 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  30.17 
 
 
608 aa  105  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1155  Cl- channel, voltage gated  31.41 
 
 
440 aa  106  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.599671  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2543  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.12 
 
 
591 aa  105  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.232119  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.87 
 
 
628 aa  105  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1059  Chloride channel core  31.96 
 
 
474 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2667  putative chloride-channel protein  32.38 
 
 
447 aa  104  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.31 
 
 
598 aa  104  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2285  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  33.02 
 
 
426 aa  104  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397915  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.94 
 
 
636 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>