More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4064 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_4064  Cl- channel, voltage gated  100 
 
 
602 aa  1188    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1650  Chloride channel core  76.99 
 
 
604 aa  884    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2374  Chloride channel core  44.37 
 
 
596 aa  436  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.124913  decreased coverage  0.00191401 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2134  Chloride channel core  44.29 
 
 
596 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.262546  normal  0.105647 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0604  chloride channel core  43.13 
 
 
597 aa  426  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0490  voltage gated chloride channel family protein  42.27 
 
 
596 aa  420  1e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.889673  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2161  chloride channel protein  43.23 
 
 
594 aa  416  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3883  chloride channel core  42.3 
 
 
603 aa  408  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.457213 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1483  Chloride channel core  42.44 
 
 
628 aa  383  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.216629 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5810  Chloride channel core  42.78 
 
 
606 aa  378  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.688487  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3994  chloride channel core  41.22 
 
 
643 aa  370  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0550665 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3006  Chloride channel core  40.3 
 
 
614 aa  368  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0264261  normal  0.0792273 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2779  chloride channel core  39.77 
 
 
649 aa  365  1e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.674097  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2747  CLC-type chloride channel protein  39.9 
 
 
595 aa  365  2e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171436  normal  0.700779 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1634  Chloride channel core  41.25 
 
 
601 aa  364  2e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0200608 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5245  chloride channel core  41.41 
 
 
606 aa  364  3e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.258909  decreased coverage  0.00444672 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2859  Cl- channel, voltage-gated family protein  37.65 
 
 
606 aa  363  4e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132128  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2902  Chloride channel core  39.87 
 
 
614 aa  356  7.999999999999999e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.452389  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0191  chloride channel core  40.37 
 
 
635 aa  347  4e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.66054  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4075  chloride channel core  41.88 
 
 
587 aa  343  5.999999999999999e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.480414  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4838  chloride channel, core  39.68 
 
 
584 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3739  chloride channel, core  38.74 
 
 
582 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0107  CBS  40.45 
 
 
579 aa  298  1e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2309  Chloride channel core  40.97 
 
 
590 aa  296  9e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0529111 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.81 
 
 
582 aa  183  8.000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  26.54 
 
 
615 aa  155  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  24.91 
 
 
613 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.88 
 
 
598 aa  148  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  28.64 
 
 
669 aa  147  6e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2543  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.71 
 
 
591 aa  144  5e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.232119  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.21 
 
 
591 aa  143  7e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1352  Cl- channel, voltage gated  25.04 
 
 
577 aa  143  9e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  24.71 
 
 
608 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  24.5 
 
 
614 aa  141  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.87 
 
 
579 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.87 
 
 
636 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.87 
 
 
579 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.87 
 
 
579 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4507  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.13 
 
 
594 aa  140  4.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.63 
 
 
628 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.64 
 
 
589 aa  135  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.88 
 
 
593 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.63 
 
 
589 aa  134  6e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.68 
 
 
593 aa  134  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6342  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.9 
 
 
589 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867968  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1737  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.9 
 
 
589 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.63 
 
 
577 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.87 
 
 
587 aa  132  3e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  25.8 
 
 
580 aa  130  7.000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2283  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.63 
 
 
591 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  25.42 
 
 
606 aa  127  7e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4402  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.21 
 
 
598 aa  127  8.000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0824696  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  25.89 
 
 
470 aa  124  5e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  26.12 
 
 
569 aa  124  5e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1979  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.56 
 
 
426 aa  124  6e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1867  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.56 
 
 
414 aa  123  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.396231  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2054  Cl- channel, voltage-gated family protein  32.16 
 
 
565 aa  122  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.345027 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2285  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.73 
 
 
426 aa  122  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397915  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2746  Cl- channel, voltage gated  31.52 
 
 
543 aa  121  3.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.43501  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2413  chloride channel core  27.96 
 
 
579 aa  120  7e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0693  Cl- channel, voltage gated  28.36 
 
 
564 aa  120  7e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0559233  hitchhiker  0.000374815 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2412  putative chloride channel protein  31.35 
 
 
562 aa  120  7.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.03983  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1059  Chloride channel core  26.09 
 
 
625 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  26 
 
 
598 aa  117  5e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1448  Chloride channel core  23.58 
 
 
627 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.132053  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01992  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  33.52 
 
 
461 aa  115  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2221  putative chloride channel  25.31 
 
 
590 aa  113  9e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247066  decreased coverage  0.00811968 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1246  Cl- channel, voltage-gated family protein  25.35 
 
 
620 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3914  Chloride channel core  32.76 
 
 
464 aa  111  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3801  Chloride channel core  32.76 
 
 
464 aa  111  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1130  Chloride channel core  22.56 
 
 
617 aa  110  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.711755  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  28.69 
 
 
626 aa  110  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2520  Chloride channel core  26.19 
 
 
594 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  27.25 
 
 
584 aa  108  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1400  chloride channel, putative  22.36 
 
 
631 aa  108  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3504  chloride channel family protein  26.92 
 
 
602 aa  109  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0433  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.53 
 
 
575 aa  108  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.346865  normal  0.0128311 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1639  Cl- channel voltage-gated family protein  27.27 
 
 
597 aa  107  5e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0367  Chloride channel core  26.55 
 
 
595 aa  103  1e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1823  putative chloride channel  25.36 
 
 
593 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.039576  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0516  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.15 
 
 
601 aa  102  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132092  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2446  chloride channel core  24.67 
 
 
603 aa  102  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0525  Cl- channel voltage-gated family protein  23.35 
 
 
579 aa  102  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0552  Chloride channel core  22.5 
 
 
614 aa  101  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18832  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0832  chloride channel  23.14 
 
 
585 aa  101  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0455  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.91 
 
 
560 aa  101  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1772  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.78 
 
 
585 aa  101  5e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1184  Chloride channel core  24.56 
 
 
628 aa  101  5e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0945746  normal  0.895336 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6434  Chloride channel core  26.55 
 
 
600 aa  100  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2366  Cl- channel voltage-gated family protein  26.45 
 
 
416 aa  99.8  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0919  chloride channel, putative  24.3 
 
 
624 aa  100  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.870319  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0493  Chloride channel core  24.65 
 
 
598 aa  99  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1421  Cl- channel, voltage gated  28.35 
 
 
586 aa  99.4  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01561  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.41 
 
 
418 aa  98.2  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1800  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.41 
 
 
418 aa  98.2  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1779  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.41 
 
 
418 aa  98.2  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1534  Cl- channel, voltage gated  32.31 
 
 
527 aa  98.2  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.123029  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01551  hypothetical protein  29.41 
 
 
418 aa  98.2  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2038  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.41 
 
 
418 aa  98.2  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2439  chloride channel core protein  27.26 
 
 
589 aa  98.2  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.590865  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>