151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0881 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0881  chloride transporter, ClC family  100 
 
 		 465 aa  929    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0706  chloride channel protein EriC  35.39 
 
 		 420 aa  191  2.9999999999999997e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.208115  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0799  chloride channel protein EriC  34.77 
 
 		 427 aa  189  1e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1016  chloride channel, core  31.86 
 
 		 419 aa  182  8.000000000000001e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0688  chloride channel protein  39.67 
 
 		 488 aa  161  2e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1861  hypothetical protein  28.38 
 
 		 426 aa  127  5e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1856  hypothetical protein  28.82 
 
 		 426 aa  126  7e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3746  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.76 
 
 		 445 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0508367  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1179  voltage-gated chloride channel family protein  27.23 
 
 		 418 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4037  Cl- channel, voltage gated  29.33 
 
 		 444 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4329  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.33 
 
 		 444 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.348513 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3192  chloride channel core  29.57 
 
 		 421 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1681  Chloride channel core  30.64 
 
 		 443 aa  107  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.366946 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4220  chloride channel core  28.98 
 
 		 425 aa  107  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587227  normal  0.520774 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2770  putative chloride channel protein, voltage gated  29.2 
 
 		 443 aa  104  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302923  normal  0.298646 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1678  Cl- channel, voltage gated  28.3 
 
 		 444 aa  102  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.488557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0576  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.88 
 
 		 416 aa  95.9  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0608  voltage gated chloride channel family protein  28.64 
 
 		 448 aa  94.4  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2340  voltage gated chloride channel family protein  28.81 
 
 		 513 aa  95.1  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1040  voltage gated chloride channel family protein  28.88 
 
 		 448 aa  95.1  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0859  voltage gated chloride channel family protein  28.57 
 
 		 504 aa  94.4  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1825  voltage gated chloride channel family protein  28.57 
 
 		 476 aa  94  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1126  chloride channel (ClC) family protein  28.57 
 
 		 476 aa  92.8  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4280  chloride channel core  28.88 
 
 		 448 aa  91.3  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.24 
 
 		 577 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1576  chloride channel protein  27.71 
 
 		 463 aa  82.4  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.803836 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  25.6 
 
 		 606 aa  80.1  0.00000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.54 
 
 		 589 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0583  Chloride channel core  27.52 
 
 		 462 aa  77.4  0.0000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.63 
 
 		 598 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3504  chloride channel family protein  22.16 
 
 		 602 aa  75.5  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.71 
 
 		 593 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4538  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.53 
 
 		 398 aa  73.6  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.839799  normal  0.792833 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.71 
 
 		 593 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.45 
 
 		 591 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3914  Chloride channel core  25.71 
 
 		 464 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6342  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.41 
 
 		 589 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867968  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1737  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.41 
 
 		 589 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3801  Chloride channel core  25.71 
 
 		 464 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.12 
 
 		 589 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.13 
 
 		 628 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  25.57 
 
 		 470 aa  67.4  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0832  chloride channel  23.99 
 
 		 585 aa  66.6  0.0000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.21 
 
 		 579 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.21 
 
 		 579 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.21 
 
 		 579 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01992  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.83 
 
 		 461 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.21 
 
 		 636 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  25.45 
 
 		 598 aa  66.2  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1979  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  23.92 
 
 		 426 aa  65.1  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1867  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  23.92 
 
 		 414 aa  64.3  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.396231  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2285  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.14 
 
 		 426 aa  63.5  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397915  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.2 
 
 		 582 aa  62.8  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0176  chloride channel core  27.08 
 
 		 586 aa  62  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.406579 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1732  chloride channel core  25.97 
 
 		 431 aa  62.4  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2283  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.75 
 
 		 591 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  25.47 
 
 		 519 aa  60.8  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  20.69 
 
 		 614 aa  60.1  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  21.25 
 
 		 613 aa  59.3  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3525  Chloride channel core  23.68 
 
 		 533 aa  59.7  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4701  Chloride channel core  26.96 
 
 		 471 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.10029 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2049  Chloride channel core  22.74 
 
 		 596 aa  58.9  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.993111  normal  0.527331 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4570  Cl- channel, voltage gated  23.7 
 
 		 413 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.615491  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  24.55 
 
 		 473 aa  59.3  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  25.37 
 
 		 519 aa  58.9  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3793  Cl- channel, voltage-gated family protein  23.7 
 
 		 413 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.258404  normal  0.231279 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  24.55 
 
 		 473 aa  59.3  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  24.55 
 
 		 473 aa  59.3  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3731  chloride channel core  25.19 
 
 		 413 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184929  normal  0.597122 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0455  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.56 
 
 		 560 aa  58.5  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2495  Cl- channel voltage-gated family protein  24.29 
 
 		 651 aa  58.2  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.575116 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2543  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.34 
 
 		 591 aa  57.4  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.232119  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3300  Cl- channel, voltage gated  23.31 
 
 		 585 aa  57.8  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0616826  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  24.24 
 
 		 473 aa  57.4  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2944  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.51 
 
 		 526 aa  57.4  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0120087  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  24.24 
 
 		 473 aa  57.4  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  22.62 
 
 		 587 aa  57.4  0.0000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2746  Cl- channel, voltage gated  27.37 
 
 		 543 aa  56.6  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.43501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2302  Cl- channel, voltage gated  23.19 
 
 		 413 aa  55.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.191548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A25  chloride channel protein EriC  23.77 
 
 		 510 aa  55.1  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1071  hypothetical protein  23.27 
 
 		 457 aa  55.5  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4920  Cl- channel, voltage-gated family protein  22.14 
 
 		 426 aa  55.1  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2413  chloride channel core  25.57 
 
 		 579 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6434  Chloride channel core  26.52 
 
 		 600 aa  55.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2526  Chloride channel core  38.39 
 
 		 589 aa  55.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2439  chloride channel core protein  38.39 
 
 		 589 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.590865  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2366  Cl- channel voltage-gated family protein  26.77 
 
 		 416 aa  54.7  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0189  chloride channel, core  23.51 
 
 		 445 aa  54.7  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0757  Chloride channel core  23.75 
 
 		 528 aa  54.3  0.000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.937422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1059  Chloride channel core  24.66 
 
 		 625 aa  53.9  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3746  Cl- channel, voltage-gated family protein  24.69 
 
 		 414 aa  53.9  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.556146 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1622  Cl- channel, voltage-gated family protein  21.91 
 
 		 754 aa  53.9  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0695  chloride channel protein  24.7 
 
 		 466 aa  53.9  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.750689  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1107  voltage-gated chloride channel family protein  23.85 
 
 		 510 aa  53.5  0.000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0292  chloride channel core protein  20.82 
 
 		 455 aa  53.9  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.158347  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0274  Chloride channel core  20.48 
 
 		 455 aa  53.1  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0693  Cl- channel, voltage gated  23.71 
 
 		 564 aa  52.8  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0559233  hitchhiker  0.000374815 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6206  Chloride channel core  28.67 
 
 		 504 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2437  chloride channel core  23.03 
 
 		 629 aa  51.6  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.276438  normal  0.470563 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1448  Chloride channel core  22.97 
 
 		 627 aa  51.2  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.132053  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>