191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_83582 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009044  PICST_83582  chloride channel, possibly voltage gated  100 
 
 		 818 aa  1665    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.172936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53364  voltage-gated chloride channel  29.91 
 
 		 764 aa  245  3e-63  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01900  conserved hypothetical protein  30.47 
 
 		 873 aa  238  3e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00397821  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03790  voltage-gated chloride channel, putative  40.15 
 
 		 897 aa  233  9e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02308  ClC chloride ion channel (Eurofung)  28.74 
 
 		 828 aa  232  2e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.382711  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06311  ClC chloride ion channel (Eurofung)  28.82 
 
 		 793 aa  219  1e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06107  CLC channel [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q870M6]  28.97 
 
 		 909 aa  218  4e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.20732  normal  0.131172 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57787  voltage-gated protein/chloride channel  30.5 
 
 		 869 aa  189  3e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0658005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_50496  ClC family transporter: chloride ion channel  25.26 
 
 		 869 aa  163  1e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.913408  normal  0.293754 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_52412  channel voltage activated chloride channel  26.68 
 
 		 693 aa  150  1.0000000000000001e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28245  voltage activated chloride channel CLC7 type  27.92 
 
 		 768 aa  148  4.0000000000000006e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.385606  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46097  predicted protein  26.5 
 
 		 980 aa  114  9e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  24.64 
 
 		 859 aa  110  8.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  28.02 
 
 		 863 aa  104  5e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A25  chloride channel protein EriC  25.71 
 
 		 510 aa  101  6e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1830  chloride channel protein EriC  24.27 
 
 		 512 aa  100  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.116382  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  25.69 
 
 		 519 aa  96.3  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34455  ClC family transporter: chloride ion channel  25.61 
 
 		 802 aa  94.4  9e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3525  Chloride channel core  25.65 
 
 		 533 aa  90.5  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1107  voltage-gated chloride channel family protein  24.03 
 
 		 510 aa  88.2  6e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0386  chloride channel protein EriC  23.91 
 
 		 457 aa  86.3  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000543407 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0189  chloride channel, core  24.52 
 
 		 445 aa  86.3  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  25.53 
 
 		 875 aa  85.5  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14344  ClC family transporter: chloride ion channel  25.16 
 
 		 718 aa  83.6  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2944  Cl- channel, voltage-gated family protein  24.03 
 
 		 526 aa  82.8  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0120087  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3436  Chloride channel core  25.46 
 
 		 879 aa  79.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2680  Chloride channel core  25.46 
 
 		 879 aa  79.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  24.29 
 
 		 897 aa  79  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  23.53 
 
 		 598 aa  77.8  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0845  chloride channel protein EriC  25.06 
 
 		 512 aa  76.3  0.000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4200  Cl- channel, voltage gated  22.83 
 
 		 439 aa  75.5  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.419413  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4266  Cl- channel, voltage-gated family protein  22.83 
 
 		 439 aa  75.5  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal  0.948351 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4427  Cl- channel, voltage-gated family protein  22.83 
 
 		 439 aa  75.5  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.292219 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1638  Cl- channel, voltage-gated family protein  21.15 
 
 		 436 aa  74.7  0.000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  20.73 
 
 		 613 aa  72.8  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0782  chloride channel protein  21.03 
 
 		 479 aa  73.6  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.12239 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1147  chloride channel protein EriC  24.51 
 
 		 487 aa  72.8  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.433892  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0762  chloride channel core  24.26 
 
 		 518 aa  72.4  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000775923  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  23.44 
 
 		 589 aa  72  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0449  Chloride channel core  24.36 
 
 		 428 aa  72  0.00000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0487186  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2188  Chloride channel core  31.25 
 
 		 563 aa  72.4  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000751746  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2409  Chloride channel core  23.7 
 
 		 435 aa  70.5  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2543  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  22.7 
 
 		 591 aa  70.5  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.232119  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  23.19 
 
 		 582 aa  70.9  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1622  Cl- channel, voltage-gated family protein  21.83 
 
 		 754 aa  70.1  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  23.45 
 
 		 614 aa  68.9  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3116  chloride channel protein  20.79 
 
 		 453 aa  69.3  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.958796 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0608  Chloride channel core  25.24 
 
 		 468 aa  69.3  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.277563  hitchhiker  0.00926023 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  21.59 
 
 		 473 aa  68.6  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  21.59 
 
 		 473 aa  68.6  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  21.59 
 
 		 473 aa  68.6  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  21.59 
 
 		 473 aa  68.6  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1576  chloride channel protein  22.15 
 
 		 463 aa  68.6  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.803836 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  21.59 
 
 		 473 aa  68.2  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  31.39 
 
 		 519 aa  67.8  0.0000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1891  chloride channel protein EriC  31.85 
 
 		 534 aa  67  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.85971e-16 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4719  Cl- channel, voltage-gated family protein  23.46 
 
 		 439 aa  66.6  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  30.89 
 
 		 862 aa  65.5  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.5 
 
 		 591 aa  65.5  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2009  Cl- channel, voltage-gated family protein  23.01 
 
 		 443 aa  65.5  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2283  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.5 
 
 		 591 aa  64.7  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2366  Cl- channel voltage-gated family protein  22.77 
 
 		 416 aa  64.7  0.000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2179  voltage-gated chloride channel  26.73 
 
 		 528 aa  64.3  0.000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3102  chloride channel protein  21.83 
 
 		 471 aa  64.3  0.000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  34.92 
 
 		 863 aa  63.9  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  24.18 
 
 		 470 aa  63.5  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  30.4 
 
 		 626 aa  63.2  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0681  Chloride channel core  32.79 
 
 		 538 aa  63.2  0.00000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.52 
 
 		 577 aa  62.4  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0695  chloride channel protein  21.4 
 
 		 466 aa  62  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.750689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6434  Chloride channel core  28.24 
 
 		 600 aa  61.2  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2297  putative chloride channel  21.43 
 
 		 460 aa  61.2  0.00000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.73973  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.73 
 
 		 593 aa  61.2  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.73 
 
 		 593 aa  61.2  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0832  chloride channel  23.04 
 
 		 585 aa  61.2  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1400  chloride channel, putative  24.32 
 
 		 631 aa  60.8  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0757  Chloride channel core  23.2 
 
 		 528 aa  60.8  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.937422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2176  chloride channel protein  22.76 
 
 		 466 aa  60.5  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.462447  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0773  Chloride channel core  24.76 
 
 		 444 aa  60.1  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.80393  normal  0.191961 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3051  chloride channel core  22.64 
 
 		 449 aa  60.1  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156315  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11720  Chloride channel core  31.43 
 
 		 402 aa  59.7  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000807988  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25 
 
 		 636 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25 
 
 		 579 aa  58.9  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25 
 
 		 579 aa  58.9  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25 
 
 		 579 aa  58.9  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6335  Chloride channel core  23.93 
 
 		 456 aa  58.2  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6342  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.83 
 
 		 589 aa  58.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867968  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1737  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.83 
 
 		 589 aa  58.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3820  Cl- channel, voltage-gated family protein  23.01 
 
 		 454 aa  58.2  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0706898  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0318  Chloride channel core  24.59 
 
 		 511 aa  58.2  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000450379  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0845  Chloride channel core  27.78 
 
 		 640 aa  58.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0525209 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.83 
 
 		 589 aa  58.2  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.55 
 
 		 628 aa  57.8  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2285  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  22.52 
 
 		 426 aa  57.8  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397915  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19111  putative chloride channel  22.39 
 
 		 452 aa  57.8  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  23.67 
 
 		 669 aa  57  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0459  chloride channel protein  32.5 
 
 		 468 aa  57.4  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.511438  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0391  chloride channel, core  20.94 
 
 		 516 aa  56.6  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000201773  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1346  chloride channel protein  22.86 
 
 		 527 aa  56.6  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1059  Chloride channel core  22.41 
 
 		 474 aa  56.2  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>