288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNE03790 on replicon NC_006687
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006687  CNE03790  voltage-gated chloride channel, putative  100 
 
 
897 aa  1841    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06107  CLC channel [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q870M6]  38.57 
 
 
909 aa  543  1e-153  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.20732  normal  0.131172 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02308  ClC chloride ion channel (Eurofung)  39.61 
 
 
828 aa  403  1e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.382711  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57787  voltage-gated protein/chloride channel  29.41 
 
 
869 aa  385  1e-105  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0658005  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53364  voltage-gated chloride channel  38.36 
 
 
764 aa  374  1e-102  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01900  conserved hypothetical protein  36.67 
 
 
873 aa  360  7e-98  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00397821  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06311  ClC chloride ion channel (Eurofung)  36.96 
 
 
793 aa  328  3e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83582  chloride channel, possibly voltage gated  40.15 
 
 
818 aa  257  6e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.172936  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28245  voltage activated chloride channel CLC7 type  30.2 
 
 
768 aa  199  2.0000000000000003e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.385606  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_52412  channel voltage activated chloride channel  29.28 
 
 
693 aa  196  1e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46097  predicted protein  27.82 
 
 
980 aa  138  4e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  29.29 
 
 
859 aa  125  5e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14344  ClC family transporter: chloride ion channel  25.93 
 
 
718 aa  118  6e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_50496  ClC family transporter: chloride ion channel  33.05 
 
 
869 aa  117  7.999999999999999e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.913408  normal  0.293754 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  25.92 
 
 
519 aa  108  4e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  26.44 
 
 
519 aa  107  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2944  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.15 
 
 
526 aa  107  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0120087  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1830  chloride channel protein EriC  24.52 
 
 
512 aa  106  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.116382  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2188  Chloride channel core  25.26 
 
 
563 aa  103  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000751746  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0386  chloride channel protein EriC  24.16 
 
 
457 aa  102  3e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000543407 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  26.49 
 
 
863 aa  101  5e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  27.5 
 
 
569 aa  101  6e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A25  chloride channel protein EriC  24.61 
 
 
510 aa  100  2e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1576  chloride channel protein  26.3 
 
 
463 aa  97.1  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.803836 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1662  voltage-gated chloride channel family protein  27.01 
 
 
523 aa  97.1  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  26.92 
 
 
875 aa  97.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  25.99 
 
 
626 aa  96.7  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1400  chloride channel protein  26.75 
 
 
523 aa  96.7  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.340394  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4427  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.97 
 
 
439 aa  95.9  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.292219 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4200  Cl- channel, voltage gated  28.97 
 
 
439 aa  95.9  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.419413  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4266  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.97 
 
 
439 aa  95.9  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal  0.948351 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3525  Chloride channel core  26.43 
 
 
533 aa  94.4  8e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34455  ClC family transporter: chloride ion channel  25.08 
 
 
802 aa  93.6  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1638  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.59 
 
 
436 aa  93.6  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  27.17 
 
 
897 aa  93.2  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  26.76 
 
 
614 aa  92.8  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  25.36 
 
 
613 aa  92.8  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0681  Chloride channel core  21.17 
 
 
538 aa  92.4  3e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1891  chloride channel protein EriC  26.9 
 
 
534 aa  92  4e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  8.85971e-16 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  27.12 
 
 
862 aa  91.7  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  25.13 
 
 
669 aa  91.7  6e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0845  Chloride channel core  27.27 
 
 
640 aa  88.6  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0525209 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5126  Chloride channel core  27.76 
 
 
455 aa  88.6  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.967493 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0762  chloride channel core  26.77 
 
 
518 aa  87.4  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000775923  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  23.04 
 
 
608 aa  86.3  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3102  chloride channel protein  25.85 
 
 
471 aa  85.9  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2285  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.61 
 
 
426 aa  85.9  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397915  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3829  chloride channel core  27.48 
 
 
455 aa  85.9  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0782  chloride channel protein  25.13 
 
 
479 aa  84  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.12239 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1588  Cl- channel, voltage gated  27.48 
 
 
539 aa  83.6  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000108225  normal  0.782392 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0845  chloride channel protein EriC  25.84 
 
 
512 aa  83.6  0.00000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0391  chloride channel, core  25.64 
 
 
516 aa  84  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000201773  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4138  Chloride channel core  27.95 
 
 
455 aa  83.6  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4719  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.6 
 
 
439 aa  82.8  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0189  chloride channel, core  24.48 
 
 
445 aa  81.3  0.00000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.2 
 
 
636 aa  80.9  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0695  chloride channel protein  26.2 
 
 
466 aa  80.5  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.750689  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0459  chloride channel protein  27.95 
 
 
468 aa  79.7  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.511438  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.2 
 
 
579 aa  79.3  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.2 
 
 
579 aa  79.3  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25 
 
 
628 aa  79.3  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.2 
 
 
579 aa  79.3  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0866  chloride channel protein  25 
 
 
470 aa  79.3  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0280286  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0449  Chloride channel core  26.23 
 
 
428 aa  79  0.0000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0487186  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1147  chloride channel protein EriC  25.72 
 
 
487 aa  79  0.0000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.433892  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2543  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25 
 
 
591 aa  78.2  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.232119  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3329  chloride channel protein  23.32 
 
 
478 aa  77.8  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  25.19 
 
 
473 aa  77.8  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  25.19 
 
 
473 aa  77.8  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  25.19 
 
 
473 aa  77.8  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0773  Chloride channel core  26.69 
 
 
444 aa  77.8  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.80393  normal  0.191961 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0993  chloride channel protein  23.32 
 
 
478 aa  77.8  0.0000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3458  chloride channel protein  23.32 
 
 
478 aa  77.8  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.41349  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.87 
 
 
577 aa  77.4  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.06 
 
 
591 aa  77.4  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04784  chloride channel  25.32 
 
 
464 aa  77.4  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147054  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  24.94 
 
 
473 aa  76.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  24.94 
 
 
473 aa  76.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1639  Cl- channel voltage-gated family protein  27.71 
 
 
597 aa  76.6  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2437  chloride channel core  23.75 
 
 
629 aa  77  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.276438  normal  0.470563 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1697  chloride channel protein  26.46 
 
 
427 aa  75.9  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0552  Cl- channel, voltage-gated family protein  24.51 
 
 
437 aa  75.5  0.000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  24.74 
 
 
615 aa  75.5  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3051  chloride channel core  25 
 
 
449 aa  75.1  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156315  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.53 
 
 
589 aa  74.7  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11720  Chloride channel core  24.87 
 
 
402 aa  74.7  0.000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000807988  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1107  voltage-gated chloride channel family protein  21.9 
 
 
510 aa  74.7  0.000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2746  Cl- channel, voltage gated  24.32 
 
 
543 aa  74.7  0.000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.43501  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  23.56 
 
 
587 aa  74.7  0.000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0957  chloride channel core  25.51 
 
 
442 aa  74.3  0.000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0796788  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.14 
 
 
598 aa  74.3  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43785  predicted protein  25.65 
 
 
588 aa  74.3  0.000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000378872  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4536  Chloride channel core  22.63 
 
 
603 aa  73.9  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.143283 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0832  chloride channel  24.3 
 
 
585 aa  74.3  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0118  chloride transporter, ClC family  27.69 
 
 
455 aa  73.9  0.00000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000478  H(+)/Cl(-) exchange transporter ClcA  27.53 
 
 
467 aa  73.6  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.791443  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0757  Chloride channel core  24.01 
 
 
528 aa  73.6  0.00000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.937422  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2176  chloride channel protein  25.58 
 
 
466 aa  72  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.462447  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6390  Chloride channel core  22.89 
 
 
604 aa  71.6  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.315587  normal  0.638262 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.28 
 
 
593 aa  71.6  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>