More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1681 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2770  putative chloride channel protein, voltage gated  92.1 
 
 		 443 aa  732    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302923  normal  0.298646 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1681  Chloride channel core  100 
 
 		 443 aa  856    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.366946 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3746  Cl- channel, voltage-gated family protein  72.43 
 
 		 445 aa  544  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0508367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4037  Cl- channel, voltage gated  71.92 
 
 		 444 aa  521  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4329  Cl- channel, voltage-gated family protein  71.92 
 
 		 444 aa  521  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.348513 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3192  chloride channel core  70.63 
 
 		 421 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4220  chloride channel core  71.11 
 
 		 425 aa  508  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587227  normal  0.520774 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1678  Cl- channel, voltage gated  71.57 
 
 		 444 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.488557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4280  chloride channel core  69.65 
 
 		 448 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29976  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0608  voltage gated chloride channel family protein  69.87 
 
 		 448 aa  481  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1040  voltage gated chloride channel family protein  69.87 
 
 		 448 aa  481  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1126  chloride channel (ClC) family protein  70.9 
 
 		 476 aa  482  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2340  voltage gated chloride channel family protein  70.9 
 
 		 513 aa  481  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0859  voltage gated chloride channel family protein  70.9 
 
 		 504 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1825  voltage gated chloride channel family protein  70.9 
 
 		 476 aa  481  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1861  hypothetical protein  56.1 
 
 		 426 aa  432  1e-120  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1856  hypothetical protein  55.85 
 
 		 426 aa  429  1e-119  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0576  Cl- channel, voltage-gated family protein  55.08 
 
 		 416 aa  356  5.999999999999999e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0254  Chloride channel core  38.05 
 
 		 462 aa  193  5e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1179  voltage-gated chloride channel family protein  34.46 
 
 		 418 aa  174  3.9999999999999995e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1016  chloride channel, core  33.25 
 
 		 419 aa  169  7e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6206  Chloride channel core  38.93 
 
 		 504 aa  158  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0706  chloride channel protein EriC  32.48 
 
 		 420 aa  154  4e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.208115  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0799  chloride channel protein EriC  33.05 
 
 		 427 aa  152  1e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2413  chloride channel core  34.13 
 
 		 579 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4538  Cl- channel, voltage-gated family protein  35.39 
 
 		 398 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.839799  normal  0.792833 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  32.23 
 
 		 598 aa  119  9e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  28.48 
 
 		 470 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1421  Cl- channel, voltage gated  33.62 
 
 		 586 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0881  chloride transporter, ClC family  30.33 
 
 		 465 aa  116  8.999999999999998e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.56 
 
 		 589 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2526  Chloride channel core  33.91 
 
 		 589 aa  113  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2439  chloride channel core protein  33.91 
 
 		 589 aa  113  9e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.590865  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.37 
 
 		 589 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.63 
 
 		 593 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6342  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  32.24 
 
 		 589 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867968  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.63 
 
 		 593 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1737  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  32.24 
 
 		 589 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3746  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.23 
 
 		 414 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.556146 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2543  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.33 
 
 		 591 aa  109  9.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.232119  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.79 
 
 		 579 aa  108  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.79 
 
 		 579 aa  108  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.79 
 
 		 636 aa  108  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.79 
 
 		 579 aa  108  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.85 
 
 		 628 aa  107  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  31.96 
 
 		 569 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  27.9 
 
 		 519 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  27.9 
 
 		 519 aa  105  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.03 
 
 		 591 aa  104  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0455  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  33.55 
 
 		 560 aa  103  8e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.31 
 
 		 582 aa  102  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  31.47 
 
 		 608 aa  101  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1448  Chloride channel core  29.14 
 
 		 627 aa  102  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.132053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0688  chloride channel protein  33.33 
 
 		 488 aa  101  3e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.27 
 
 		 577 aa  100  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  32.84 
 
 		 584 aa  100  8e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2283  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.72 
 
 		 591 aa  99  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3504  chloride channel family protein  27.3 
 
 		 602 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3914  Chloride channel core  30.2 
 
 		 464 aa  96.3  9e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3801  Chloride channel core  30.2 
 
 		 464 aa  96.3  9e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1867  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.53 
 
 		 414 aa  95.1  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.396231  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1979  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.53 
 
 		 426 aa  94.7  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2049  Chloride channel core  29.62 
 
 		 596 aa  95.5  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.993111  normal  0.527331 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  26.29 
 
 		 615 aa  95.1  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2285  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.41 
 
 		 426 aa  95.5  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397915  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_003296  RS01992  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.71 
 
 		 461 aa  93.6  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2446  chloride channel core  29.48 
 
 		 603 aa  92.4  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  29.85 
 
 		 669 aa  90.9  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  26.98 
 
 		 614 aa  90.1  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2452  Cl- channel voltage-gated family protein  27.96 
 
 		 603 aa  89.4  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  27.15 
 
 		 613 aa  87.8  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1327  chloride channel core  25.68 
 
 		 579 aa  87.4  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.775399  normal  0.325244 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0583  Chloride channel core  26.09 
 
 		 462 aa  87  5e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  27 
 
 		 473 aa  86.7  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  27 
 
 		 473 aa  86.7  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3102  chloride channel protein  29.24 
 
 		 471 aa  86.7  9e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  27 
 
 		 473 aa  86.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  27 
 
 		 473 aa  86.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  27 
 
 		 473 aa  86.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0516  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.21 
 
 		 601 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132092  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0556  voltage gated chloride channel family protein  28.43 
 
 		 437 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0681  Chloride channel core  24.74 
 
 		 538 aa  85.5  0.000000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0570  voltage-gated chloride channel family protein  28.76 
 
 		 437 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0695  chloride channel protein  28.95 
 
 		 466 aa  84.3  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.750689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  26.07 
 
 		 606 aa  84.3  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1576  chloride channel protein  30.9 
 
 		 463 aa  84  0.000000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.803836 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0367  Chloride channel core  29.56 
 
 		 595 aa  83.2  0.000000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1830  chloride channel protein EriC  27.11 
 
 		 512 aa  82.8  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.116382  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1514  Chloride channel core  27.24 
 
 		 627 aa  82.8  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4018  Chloride channel core  30.18 
 
 		 453 aa  82  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.94873  normal  0.248767 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1246  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.24 
 
 		 620 aa  81.6  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3273  Cl- channel, voltage-gated family protein  32.57 
 
 		 481 aa  81.3  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4701  Chloride channel core  28.98 
 
 		 471 aa  80.9  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.10029 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.65 
 
 		 587 aa  80.9  0.00000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0690  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.52 
 
 		 591 aa  80.5  0.00000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.441434  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1199  chloride channel protein EriC  29.06 
 
 		 403 aa  80.1  0.00000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00235154  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3703  Chloride channel core  29.01 
 
 		 436 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.474043  hitchhiker  0.000487156 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1059  Chloride channel core  27.78 
 
 		 625 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6970  Cl- channel voltage-gated family protein  29.76 
 
 		 452 aa  79.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.06762  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3300  Cl- channel, voltage gated  26.33 
 
 		 585 aa  79  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0616826  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>