More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1059 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0860  chloride channel core  78.65 
 
 
565 aa  659    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.442414  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0660  chloride channel core  80.93 
 
 
485 aa  639    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4091  Cl- channel, voltage gated  80.8 
 
 
513 aa  665    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0815105  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1573  voltage gated chloride channel family protein  80.47 
 
 
563 aa  643    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.556285  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2411  chloride channel core  81.03 
 
 
517 aa  665    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0509  Cl- channel, voltage gated  79.39 
 
 
518 aa  656    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0948  chloride channel core  79.39 
 
 
520 aa  657    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0848  Cl- channel, voltage-gated family protein  78.92 
 
 
521 aa  659    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.17126  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1059  Chloride channel core  100 
 
 
474 aa  931    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0988  Cl- channel, voltage-gated family protein  79.39 
 
 
518 aa  656    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170879  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2109  voltage gated chloride channel family protein  77.33 
 
 
551 aa  630  1e-179  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.732554  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3062  voltage gated chloride channel family protein  77.33 
 
 
576 aa  629  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0803  chloride channel (ClC) family protein  77.33 
 
 
576 aa  630  1e-179  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.781584  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1977  chloride channel (ClC) family protein  77.33 
 
 
560 aa  629  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2635  chloride channel (ClC) family protein  77.33 
 
 
560 aa  629  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2964  voltage gated chloride channel family protein  80.47 
 
 
562 aa  625  1e-178  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3029  chloride channel (ClC) family protein  80.47 
 
 
578 aa  626  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2667  putative chloride-channel protein  69.71 
 
 
447 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5024  chloride channel core  69.88 
 
 
435 aa  534  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.283632  normal  0.200334 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6367  Chloride channel core  68.29 
 
 
441 aa  530  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6573  Cl- channel, voltage gated  66.74 
 
 
439 aa  526  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.939375  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3866  Chloride channel core  63.25 
 
 
435 aa  479  1e-134  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3980  Chloride channel core  63.25 
 
 
435 aa  479  1e-134  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0608  Chloride channel core  44.49 
 
 
468 aa  333  3e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.277563  hitchhiker  0.00926023 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0110  voltage gated chloride channel family protein  48.09 
 
 
485 aa  320  3e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0419274  hitchhiker  0.00996162 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1155  Cl- channel, voltage gated  44.76 
 
 
440 aa  318  2e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.599671  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6335  Chloride channel core  44.24 
 
 
456 aa  305  2.0000000000000002e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3760  chloride channel core  45.18 
 
 
459 aa  300  5e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.503672  normal  0.147153 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4712  Cl- channel, voltage-gated family protein  42.79 
 
 
470 aa  300  5e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5838  chloride channel core  44.87 
 
 
485 aa  298  1e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.697782 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3820  Cl- channel, voltage-gated family protein  43.57 
 
 
454 aa  298  2e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0706898  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0773  Chloride channel core  44.29 
 
 
444 aa  295  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.80393  normal  0.191961 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04784  chloride channel  42.07 
 
 
464 aa  294  3e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147054  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0697  Cl- channel, voltage gated  43.54 
 
 
439 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1046  Cl- channel, voltage gated  41.86 
 
 
449 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.0017165  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3825  Chloride channel core  42.96 
 
 
447 aa  279  8e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7107  Chloride channel core  41.28 
 
 
447 aa  276  5e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.134894 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5971  Chloride channel core  41.46 
 
 
447 aa  276  5e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306058  normal  0.236498 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3959  voltage-gated chloride channel family protein  41.14 
 
 
453 aa  276  6e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.536311 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1867  chloride channel, core  41.14 
 
 
453 aa  275  9e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.144395 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4474  Chloride channel core  41.94 
 
 
424 aa  270  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.125667  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0957  chloride channel core  43.45 
 
 
442 aa  268  2e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0796788  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1139  chloride channel protein  41.76 
 
 
440 aa  266  5.999999999999999e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3051  chloride channel core  39.45 
 
 
449 aa  266  7e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156315  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5405  Chloride channel core  46.08 
 
 
437 aa  265  1e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0213924  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0350  voltage gated chloride channel family protein  39.91 
 
 
451 aa  265  2e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.973552  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0318  voltage gated chloride channel family protein  39.91 
 
 
490 aa  264  2e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6686  Chloride channel core  45.14 
 
 
438 aa  264  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.709238  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4258  Chloride channel core  43.06 
 
 
445 aa  264  3e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3353  Chloride channel core  44.79 
 
 
441 aa  263  6.999999999999999e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641112  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1638  Cl- channel, voltage-gated family protein  37.41 
 
 
436 aa  262  8e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3481  Chloride channel core  45.3 
 
 
441 aa  261  1e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.429207  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5041  putative H(+)/Cl(-) exchange transporter  43.84 
 
 
445 aa  261  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3157  chloride channel core  45.06 
 
 
441 aa  261  2e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.236304  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1380  Chloride channel core  41 
 
 
523 aa  261  2e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.332238  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3257  chloride channel core  43.33 
 
 
446 aa  255  1.0000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6166  chloride channel core  45.28 
 
 
438 aa  250  3e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0747104  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3037  Cl- channel, voltage-gated family protein  41.2 
 
 
441 aa  239  8e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1500  Cl- channel, voltage gated  38.03 
 
 
433 aa  214  2.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3213  Cl- channel, voltage gated  37.61 
 
 
522 aa  213  7.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5803  Cl- channel voltage-gated family protein  36.47 
 
 
466 aa  190  4e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0706283  normal  0.393732 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3055  Cl- channel, voltage gated  37.64 
 
 
506 aa  187  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.938884  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3116  chloride channel protein  33.85 
 
 
453 aa  181  2e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.958796 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  34.63 
 
 
859 aa  133  6.999999999999999e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  27.8 
 
 
519 aa  128  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  26.81 
 
 
519 aa  126  7e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  31.95 
 
 
569 aa  125  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3525  Chloride channel core  32.39 
 
 
533 aa  124  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A25  chloride channel protein EriC  28.5 
 
 
510 aa  117  5e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4719  Cl- channel, voltage-gated family protein  32.22 
 
 
439 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  27.83 
 
 
473 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  27.83 
 
 
473 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  27.83 
 
 
473 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  27.83 
 
 
473 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  27.83 
 
 
473 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1576  chloride channel protein  30.27 
 
 
463 aa  110  4.0000000000000004e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.803836 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0782  chloride channel protein  27.69 
 
 
479 aa  108  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.12239 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3102  chloride channel protein  28.95 
 
 
471 aa  107  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  32.91 
 
 
862 aa  107  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1830  chloride channel protein EriC  29.23 
 
 
512 aa  107  7e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.116382  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2944  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.5 
 
 
526 aa  106  8e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0120087  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0757  Chloride channel core  30.07 
 
 
528 aa  106  8e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.937422  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2810  chloride channel protein  32.03 
 
 
472 aa  105  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3458  chloride channel protein  27.78 
 
 
478 aa  104  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.41349  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0681  Chloride channel core  26.67 
 
 
538 aa  104  3e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3329  chloride channel protein  27.78 
 
 
478 aa  104  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0695  chloride channel protein  29.14 
 
 
466 aa  104  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.750689  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0993  chloride channel protein  27.78 
 
 
478 aa  104  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  30.41 
 
 
863 aa  104  4e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14511  chloride channel  29.79 
 
 
455 aa  104  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1662  voltage-gated chloride channel family protein  27.33 
 
 
523 aa  103  6e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1400  chloride channel protein  27.33 
 
 
523 aa  103  7e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.340394  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  31.93 
 
 
897 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0189  chloride channel, core  27.68 
 
 
445 aa  101  3e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0552  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.57 
 
 
437 aa  101  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0762  chloride channel core  29.56 
 
 
518 aa  100  4e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000775923  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1588  Cl- channel, voltage gated  31.12 
 
 
539 aa  100  6e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000108225  normal  0.782392 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4427  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.75 
 
 
439 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.292219 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4200  Cl- channel, voltage gated  30.75 
 
 
439 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.419413  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4266  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.75 
 
 
439 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal  0.948351 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>