118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4627 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4627  hypothetical protein  100 
 
 
173 aa  347  5e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6335  Chloride channel core  70.1 
 
 
456 aa  131  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5838  chloride channel core  73.97 
 
 
485 aa  113  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.697782 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4712  Cl- channel, voltage-gated family protein  70.67 
 
 
470 aa  107  7.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3820  Cl- channel, voltage-gated family protein  73.33 
 
 
454 aa  107  8.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0706898  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1155  Cl- channel, voltage gated  84.13 
 
 
440 aa  103  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.599671  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0110  voltage gated chloride channel family protein  75.71 
 
 
485 aa  100  7e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0419274  hitchhiker  0.00996162 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1059  Chloride channel core  63.77 
 
 
474 aa  91.3  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2109  voltage gated chloride channel family protein  56.41 
 
 
551 aa  87.8  7e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.732554  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0803  chloride channel (ClC) family protein  56.41 
 
 
576 aa  87.8  7e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.781584  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2635  chloride channel (ClC) family protein  56.41 
 
 
560 aa  87.8  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1977  chloride channel (ClC) family protein  56.41 
 
 
560 aa  87.8  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3062  voltage gated chloride channel family protein  56.41 
 
 
576 aa  87.4  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1573  voltage gated chloride channel family protein  60.61 
 
 
563 aa  87  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.556285  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2964  voltage gated chloride channel family protein  60.61 
 
 
562 aa  87  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3029  chloride channel (ClC) family protein  60.61 
 
 
578 aa  87  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3257  chloride channel core  70.49 
 
 
446 aa  87  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6367  Chloride channel core  61.9 
 
 
441 aa  86.7  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2667  putative chloride-channel protein  60.61 
 
 
447 aa  86.7  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5024  chloride channel core  61.9 
 
 
435 aa  85.9  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.283632  normal  0.200334 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0509  Cl- channel, voltage gated  59.09 
 
 
518 aa  85.1  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0988  Cl- channel, voltage-gated family protein  59.09 
 
 
518 aa  85.1  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170879  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0948  chloride channel core  59.09 
 
 
520 aa  85.1  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6573  Cl- channel, voltage gated  62.3 
 
 
439 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.939375  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4091  Cl- channel, voltage gated  56.06 
 
 
513 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0815105  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0660  chloride channel core  56.34 
 
 
485 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0848  Cl- channel, voltage-gated family protein  56.06 
 
 
521 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.17126  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0860  chloride channel core  58.73 
 
 
565 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.442414  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2411  chloride channel core  56.06 
 
 
517 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3866  Chloride channel core  52.7 
 
 
435 aa  75.1  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3980  Chloride channel core  52.7 
 
 
435 aa  75.1  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0697  Cl- channel, voltage gated  58.21 
 
 
439 aa  73.2  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4474  Chloride channel core  50 
 
 
424 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.125667  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1046  Cl- channel, voltage gated  39.13 
 
 
449 aa  62  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.0017165  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3760  chloride channel core  46.15 
 
 
459 aa  61.6  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.503672  normal  0.147153 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3353  Chloride channel core  46.38 
 
 
441 aa  61.2  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641112  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5041  putative H(+)/Cl(-) exchange transporter  41.76 
 
 
445 aa  61.2  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3157  chloride channel core  46.38 
 
 
441 aa  61.2  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.236304  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3481  Chloride channel core  46.38 
 
 
441 aa  61.2  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.429207  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1139  chloride channel protein  46.38 
 
 
440 aa  60.8  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1380  Chloride channel core  46.38 
 
 
523 aa  59.7  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.332238  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3051  chloride channel core  46.77 
 
 
449 aa  58.2  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156315  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5971  Chloride channel core  48.28 
 
 
447 aa  58.2  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306058  normal  0.236498 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7107  Chloride channel core  48.28 
 
 
447 aa  58.5  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.134894 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5405  Chloride channel core  42.11 
 
 
437 aa  58.5  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0213924  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0773  Chloride channel core  47.46 
 
 
444 aa  58.2  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.80393  normal  0.191961 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0957  chloride channel core  45.59 
 
 
442 aa  57.8  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0796788  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0318  voltage gated chloride channel family protein  45.16 
 
 
490 aa  57  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0350  voltage gated chloride channel family protein  45.16 
 
 
451 aa  56.6  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.973552  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0608  Chloride channel core  45.45 
 
 
468 aa  55.5  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.277563  hitchhiker  0.00926023 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4258  Chloride channel core  42.65 
 
 
445 aa  55.1  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3037  Cl- channel, voltage-gated family protein  41.98 
 
 
441 aa  54.3  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3116  chloride channel protein  36.62 
 
 
453 aa  53.1  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.958796 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6166  chloride channel core  42.42 
 
 
438 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0747104  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1891  chloride channel protein EriC  41.18 
 
 
534 aa  52.8  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  8.85971e-16 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04784  chloride channel  34.07 
 
 
464 aa  52.4  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147054  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3825  Chloride channel core  39.44 
 
 
447 aa  52  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A25  chloride channel protein EriC  31.68 
 
 
510 aa  51.2  0.000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  44.07 
 
 
863 aa  50.1  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6686  Chloride channel core  47.06 
 
 
438 aa  48.1  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.709238  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2009  Cl- channel, voltage-gated family protein  37.33 
 
 
443 aa  47.8  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1588  Cl- channel, voltage gated  27.12 
 
 
539 aa  47  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000108225  normal  0.782392 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  36.23 
 
 
862 aa  46.2  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1576  chloride channel protein  34.18 
 
 
463 aa  46.2  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.803836 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1500  Cl- channel, voltage gated  42.86 
 
 
433 aa  46.2  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1147  chloride channel protein EriC  37.31 
 
 
487 aa  46.2  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.433892  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11720  Chloride channel core  42.86 
 
 
402 aa  46.2  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000807988  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  39.68 
 
 
859 aa  46.6  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1638  Cl- channel, voltage-gated family protein  35.48 
 
 
436 aa  45.4  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  38.98 
 
 
863 aa  45.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  39.66 
 
 
897 aa  45.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0212  chloride channel protein  35.71 
 
 
456 aa  44.7  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00154  chloride channel protein  33.33 
 
 
473 aa  44.3  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0502549  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3447  Chloride channel core  33.33 
 
 
473 aa  44.3  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00153  hypothetical protein  33.33 
 
 
473 aa  44.3  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0410723  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0159  chloride channel protein  33.33 
 
 
473 aa  44.3  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0160  chloride channel protein  33.33 
 
 
473 aa  44.3  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3504  chloride channel protein  33.33 
 
 
473 aa  44.3  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17992  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0167  chloride channel protein  33.33 
 
 
473 aa  44.3  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0147  chloride channel protein  33.33 
 
 
473 aa  44.3  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0165  chloride channel protein  33.33 
 
 
473 aa  44.3  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  42 
 
 
591 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0866  chloride channel protein  29.11 
 
 
470 aa  43.9  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0280286  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2283  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  42 
 
 
591 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2409  Chloride channel core  40 
 
 
435 aa  43.9  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  34.48 
 
 
569 aa  43.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1400  chloride channel protein  32.84 
 
 
523 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.340394  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1830  chloride channel protein EriC  27.97 
 
 
512 aa  42.7  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.116382  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0845  chloride channel protein EriC  37.66 
 
 
512 aa  42.7  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3102  chloride channel protein  35.71 
 
 
471 aa  42.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3329  chloride channel protein  33.33 
 
 
478 aa  43.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0782  chloride channel protein  35.71 
 
 
479 aa  43.5  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.12239 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0993  chloride channel protein  33.33 
 
 
478 aa  43.1  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3458  chloride channel protein  33.33 
 
 
478 aa  43.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.41349  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2188  Chloride channel core  33.33 
 
 
563 aa  42.7  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000751746  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0318  Chloride channel core  33.78 
 
 
511 aa  43.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000450379  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1662  voltage-gated chloride channel family protein  32.84 
 
 
523 aa  42.7  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5803  Cl- channel voltage-gated family protein  32.86 
 
 
466 aa  42.4  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0706283  normal  0.393732 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  39.62 
 
 
584 aa  42.4  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  37.93 
 
 
875 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>