More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2971 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_2452  Cl- channel voltage-gated family protein  64.67 
 
 
603 aa  756    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3504  chloride channel family protein  58.97 
 
 
602 aa  712    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1761  Chloride channel core  58.28 
 
 
605 aa  637    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2971  Chloride channel core  100 
 
 
605 aa  1201    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2485  Cl- channel, voltage-gated family protein  57.67 
 
 
603 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2352  Cl- channel, voltage-gated family protein  42.78 
 
 
612 aa  426  1e-118  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  42.47 
 
 
606 aa  411  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  36.55 
 
 
580 aa  350  5e-95  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2453  Cl- channel voltage-gated family protein  37.91 
 
 
605 aa  347  2e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1059  Chloride channel core  38.51 
 
 
625 aa  344  2e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  35.37 
 
 
598 aa  313  7.999999999999999e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1622  Cl- channel, voltage-gated family protein  34.16 
 
 
754 aa  301  2e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2495  Cl- channel voltage-gated family protein  36.01 
 
 
651 aa  299  1e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.575116 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0583  Chloride channel core  37.83 
 
 
462 aa  291  2e-77  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0176  chloride channel core  34.34 
 
 
586 aa  279  1e-73  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.406579 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0939  Cl- channel voltage-gated family protein  33.44 
 
 
582 aa  265  2e-69  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.564922  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0357  Cl- channel, voltage-gated family protein  33.92 
 
 
588 aa  248  2e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1431  Chloride channel core  33.33 
 
 
605 aa  243  7e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0928  Cl- channel, voltage-gated family protein  35.26 
 
 
612 aa  242  2e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.453543  hitchhiker  0.000208416 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1543  Cl- channel, voltage-gated family protein  33.84 
 
 
582 aa  237  4e-61  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.445538 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  32.39 
 
 
582 aa  236  8e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1071  hypothetical protein  34.51 
 
 
457 aa  229  1e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  32.52 
 
 
615 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  32.36 
 
 
613 aa  207  6e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  29.18 
 
 
608 aa  206  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  30.67 
 
 
614 aa  205  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1039  Chloride channel core  36.45 
 
 
453 aa  205  2e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  29.72 
 
 
569 aa  198  3e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2388  chloride channel core  34.03 
 
 
650 aa  197  3e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.360488 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10144  transmembrane protein  34.9 
 
 
492 aa  194  3e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1352  Cl- channel, voltage gated  31.46 
 
 
577 aa  189  9e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4507  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.82 
 
 
594 aa  188  3e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  31.99 
 
 
626 aa  186  8e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  33.02 
 
 
470 aa  186  8e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2728  Chloride channel core  30.13 
 
 
474 aa  184  3e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.969759  hitchhiker  0.00000000119016 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3129  voltage-gated chloride channel  31.11 
 
 
467 aa  184  5.0000000000000004e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.831797  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1448  Chloride channel core  29.88 
 
 
627 aa  184  6e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.132053  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1514  Chloride channel core  30.44 
 
 
627 aa  179  1e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1823  putative chloride channel  33.02 
 
 
593 aa  178  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.039576  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2595  Cl- channel, voltage gated  37.08 
 
 
544 aa  178  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.4857  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  32.5 
 
 
669 aa  177  4e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1400  chloride channel, putative  28.2 
 
 
631 aa  177  7e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0919  chloride channel, putative  30.61 
 
 
624 aa  176  9.999999999999999e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.870319  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1639  Cl- channel voltage-gated family protein  29.51 
 
 
597 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2543  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.46 
 
 
591 aa  173  1e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.232119  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6434  Chloride channel core  31.52 
 
 
600 aa  172  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1184  Chloride channel core  30.1 
 
 
628 aa  172  2e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0945746  normal  0.895336 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1246  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.67 
 
 
620 aa  172  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1241  Cl- channel, voltage-gated family protein  33.99 
 
 
428 aa  172  2e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.730218 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2221  putative chloride channel  31.12 
 
 
590 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247066  decreased coverage  0.00811968 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2437  chloride channel core  32.88 
 
 
629 aa  164  3e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.276438  normal  0.470563 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2446  chloride channel core  27.33 
 
 
603 aa  164  5.0000000000000005e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  30.62 
 
 
584 aa  163  9e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4402  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.52 
 
 
598 aa  162  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0824696  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.44 
 
 
598 aa  159  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2950  Cl- channel, voltage gated  26.74 
 
 
613 aa  159  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.952562  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0845  Chloride channel core  27.93 
 
 
640 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0525209 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.04 
 
 
591 aa  155  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0525  Cl- channel voltage-gated family protein  27.5 
 
 
579 aa  153  8e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1130  Chloride channel core  26.2 
 
 
617 aa  152  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.711755  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1953  Chloride channel core  27.74 
 
 
429 aa  150  7e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0629221  normal  0.933518 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.21 
 
 
577 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  33.79 
 
 
587 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0433  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.15 
 
 
575 aa  147  4.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.346865  normal  0.0128311 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.62 
 
 
636 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.02 
 
 
579 aa  146  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.02 
 
 
579 aa  146  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.02 
 
 
579 aa  146  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0832  chloride channel  29.88 
 
 
585 aa  145  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2413  chloride channel core  29.62 
 
 
579 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.12 
 
 
628 aa  144  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0493  Chloride channel core  25.32 
 
 
598 aa  143  7e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.37 
 
 
589 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1443  Cl- channel, voltage gated  41.89 
 
 
638 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.37 
 
 
593 aa  141  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.37 
 
 
593 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2417  chloride channel core protein  42.7 
 
 
612 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2504  Chloride channel core  42.7 
 
 
634 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.244911  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2283  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.84 
 
 
591 aa  139  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3525  Chloride channel core  31.25 
 
 
533 aa  139  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6342  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.9 
 
 
589 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867968  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1737  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.9 
 
 
589 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2552  Chloride channel core  33.33 
 
 
531 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.113162  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3300  Cl- channel, voltage gated  28.7 
 
 
585 aa  135  3e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0616826  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.57 
 
 
589 aa  134  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2520  Chloride channel core  27.27 
 
 
594 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1421  Cl- channel, voltage gated  28.82 
 
 
586 aa  131  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11720  Chloride channel core  33.44 
 
 
402 aa  130  9.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000807988  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3819  Cl- channel voltage-gated family protein  31.57 
 
 
456 aa  127  5e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2090  Cl- channel, voltage gated  25.23 
 
 
434 aa  126  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0263619  hitchhiker  0.00000244814 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0552  Chloride channel core  26 
 
 
614 aa  126  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18832  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2526  Chloride channel core  28.2 
 
 
589 aa  124  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2439  chloride channel core protein  28 
 
 
589 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.590865  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  28.31 
 
 
519 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0690  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.71 
 
 
591 aa  122  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.441434  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2699  Chloride channel core  28.74 
 
 
605 aa  121  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  28.01 
 
 
519 aa  120  7e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1257  chloride channel-like  28.03 
 
 
615 aa  119  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.95023  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2144  Cl- channel voltage-gated family protein  28.43 
 
 
604 aa  119  9.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2309  Chloride channel core  28.57 
 
 
605 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.76278  hitchhiker  0.00000714896 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>