More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_18351 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_18351  putative chloride channel  100 
 
 
452 aa  905    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29991  putative chloride channel  68.08 
 
 
450 aa  621  1e-177  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.593355 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1794  putative chloride channel  66.15 
 
 
452 aa  590  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18921  putative chloride channel  65.71 
 
 
452 aa  588  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.708029  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19111  putative chloride channel  65.71 
 
 
452 aa  583  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18921  putative chloride channel  66.37 
 
 
452 aa  576  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2297  putative chloride channel  63.53 
 
 
460 aa  562  1.0000000000000001e-159  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.73973  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21821  putative chloride channel  68.48 
 
 
452 aa  558  1e-158  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.607028 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2668  putative chloride channel  65.41 
 
 
481 aa  545  1e-154  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  33.26 
 
 
863 aa  196  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_2187  hypothetical protein  62.58 
 
 
160 aa  190  4e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  34.06 
 
 
859 aa  186  5e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  34.24 
 
 
897 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  30.84 
 
 
863 aa  184  3e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  33.49 
 
 
862 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  31.99 
 
 
875 aa  162  9e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3436  Chloride channel core  32.29 
 
 
879 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2680  Chloride channel core  32.29 
 
 
879 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  28.73 
 
 
473 aa  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  28.73 
 
 
473 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  28.73 
 
 
473 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  28.73 
 
 
473 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  29.49 
 
 
473 aa  149  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0695  chloride channel protein  27.51 
 
 
466 aa  149  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.750689  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3525  Chloride channel core  31.29 
 
 
533 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3102  chloride channel protein  31.98 
 
 
471 aa  140  6e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0993  chloride channel protein  28.7 
 
 
478 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3329  chloride channel protein  28.7 
 
 
478 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3458  chloride channel protein  28.7 
 
 
478 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.41349  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0782  chloride channel protein  29.08 
 
 
479 aa  135  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.12239 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  30.03 
 
 
598 aa  131  3e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  27.74 
 
 
519 aa  131  3e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  27.48 
 
 
519 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0866  chloride channel protein  30.13 
 
 
470 aa  125  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0280286  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1576  chloride channel protein  27.74 
 
 
463 aa  125  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.803836 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A25  chloride channel protein EriC  28.66 
 
 
510 aa  124  4e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0459  chloride channel protein  28.27 
 
 
468 aa  124  4e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.511438  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2409  Chloride channel core  29.95 
 
 
435 aa  123  6e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000478  H(+)/Cl(-) exchange transporter ClcA  30.73 
 
 
467 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.791443  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2810  chloride channel protein  29.34 
 
 
472 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  27.43 
 
 
606 aa  119  9e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0681  Chloride channel core  27.32 
 
 
538 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2944  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.5 
 
 
526 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0120087  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4427  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.61 
 
 
439 aa  114  5e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.292219 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4266  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.61 
 
 
439 aa  114  5e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal  0.948351 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4200  Cl- channel, voltage gated  30.61 
 
 
439 aa  114  5e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.419413  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2188  Chloride channel core  27.36 
 
 
563 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000751746  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0552  Cl- channel, voltage-gated family protein  24.89 
 
 
437 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0212  chloride channel protein  29.5 
 
 
456 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2176  chloride channel protein  29.76 
 
 
466 aa  112  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.462447  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1400  chloride channel protein  26.68 
 
 
523 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.340394  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1059  Chloride channel core  29.2 
 
 
625 aa  110  5e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1662  voltage-gated chloride channel family protein  26.23 
 
 
523 aa  110  6e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1107  voltage-gated chloride channel family protein  28.89 
 
 
510 aa  108  1e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  26.22 
 
 
608 aa  107  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1698  chloride channel protein  28.93 
 
 
427 aa  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1697  chloride channel protein  28.7 
 
 
427 aa  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1639  Cl- channel voltage-gated family protein  29.27 
 
 
597 aa  106  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  26.62 
 
 
569 aa  106  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4719  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.34 
 
 
439 aa  106  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0583  Chloride channel core  29.15 
 
 
462 aa  104  4e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  25.99 
 
 
470 aa  103  6e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3026  chloride channel protein  29.52 
 
 
436 aa  102  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.139269  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2009  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.29 
 
 
443 aa  101  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2179  voltage-gated chloride channel  27.23 
 
 
528 aa  101  4e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1588  Cl- channel, voltage gated  29.98 
 
 
539 aa  100  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000108225  normal  0.782392 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0147  chloride channel protein  29.68 
 
 
473 aa  100  5e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  29.44 
 
 
626 aa  100  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00154  chloride channel protein  29.91 
 
 
473 aa  100  8e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0502549  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3447  Chloride channel core  29.91 
 
 
473 aa  100  8e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0159  chloride channel protein  29.68 
 
 
473 aa  99.8  8e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0160  chloride channel protein  29.91 
 
 
473 aa  100  8e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3504  chloride channel protein  29.91 
 
 
473 aa  100  8e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17992  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00153  hypothetical protein  29.91 
 
 
473 aa  100  8e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0410723  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0167  chloride channel protein  29.91 
 
 
473 aa  99.8  9e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0165  chloride channel protein  29.91 
 
 
473 aa  99.8  9e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2509  chloride channel protein  31.23 
 
 
455 aa  99.4  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  27.71 
 
 
669 aa  99.4  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0757  Chloride channel core  25.13 
 
 
528 aa  97.1  6e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.937422  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  25.75 
 
 
614 aa  96.3  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  27.71 
 
 
615 aa  96.3  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4138  Chloride channel core  28.81 
 
 
455 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2437  chloride channel core  24.36 
 
 
629 aa  95.9  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.276438  normal  0.470563 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2446  chloride channel core  26.67 
 
 
603 aa  95.9  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11720  Chloride channel core  28.32 
 
 
402 aa  95.1  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000807988  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  25.33 
 
 
580 aa  95.1  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0762  chloride channel core  29.01 
 
 
518 aa  94.7  3e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000775923  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2366  Cl- channel voltage-gated family protein  26.23 
 
 
416 aa  95.1  3e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6390  Chloride channel core  26.99 
 
 
604 aa  94.4  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.315587  normal  0.638262 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5126  Chloride channel core  30.05 
 
 
455 aa  94.4  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.967493 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  26.92 
 
 
613 aa  94  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4536  Chloride channel core  25.89 
 
 
603 aa  94  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.143283 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  23.63 
 
 
591 aa  93.2  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  26.3 
 
 
584 aa  92.8  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0391  chloride channel, core  27.91 
 
 
516 aa  92  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000201773  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  23.19 
 
 
598 aa  91.3  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1147  chloride channel protein EriC  29.17 
 
 
487 aa  91.7  3e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.433892  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2495  Cl- channel voltage-gated family protein  26.7 
 
 
651 aa  91.7  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.575116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1130  Chloride channel core  23.42 
 
 
617 aa  90.5  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.711755  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0386  chloride channel protein EriC  26.85 
 
 
457 aa  90.5  5e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000543407 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>