More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1258 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  76.83 
 
 
579 aa  870    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  76.08 
 
 
589 aa  832    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  76.83 
 
 
579 aa  870    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  76.66 
 
 
636 aa  866    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  75.04 
 
 
598 aa  872    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  77.35 
 
 
628 aa  872    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  100 
 
 
577 aa  1151    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  86.14 
 
 
591 aa  984    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  76.83 
 
 
579 aa  870    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2283  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  85.62 
 
 
591 aa  956    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  76.08 
 
 
593 aa  864    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6342  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  75.56 
 
 
589 aa  856    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867968  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  76.26 
 
 
593 aa  865    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  75.39 
 
 
589 aa  855    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1737  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  75.56 
 
 
589 aa  856    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01992  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  55.5 
 
 
461 aa  426  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3801  Chloride channel core  54.59 
 
 
464 aa  428  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3914  Chloride channel core  54.59 
 
 
464 aa  428  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2543  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  44.44 
 
 
591 aa  406  1.0000000000000001e-112  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.232119  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4701  Chloride channel core  53.51 
 
 
471 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.10029 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  33.87 
 
 
615 aa  291  3e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0455  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  37.16 
 
 
560 aa  286  7e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0516  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  37.96 
 
 
601 aa  282  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132092  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  33.04 
 
 
614 aa  281  2e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0367  Chloride channel core  32.51 
 
 
595 aa  274  4.0000000000000004e-72  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2049  Chloride channel core  34.57 
 
 
596 aa  268  2.9999999999999995e-70  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.993111  normal  0.527331 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  31.38 
 
 
613 aa  258  3e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2285  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  43.06 
 
 
426 aa  257  4e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397915  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1979  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  43.26 
 
 
426 aa  252  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1867  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  44.01 
 
 
414 aa  251  3e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.396231  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3746  Cl- channel, voltage-gated family protein  42.36 
 
 
414 aa  239  1e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.556146 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  32.92 
 
 
608 aa  232  1e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1448  Chloride channel core  30.99 
 
 
627 aa  232  1e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.132053  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.35 
 
 
582 aa  232  1e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1400  chloride channel, putative  27.99 
 
 
631 aa  227  4e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  33.65 
 
 
470 aa  222  9.999999999999999e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1352  Cl- channel, voltage gated  30.65 
 
 
577 aa  220  5e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2051  Chloride channel core  41.9 
 
 
418 aa  219  7.999999999999999e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01561  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  41.97 
 
 
418 aa  219  2e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1607  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  41.97 
 
 
418 aa  218  2e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1800  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  41.97 
 
 
418 aa  219  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2038  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  41.97 
 
 
418 aa  219  2e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01551  hypothetical protein  41.97 
 
 
418 aa  219  2e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2303  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  41.97 
 
 
418 aa  218  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0264865 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1666  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  41.65 
 
 
418 aa  217  4e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0919  chloride channel, putative  31.47 
 
 
624 aa  215  1.9999999999999998e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.870319  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1592  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  42.51 
 
 
429 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0733959 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1779  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  41.49 
 
 
418 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  33.15 
 
 
626 aa  213  9e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  33.33 
 
 
569 aa  211  3e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1514  Chloride channel core  30.14 
 
 
627 aa  210  5e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1246  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.43 
 
 
620 aa  210  5e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1849  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  43 
 
 
417 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1682  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  42.75 
 
 
429 aa  207  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.669275  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1601  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  42.75 
 
 
429 aa  207  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.262233  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1660  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  42.75 
 
 
429 aa  206  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  33.48 
 
 
669 aa  205  2e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1639  Cl- channel voltage-gated family protein  31.31 
 
 
597 aa  204  4e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  31.05 
 
 
584 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1184  Chloride channel core  29.1 
 
 
628 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0945746  normal  0.895336 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2413  chloride channel core  34.62 
 
 
579 aa  200  6e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2221  putative chloride channel  34.38 
 
 
590 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247066  decreased coverage  0.00811968 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3819  Cl- channel voltage-gated family protein  33.78 
 
 
456 aa  194  3e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1059  Chloride channel core  28.57 
 
 
625 aa  193  7e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6434  Chloride channel core  32.71 
 
 
600 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  27.76 
 
 
606 aa  192  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2446  chloride channel core  27.76 
 
 
603 aa  192  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2526  Chloride channel core  34.86 
 
 
589 aa  184  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2439  chloride channel core protein  34.66 
 
 
589 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.590865  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1823  putative chloride channel  30.55 
 
 
593 aa  182  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.039576  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  27.3 
 
 
598 aa  180  5.999999999999999e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3504  chloride channel family protein  27.18 
 
 
602 aa  179  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1421  Cl- channel, voltage gated  34.46 
 
 
586 aa  177  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.68 
 
 
587 aa  172  1e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.5 
 
 
580 aa  171  3e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2746  Cl- channel, voltage gated  33.1 
 
 
543 aa  170  8e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.43501  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11720  Chloride channel core  29.9 
 
 
402 aa  169  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000807988  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2950  Cl- channel, voltage gated  27.2 
 
 
613 aa  166  8e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.952562  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2352  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.27 
 
 
612 aa  164  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3883  chloride channel core  28.6 
 
 
603 aa  164  6e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.457213 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2161  chloride channel protein  26.72 
 
 
594 aa  164  6e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0845  Chloride channel core  28.27 
 
 
640 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0525209 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2412  putative chloride channel protein  31.19 
 
 
562 aa  162  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.03983  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0525  Cl- channel voltage-gated family protein  26.35 
 
 
579 aa  162  1e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1761  Chloride channel core  29.53 
 
 
605 aa  162  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1257  chloride channel-like  34.88 
 
 
615 aa  162  2e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.95023  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  28.57 
 
 
859 aa  162  2e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0433  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.53 
 
 
575 aa  161  3e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.346865  normal  0.0128311 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0690  Cl- channel, voltage-gated family protein  32.14 
 
 
591 aa  160  5e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.441434  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0693  Cl- channel, voltage gated  32.7 
 
 
564 aa  159  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0559233  hitchhiker  0.000374815 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0939  Cl- channel voltage-gated family protein  29.37 
 
 
582 aa  158  2e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.564922  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2054  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.99 
 
 
565 aa  158  3e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.345027 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1534  Cl- channel, voltage gated  33.33 
 
 
527 aa  152  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.123029  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0358  Cl- channel, voltage gated  34.47 
 
 
575 aa  150  7e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0832  chloride channel  29.3 
 
 
585 aa  149  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2144  Cl- channel voltage-gated family protein  26.56 
 
 
604 aa  149  2.0000000000000003e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1130  Chloride channel core  23.96 
 
 
617 aa  147  6e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.711755  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2374  Chloride channel core  26.88 
 
 
596 aa  145  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.124913  decreased coverage  0.00191401 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  29.89 
 
 
863 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5245  chloride channel core  30.14 
 
 
606 aa  144  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.258909  decreased coverage  0.00444672 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>