More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4018 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4018  Chloride channel core  100 
 
 		 453 aa  907    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.94873  normal  0.248767 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6970  Cl- channel voltage-gated family protein  59.21 
 
 		 452 aa  504  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.06762  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0837  Cl- channel, voltage-gated family protein  57.94 
 
 		 462 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.115914  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1136  hypothetical protein  56.23 
 
 		 482 aa  441  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0839262  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2639  Chloride channel core  55.61 
 
 		 457 aa  425  1e-118  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.311853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3703  Chloride channel core  48.35 
 
 		 436 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.474043  hitchhiker  0.000487156 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1732  chloride channel core  49.3 
 
 		 431 aa  370  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01048  Cl- channel, voltage gated  48.8 
 
 		 443 aa  361  1e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.371868  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06118  Cl- channel, voltage gated  48.8 
 
 		 443 aa  361  1e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.12617  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1486  Cl- channel, voltage gated  47.41 
 
 		 448 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4619  voltage-gated chloride channel family protein  47.41 
 
 		 452 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4094  Chloride channel core  47.41 
 
 		 426 aa  353  2e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.089965  normal  0.148511 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3981  Chloride channel core  47.41 
 
 		 426 aa  353  2e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0961  voltage-gated chloride channel  48.35 
 
 		 435 aa  349  5e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0508  voltage-gated chloride channel  48.58 
 
 		 435 aa  349  6e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1603  voltage-gated chloride channel  48.35 
 
 		 436 aa  348  8e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.845541  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2677  chloride channel (ClC) family protein  48.11 
 
 		 435 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.267166  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2302  Cl- channel, voltage gated  46.71 
 
 		 413 aa  344  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.191548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0261  voltage-gated chloride channel  48.45 
 
 		 427 aa  343  4e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0225  voltage-gated chloride channel  48.45 
 
 		 427 aa  343  4e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1406  voltage-gated chloride channel  48.45 
 
 		 427 aa  343  4e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3731  chloride channel core  46.21 
 
 		 413 aa  342  1e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184929  normal  0.597122 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4570  Cl- channel, voltage gated  46.21 
 
 		 413 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.615491  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3793  Cl- channel, voltage-gated family protein  46.21 
 
 		 413 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.258404  normal  0.231279 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4940  chloride channel core  45.97 
 
 		 413 aa  336  5e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.530885 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2534  chloride channel (ClC) family protein  48.11 
 
 		 435 aa  333  3e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.508707  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5519  Cl- channel, voltage-gated family protein  44.93 
 
 		 413 aa  333  4e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.720023  normal  0.391886 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3685  chloride channel core  44.93 
 
 		 468 aa  332  9e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.36379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2064  chloride channel core  47.42 
 
 		 440 aa  327  2.0000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0178242 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0570  voltage-gated chloride channel family protein  43.49 
 
 		 437 aa  324  2e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0556  voltage gated chloride channel family protein  43.75 
 
 		 437 aa  324  2e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1803  hypothetical protein  47.93 
 
 		 431 aa  323  5e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0527819 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0545  Chloride channel core  42.72 
 
 		 417 aa  321  9.999999999999999e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0459516  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3539  Chloride channel core  43.81 
 
 		 415 aa  315  9.999999999999999e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1026  chloride channel core  46.62 
 
 		 421 aa  300  5e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.724519  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2371  Cl- channel, voltage-gated family protein  43.18 
 
 		 418 aa  299  7e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.596743  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2367  Chloride channel core  42.58 
 
 		 438 aa  286  7e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2180  Cl- channel, voltage gated  35.66 
 
 		 435 aa  226  5.0000000000000005e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000426596  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0541  voltage-gated chloride channel family protein  38.56 
 
 		 398 aa  226  7e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1199  chloride channel protein EriC  34.37 
 
 		 403 aa  218  1e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00235154  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1145  chloride channel protein EriC  36.12 
 
 		 408 aa  216  5.9999999999999996e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000190492  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2620  Cl- channel voltage-gated family protein  32 
 
 		 452 aa  216  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.285702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3273  Cl- channel, voltage-gated family protein  33.25 
 
 		 481 aa  177  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0292  chloride channel core protein  31.4 
 
 		 455 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.158347  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1160  chloride channel core  29.76 
 
 		 494 aa  163  6e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0274  Chloride channel core  30.61 
 
 		 455 aa  161  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  29.9 
 
 		 606 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2090  Cl- channel, voltage gated  27.32 
 
 		 434 aa  106  8e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0263619  hitchhiker  0.00000244814 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.9 
 
 		 591 aa  106  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  27.69 
 
 		 598 aa  106  9e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0832  chloride channel  27.91 
 
 		 585 aa  102  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.01 
 
 		 598 aa  100  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13300  chloride channel protein EriC  24.69 
 
 		 414 aa  99  2e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.81 
 
 		 589 aa  97.8  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.38 
 
 		 579 aa  96.7  7e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.38 
 
 		 579 aa  96.7  7e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.38 
 
 		 579 aa  96.7  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.38 
 
 		 636 aa  96.7  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1953  Chloride channel core  26.32 
 
 		 429 aa  95.1  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0629221  normal  0.933518 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.65 
 
 		 577 aa  93.2  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3914  Chloride channel core  29.7 
 
 		 464 aa  92.8  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3801  Chloride channel core  29.7 
 
 		 464 aa  92.8  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2446  chloride channel core  26.19 
 
 		 603 aa  92  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0583  Chloride channel core  28.78 
 
 		 462 aa  92  2e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2283  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.46 
 
 		 591 aa  91.3  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.39 
 
 		 587 aa  91.7  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.54 
 
 		 593 aa  90.9  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.08 
 
 		 628 aa  90.5  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.27 
 
 		 593 aa  88.6  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1443  Cl- channel, voltage gated  26.04 
 
 		 638 aa  88.2  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2504  Chloride channel core  35.9 
 
 		 634 aa  87.4  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.244911  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2417  chloride channel core protein  35.9 
 
 		 612 aa  87.4  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0176  chloride channel core  27.53 
 
 		 586 aa  86.7  7e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.406579 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.61 
 
 		 589 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.46 
 
 		 580 aa  86.3  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6342  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.08 
 
 		 589 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867968  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1737  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.08 
 
 		 589 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01992  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.11 
 
 		 461 aa  83.6  0.000000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0690  Cl- channel, voltage-gated family protein  25.23 
 
 		 591 aa  83.2  0.000000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.441434  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2352  Cl- channel, voltage-gated family protein  34.32 
 
 		 612 aa  83.2  0.000000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1362  Chloride channel core  28.07 
 
 		 393 aa  82.4  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00220045  normal  0.308625 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4507  Cl- channel, voltage-gated family protein  24.3 
 
 		 594 aa  82.4  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2495  Cl- channel voltage-gated family protein  27.7 
 
 		 651 aa  81.6  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.575116 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1241  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.87 
 
 		 428 aa  80.9  0.00000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.730218 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1071  hypothetical protein  28.05 
 
 		 457 aa  80.5  0.00000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0814  voltage-gated chloride channel  28.36 
 
 		 461 aa  79.7  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.802011  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0928  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.62 
 
 		 612 aa  79.7  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.453543  hitchhiker  0.000208416 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0956  Chloride channel core  28.36 
 
 		 461 aa  79.7  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  24.5 
 
 		 614 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  24.31 
 
 		 613 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2728  Chloride channel core  26.08 
 
 		 474 aa  77.8  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.969759  hitchhiker  0.00000000119016 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1622  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.1 
 
 		 754 aa  77.4  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3129  voltage-gated chloride channel  26.08 
 
 		 467 aa  77.4  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.831797  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2453  Cl- channel voltage-gated family protein  34.42 
 
 		 605 aa  77  0.0000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4701  Chloride channel core  27.25 
 
 		 471 aa  76.3  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.10029 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3504  chloride channel family protein  28.78 
 
 		 602 aa  76.3  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0455  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.76 
 
 		 560 aa  75.5  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0939  Cl- channel voltage-gated family protein  26.72 
 
 		 582 aa  74.3  0.000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.564922  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1681  Chloride channel core  30.18 
 
 		 443 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.366946 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1543  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.88 
 
 		 582 aa  72  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.445538 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>