More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3124 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3124  Cl- channel, voltage gated  100 
 
 
596 aa  1184    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2181  Cl- channel voltage-gated family protein  80.38 
 
 
634 aa  800    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0845  Chloride channel core  57.34 
 
 
640 aa  597  1e-169  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0525209 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1257  chloride channel-like  47.43 
 
 
615 aa  422  1e-117  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.95023  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  33.33 
 
 
582 aa  270  4e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43785  predicted protein  40.05 
 
 
588 aa  246  6e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000378872  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  29.32 
 
 
608 aa  243  7.999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  30.13 
 
 
613 aa  241  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  29.92 
 
 
614 aa  231  4e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  32.51 
 
 
569 aa  229  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1352  Cl- channel, voltage gated  31.79 
 
 
577 aa  225  2e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39421  predicted protein  37.39 
 
 
649 aa  222  9.999999999999999e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  31.69 
 
 
615 aa  221  3.9999999999999997e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  32.8 
 
 
626 aa  218  2e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2221  putative chloride channel  34.68 
 
 
590 aa  214  4.9999999999999996e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247066  decreased coverage  0.00811968 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2950  Cl- channel, voltage gated  30.05 
 
 
613 aa  212  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.952562  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  28.52 
 
 
606 aa  212  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1448  Chloride channel core  32.83 
 
 
627 aa  210  6e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.132053  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1639  Cl- channel voltage-gated family protein  33.39 
 
 
597 aa  210  6e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2446  chloride channel core  29.08 
 
 
603 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6434  Chloride channel core  33.99 
 
 
600 aa  202  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1823  putative chloride channel  32.59 
 
 
593 aa  200  5e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.039576  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.73 
 
 
628 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.38 
 
 
579 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.38 
 
 
636 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.38 
 
 
579 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.38 
 
 
579 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0919  chloride channel, putative  32.98 
 
 
624 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.870319  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.57 
 
 
580 aa  197  5.000000000000001e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1400  chloride channel, putative  32.41 
 
 
631 aa  196  1e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2413  chloride channel core  29.89 
 
 
579 aa  192  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  32.46 
 
 
587 aa  191  4e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  37.68 
 
 
470 aa  188  2e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1184  Chloride channel core  32.18 
 
 
628 aa  187  4e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0945746  normal  0.895336 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.97 
 
 
598 aa  187  5e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.36 
 
 
589 aa  187  5e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  33.04 
 
 
584 aa  187  6e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2283  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.84 
 
 
591 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.72 
 
 
593 aa  185  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.72 
 
 
593 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29 
 
 
577 aa  182  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37468  ClC family transporter: chloride ion channel  39.27 
 
 
534 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00257506  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.46 
 
 
591 aa  181  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2437  chloride channel core  29.26 
 
 
629 aa  179  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.276438  normal  0.470563 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  28.05 
 
 
598 aa  177  6e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2543  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.61 
 
 
591 aa  177  7e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.232119  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.51 
 
 
589 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  31.2 
 
 
669 aa  176  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6342  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.21 
 
 
589 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867968  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1737  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.21 
 
 
589 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01992  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  36.09 
 
 
461 aa  172  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1622  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.43 
 
 
754 aa  171  3e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1246  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.72 
 
 
620 aa  171  5e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3504  chloride channel family protein  26.98 
 
 
602 aa  169  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2526  Chloride channel core  32.83 
 
 
589 aa  168  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3801  Chloride channel core  34.99 
 
 
464 aa  167  5e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3914  Chloride channel core  34.99 
 
 
464 aa  167  5e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2453  Cl- channel voltage-gated family protein  29.27 
 
 
605 aa  166  8e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2439  chloride channel core protein  32.64 
 
 
589 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.590865  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1421  Cl- channel, voltage gated  31.89 
 
 
586 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2452  Cl- channel voltage-gated family protein  28.64 
 
 
603 aa  162  1e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1514  Chloride channel core  31.2 
 
 
627 aa  162  2e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1761  Chloride channel core  28.54 
 
 
605 aa  155  2e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11720  Chloride channel core  32.8 
 
 
402 aa  154  5e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000807988  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1059  Chloride channel core  28.11 
 
 
625 aa  153  8.999999999999999e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3819  Cl- channel voltage-gated family protein  33.41 
 
 
456 aa  153  8.999999999999999e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0176  chloride channel core  26.35 
 
 
586 aa  152  2e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.406579 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4701  Chloride channel core  35.57 
 
 
471 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.10029 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2054  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.46 
 
 
565 aa  144  5e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.345027 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4507  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.37 
 
 
594 aa  142  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2595  Cl- channel, voltage gated  31.49 
 
 
544 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.4857  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0583  Chloride channel core  28.4 
 
 
462 aa  142  3e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  29.55 
 
 
862 aa  140  4.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2747  CLC-type chloride channel protein  30.38 
 
 
595 aa  140  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171436  normal  0.700779 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0939  Cl- channel voltage-gated family protein  27.66 
 
 
582 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.564922  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  27.01 
 
 
859 aa  137  4e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5804  Chloride channel core  32.03 
 
 
633 aa  137  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0433  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.13 
 
 
575 aa  137  8e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.346865  normal  0.0128311 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0832  chloride channel  28.96 
 
 
585 aa  136  9e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2485  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.22 
 
 
603 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3102  chloride channel protein  31.4 
 
 
471 aa  136  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0690  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.6 
 
 
591 aa  135  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.441434  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2746  Cl- channel, voltage gated  31.53 
 
 
543 aa  135  3e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.43501  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2971  Chloride channel core  27.85 
 
 
605 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2412  putative chloride channel protein  30.37 
 
 
562 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.03983  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2352  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.22 
 
 
612 aa  134  6.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4402  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.35 
 
 
598 aa  133  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0824696  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6390  Chloride channel core  28.44 
 
 
604 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.315587  normal  0.638262 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  30.17 
 
 
473 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1084  Chloride channel core  29.47 
 
 
606 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1431  Chloride channel core  26.89 
 
 
605 aa  132  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1534  Cl- channel, voltage gated  33.53 
 
 
527 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.123029  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  30.17 
 
 
473 aa  132  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  30.17 
 
 
473 aa  132  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  30.17 
 
 
473 aa  132  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1830  chloride channel protein EriC  29.72 
 
 
512 aa  131  4.0000000000000003e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.116382  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2495  Cl- channel voltage-gated family protein  26.38 
 
 
651 aa  130  5.0000000000000004e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.575116 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0630  Chloride channel core  32.09 
 
 
475 aa  130  5.0000000000000004e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2161  chloride channel protein  29.93 
 
 
594 aa  130  6e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0455  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.75 
 
 
560 aa  130  8.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>