More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2090 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2090  Cl- channel, voltage gated  100 
 
 
434 aa  870    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0263619  hitchhiker  0.00000244814 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  30.05 
 
 
606 aa  161  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49093  predicted protein  31.24 
 
 
1260 aa  157  3e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0396405  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2495  Cl- channel voltage-gated family protein  31.44 
 
 
651 aa  147  5e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.575116 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3504  chloride channel family protein  28.3 
 
 
602 aa  137  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2453  Cl- channel voltage-gated family protein  26.53 
 
 
605 aa  131  3e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1059  Chloride channel core  29.09 
 
 
625 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4094  Chloride channel core  29.18 
 
 
426 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.089965  normal  0.148511 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3981  Chloride channel core  29.18 
 
 
426 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1761  Chloride channel core  29.62 
 
 
605 aa  125  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.89 
 
 
580 aa  126  1e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  27.81 
 
 
614 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  25.17 
 
 
598 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.14 
 
 
582 aa  120  6e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  26.12 
 
 
470 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0583  Chloride channel core  25.65 
 
 
462 aa  119  9.999999999999999e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2595  Cl- channel, voltage gated  30.12 
 
 
544 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.4857  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2485  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.61 
 
 
603 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6970  Cl- channel voltage-gated family protein  26.96 
 
 
452 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.06762  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2452  Cl- channel voltage-gated family protein  28.46 
 
 
603 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2412  putative chloride channel protein  27.86 
 
 
562 aa  110  5e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.03983  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1352  Cl- channel, voltage gated  26.63 
 
 
577 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3703  Chloride channel core  29.09 
 
 
436 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.474043  hitchhiker  0.000487156 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2005  Chloride channel core  27.49 
 
 
417 aa  109  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0177234  hitchhiker  0.0000000000738344 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2371  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.01 
 
 
418 aa  107  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.596743  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  27.16 
 
 
613 aa  107  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0693  Cl- channel, voltage gated  28.03 
 
 
564 aa  107  5e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0559233  hitchhiker  0.000374815 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4018  Chloride channel core  27.32 
 
 
453 aa  106  8e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.94873  normal  0.248767 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  30.38 
 
 
626 aa  105  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0939  Cl- channel voltage-gated family protein  24.2 
 
 
582 aa  105  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.564922  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  29.28 
 
 
608 aa  104  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1732  chloride channel core  26.92 
 
 
431 aa  103  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0292  chloride channel core protein  27.94 
 
 
455 aa  103  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.158347  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5259  voltage-gated chloride channel family protein  27.25 
 
 
410 aa  103  8e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.800881  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5657  voltage-gated chloride channel family protein  27.25 
 
 
410 aa  103  8e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1953  Chloride channel core  23 
 
 
429 aa  103  8e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0629221  normal  0.933518 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5502  voltage-gated chloride channel family protein  27.25 
 
 
410 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0274  Chloride channel core  26.92 
 
 
455 aa  102  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1622  Cl- channel, voltage-gated family protein  25.95 
 
 
754 aa  101  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0508  voltage-gated chloride channel  28.79 
 
 
435 aa  102  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3819  Cl- channel voltage-gated family protein  28.48 
 
 
456 aa  101  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5531  voltage-gated chloride channel family protein  25.71 
 
 
409 aa  101  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.556236  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.3 
 
 
587 aa  100  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0176  chloride channel core  24.15 
 
 
586 aa  100  4e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.406579 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0556  voltage gated chloride channel family protein  25.89 
 
 
437 aa  100  4e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  27.46 
 
 
669 aa  100  6e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0570  voltage-gated chloride channel family protein  26.28 
 
 
437 aa  100  7e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3300  Cl- channel, voltage gated  27.41 
 
 
585 aa  98.6  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0616826  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2352  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.49 
 
 
612 aa  98.6  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  25.85 
 
 
569 aa  98.2  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5201  chloride channel core  26.82 
 
 
409 aa  98.2  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5587  voltage-gated chloride channel family protein  25.19 
 
 
409 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  24.27 
 
 
584 aa  97.1  5e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2971  Chloride channel core  25.23 
 
 
605 aa  97.1  6e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0961  voltage-gated chloride channel  28.35 
 
 
435 aa  96.7  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4619  voltage-gated chloride channel family protein  28.02 
 
 
452 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1486  Cl- channel, voltage gated  28.02 
 
 
448 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1443  Cl- channel, voltage gated  27.27 
 
 
638 aa  95.5  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01048  Cl- channel, voltage gated  27.18 
 
 
443 aa  95.1  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.371868  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1603  voltage-gated chloride channel  28.35 
 
 
436 aa  95.5  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.845541  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06118  Cl- channel, voltage gated  27.18 
 
 
443 aa  95.1  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.12617  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1803  hypothetical protein  29.31 
 
 
431 aa  94.7  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0527819 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1543  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.95 
 
 
582 aa  94.4  3e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.445538 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2639  Chloride channel core  29.43 
 
 
457 aa  94.4  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.311853  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1406  voltage-gated chloride channel  28.65 
 
 
427 aa  94.4  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0225  voltage-gated chloride channel  28.65 
 
 
427 aa  94.4  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0261  voltage-gated chloride channel  28.65 
 
 
427 aa  94.4  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2677  chloride channel (ClC) family protein  28.09 
 
 
435 aa  93.6  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.267166  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2746  Cl- channel, voltage gated  28.2 
 
 
543 aa  93.6  7e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.43501  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3539  Chloride channel core  25.38 
 
 
415 aa  93.6  7e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2620  Cl- channel voltage-gated family protein  24.38 
 
 
452 aa  93.2  9e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.285702  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2134  Chloride channel core  26.01 
 
 
596 aa  92.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.262546  normal  0.105647 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.78 
 
 
598 aa  91.7  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4940  chloride channel core  29.22 
 
 
413 aa  92  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.530885 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0433  Cl- channel, voltage-gated family protein  24.47 
 
 
575 aa  91.3  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.346865  normal  0.0128311 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2534  chloride channel (ClC) family protein  28.09 
 
 
435 aa  91.3  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.508707  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0357  Cl- channel, voltage-gated family protein  25.11 
 
 
588 aa  89.7  8e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3883  chloride channel core  28.09 
 
 
603 aa  89.4  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.457213 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2417  chloride channel core protein  26.84 
 
 
612 aa  89.4  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2302  Cl- channel, voltage gated  28.27 
 
 
413 aa  89  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.191548  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1160  chloride channel core  27.4 
 
 
494 aa  89  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0545  Chloride channel core  25.93 
 
 
417 aa  89.4  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0459516  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3731  chloride channel core  28.83 
 
 
413 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184929  normal  0.597122 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6434  Chloride channel core  28.49 
 
 
600 aa  89  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1400  chloride channel, putative  24.94 
 
 
631 aa  89  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4536  Chloride channel core  24.86 
 
 
603 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.143283 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2161  chloride channel protein  28.27 
 
 
594 aa  89  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2504  Chloride channel core  26.84 
 
 
634 aa  88.2  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.244911  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1246  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.5 
 
 
620 aa  87.8  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2747  CLC-type chloride channel protein  26.01 
 
 
595 aa  88.2  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171436  normal  0.700779 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6390  Chloride channel core  25.43 
 
 
604 aa  87.8  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.315587  normal  0.638262 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4570  Cl- channel, voltage gated  29.13 
 
 
413 aa  88.2  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.615491  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3793  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.13 
 
 
413 aa  88.2  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.258404  normal  0.231279 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.83 
 
 
577 aa  87.8  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1130  Chloride channel core  23.15 
 
 
617 aa  87.8  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.711755  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2859  Cl- channel, voltage-gated family protein  24.14 
 
 
606 aa  87  5e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132128  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5286  Chloride channel core  24.94 
 
 
431 aa  87  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1448  Chloride channel core  24.81 
 
 
627 aa  87  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.132053  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4064  Cl- channel, voltage gated  27.08 
 
 
602 aa  86.3  9e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1039  Chloride channel core  26.76 
 
 
453 aa  86.3  0.000000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>