More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1678 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3192  chloride channel core  90.31 
 
 
421 aa  694    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4280  chloride channel core  84.51 
 
 
448 aa  644    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29976  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1678  Cl- channel, voltage gated  100 
 
 
444 aa  850    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.488557  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4220  chloride channel core  89.79 
 
 
425 aa  682    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587227  normal  0.520774 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4037  Cl- channel, voltage gated  88.96 
 
 
444 aa  703    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3746  Cl- channel, voltage-gated family protein  90.95 
 
 
445 aa  726    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0508367  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4329  Cl- channel, voltage-gated family protein  88.96 
 
 
444 aa  703    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.348513 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2770  putative chloride channel protein, voltage gated  74.75 
 
 
443 aa  526  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302923  normal  0.298646 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1681  Chloride channel core  71.7 
 
 
443 aa  520  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.366946 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1126  chloride channel (ClC) family protein  72.6 
 
 
476 aa  511  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0608  voltage gated chloride channel family protein  72.6 
 
 
448 aa  511  1e-144  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2340  voltage gated chloride channel family protein  72.84 
 
 
513 aa  512  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0859  voltage gated chloride channel family protein  72.6 
 
 
504 aa  511  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1825  voltage gated chloride channel family protein  72.6 
 
 
476 aa  512  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1040  voltage gated chloride channel family protein  72.84 
 
 
448 aa  512  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1861  hypothetical protein  54.59 
 
 
426 aa  429  1e-119  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1856  hypothetical protein  55.19 
 
 
426 aa  426  1e-118  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0576  Cl- channel, voltage-gated family protein  54.79 
 
 
416 aa  357  1.9999999999999998e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0254  Chloride channel core  37.84 
 
 
462 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1179  voltage-gated chloride channel family protein  32.3 
 
 
418 aa  179  5.999999999999999e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0706  chloride channel protein EriC  34.25 
 
 
420 aa  170  5e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.208115  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1016  chloride channel, core  31.12 
 
 
419 aa  166  6.9999999999999995e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0799  chloride channel protein EriC  32.78 
 
 
427 aa  166  1.0000000000000001e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6206  Chloride channel core  42.72 
 
 
504 aa  159  8e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2413  chloride channel core  32.01 
 
 
579 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0881  chloride transporter, ClC family  29.93 
 
 
465 aa  125  1e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4538  Cl- channel, voltage-gated family protein  38.32 
 
 
398 aa  123  8e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.839799  normal  0.792833 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2543  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.77 
 
 
591 aa  122  9e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.232119  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0688  chloride channel protein  37.04 
 
 
488 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.92 
 
 
589 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.82 
 
 
598 aa  117  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  30.05 
 
 
669 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  32.18 
 
 
593 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  32.18 
 
 
593 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  27.98 
 
 
470 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  32.04 
 
 
608 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.49 
 
 
589 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6342  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.82 
 
 
589 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867968  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1737  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.82 
 
 
589 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1979  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  32.73 
 
 
426 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1867  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  32.73 
 
 
414 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.396231  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  32.53 
 
 
579 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2285  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.47 
 
 
426 aa  108  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397915  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  32.53 
 
 
579 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  32.53 
 
 
579 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  32.53 
 
 
636 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1448  Chloride channel core  28.92 
 
 
627 aa  107  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.132053  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  32.43 
 
 
628 aa  106  8e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  32.87 
 
 
584 aa  101  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1421  Cl- channel, voltage gated  32.6 
 
 
586 aa  100  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.12 
 
 
577 aa  100  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  29.79 
 
 
613 aa  99.8  9e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2439  chloride channel core protein  32.97 
 
 
589 aa  99.4  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.590865  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0455  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  33.43 
 
 
560 aa  99  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.36 
 
 
591 aa  98.2  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  29.23 
 
 
569 aa  97.8  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  28.93 
 
 
614 aa  97.8  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  27.93 
 
 
606 aa  97.4  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3504  chloride channel family protein  26.41 
 
 
602 aa  97.4  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2526  Chloride channel core  32.7 
 
 
589 aa  97.4  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2452  Cl- channel voltage-gated family protein  29.81 
 
 
603 aa  95.9  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2283  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.07 
 
 
591 aa  93.2  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3801  Chloride channel core  29.35 
 
 
464 aa  92  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3914  Chloride channel core  29.35 
 
 
464 aa  92  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01992  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.11 
 
 
461 aa  90.9  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  27.69 
 
 
519 aa  91.3  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2049  Chloride channel core  28.18 
 
 
596 aa  90.5  5e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.993111  normal  0.527331 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  27.69 
 
 
519 aa  90.1  8e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1184  Chloride channel core  30.98 
 
 
628 aa  87.4  4e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0945746  normal  0.895336 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  29.85 
 
 
863 aa  87.4  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2446  chloride channel core  27.38 
 
 
603 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3746  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.85 
 
 
414 aa  85.1  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.556146 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1400  chloride channel, putative  29.97 
 
 
631 aa  84.3  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1514  Chloride channel core  28.05 
 
 
627 aa  84.3  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0367  Chloride channel core  26.85 
 
 
595 aa  84.3  0.000000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1246  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.24 
 
 
620 aa  84  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0681  Chloride channel core  25 
 
 
538 aa  83.6  0.000000000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2950  Cl- channel, voltage gated  25.29 
 
 
613 aa  83.6  0.000000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.952562  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0690  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.04 
 
 
591 aa  83.2  0.000000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.441434  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4940  chloride channel core  29.75 
 
 
413 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.530885 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1059  Chloride channel core  27.11 
 
 
625 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6434  Chloride channel core  31.48 
 
 
600 aa  81.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1327  chloride channel core  27.07 
 
 
579 aa  82  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.775399  normal  0.325244 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4570  Cl- channel, voltage gated  28.93 
 
 
413 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.615491  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3883  chloride channel core  29.39 
 
 
603 aa  81.6  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.457213 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3793  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.93 
 
 
413 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.258404  normal  0.231279 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4427  Cl- channel, voltage-gated family protein  30 
 
 
439 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.292219 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4200  Cl- channel, voltage gated  30 
 
 
439 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.419413  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4266  Cl- channel, voltage-gated family protein  30 
 
 
439 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal  0.948351 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3102  chloride channel protein  27.19 
 
 
471 aa  80.5  0.00000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11720  Chloride channel core  27.85 
 
 
402 aa  80.5  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000807988  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3731  chloride channel core  28.65 
 
 
413 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184929  normal  0.597122 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  29 
 
 
582 aa  79  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3703  Chloride channel core  28.25 
 
 
436 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.474043  hitchhiker  0.000487156 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.69 
 
 
580 aa  79  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2352  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.51 
 
 
612 aa  78.6  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.96 
 
 
587 aa  78.6  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1639  Cl- channel voltage-gated family protein  30.61 
 
 
597 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4701  Chloride channel core  29.7 
 
 
471 aa  77.4  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.10029 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0583  Chloride channel core  25.81 
 
 
462 aa  76.6  0.0000000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>