292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1016 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1016  chloride channel, core  100 
 
 		 419 aa  843    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0706  chloride channel protein EriC  55.42 
 
 		 420 aa  406  1.0000000000000001e-112  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.208115  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0799  chloride channel protein EriC  50.13 
 
 		 427 aa  361  1e-98  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0881  chloride transporter, ClC family  31.44 
 
 		 465 aa  176  6e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0688  chloride channel protein  39.86 
 
 		 488 aa  176  7e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3746  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.1 
 
 		 445 aa  167  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0508367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1681  Chloride channel core  36.1 
 
 		 443 aa  162  7e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.366946 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3192  chloride channel core  34.86 
 
 		 421 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4037  Cl- channel, voltage gated  34.15 
 
 		 444 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4329  Cl- channel, voltage-gated family protein  34.15 
 
 		 444 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.348513 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2770  putative chloride channel protein, voltage gated  35.53 
 
 		 443 aa  162  9e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302923  normal  0.298646 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4220  chloride channel core  32.79 
 
 		 425 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587227  normal  0.520774 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1179  voltage-gated chloride channel family protein  29.02 
 
 		 418 aa  157  5.0000000000000005e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4280  chloride channel core  33.76 
 
 		 448 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29976  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1856  hypothetical protein  30.86 
 
 		 426 aa  148  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1678  Cl- channel, voltage gated  33.06 
 
 		 444 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.488557  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1861  hypothetical protein  31.34 
 
 		 426 aa  144  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0576  Cl- channel, voltage-gated family protein  33.33 
 
 		 416 aa  137  5e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1040  voltage gated chloride channel family protein  32.48 
 
 		 448 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0608  voltage gated chloride channel family protein  32.19 
 
 		 448 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2340  voltage gated chloride channel family protein  32.48 
 
 		 513 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1825  voltage gated chloride channel family protein  32.19 
 
 		 476 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0859  voltage gated chloride channel family protein  32.19 
 
 		 504 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1126  chloride channel (ClC) family protein  31.91 
 
 		 476 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.43 
 
 		 598 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2543  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.7 
 
 		 591 aa  106  7e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.232119  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.93 
 
 		 577 aa  106  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.27 
 
 		 593 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.27 
 
 		 593 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.18 
 
 		 591 aa  102  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.75 
 
 		 589 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0254  Chloride channel core  31.04 
 
 		 462 aa  101  2e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0583  Chloride channel core  24.54 
 
 		 462 aa  100  5e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.75 
 
 		 579 aa  99.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.75 
 
 		 579 aa  99.4  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.07 
 
 		 636 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6342  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.52 
 
 		 589 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867968  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.75 
 
 		 579 aa  99.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1737  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.52 
 
 		 589 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.45 
 
 		 628 aa  98.6  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.52 
 
 		 589 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0455  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.48 
 
 		 560 aa  97.4  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4920  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.89 
 
 		 426 aa  97.1  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  25.06 
 
 		 613 aa  95.1  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.51 
 
 		 582 aa  94.4  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1352  Cl- channel, voltage gated  30.03 
 
 		 577 aa  92.8  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2283  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.33 
 
 		 591 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  27.19 
 
 		 614 aa  91.3  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1622  Cl- channel, voltage-gated family protein  25.34 
 
 		 754 aa  90.9  4e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.19 
 
 		 587 aa  90.1  7e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  24.51 
 
 		 580 aa  87.8  3e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0939  Cl- channel voltage-gated family protein  27.61 
 
 		 582 aa  87.4  4e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.564922  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2285  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.35 
 
 		 426 aa  87.4  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397915  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0832  chloride channel  24.87 
 
 		 585 aa  87.4  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0176  chloride channel core  27.61 
 
 		 586 aa  85.5  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.406579 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4538  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.9 
 
 		 398 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.839799  normal  0.792833 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  28.66 
 
 		 863 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_003296  RS01992  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.1 
 
 		 461 aa  84.7  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0367  Chloride channel core  24.4 
 
 		 595 aa  84.3  0.000000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  25.49 
 
 		 584 aa  83.6  0.000000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1867  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.39 
 
 		 414 aa  83.6  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.396231  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1979  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.39 
 
 		 426 aa  83.6  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  25.87 
 
 		 606 aa  82.8  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  24.45 
 
 		 863 aa  82.4  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3801  Chloride channel core  28.62 
 
 		 464 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3914  Chloride channel core  28.62 
 
 		 464 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3746  Cl- channel, voltage-gated family protein  25.71 
 
 		 414 aa  82  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.556146 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  26.38 
 
 		 875 aa  81.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6206  Chloride channel core  26.74 
 
 		 504 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5286  Chloride channel core  24.35 
 
 		 431 aa  80.5  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1400  chloride channel, putative  27.71 
 
 		 631 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  26.71 
 
 		 608 aa  79  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3504  chloride channel family protein  24.55 
 
 		 602 aa  79  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0357  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.34 
 
 		 588 aa  79  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  26.71 
 
 		 598 aa  77.8  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  24.86 
 
 		 470 aa  78.2  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  25.51 
 
 		 473 aa  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4507  Cl- channel, voltage-gated family protein  24.86 
 
 		 594 aa  77.8  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  25.51 
 
 		 473 aa  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  25.51 
 
 		 473 aa  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0552  Chloride channel core  23.39 
 
 		 614 aa  77.8  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  25 
 
 		 519 aa  76.6  0.0000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  25.25 
 
 		 473 aa  76.6  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  25.51 
 
 		 473 aa  76.3  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  25 
 
 		 519 aa  76.3  0.0000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1071  hypothetical protein  24.41 
 
 		 457 aa  76.3  0.0000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1823  putative chloride channel  28.92 
 
 		 593 aa  74.7  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.039576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1543  Cl- channel, voltage-gated family protein  25.34 
 
 		 582 aa  75.1  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.445538 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0695  chloride channel protein  27.01 
 
 		 466 aa  74.7  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.750689  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4701  Chloride channel core  28.39 
 
 		 471 aa  74.7  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.10029 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2859  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.68 
 
 		 606 aa  74.3  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132128  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  25.96 
 
 		 859 aa  73.9  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1241  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.24 
 
 		 428 aa  73.9  0.000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.730218 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2188  Chloride channel core  25.16 
 
 		 563 aa  72.4  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000751746  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1130  Chloride channel core  22.54 
 
 		 617 aa  72  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.711755  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1327  chloride channel core  24.35 
 
 		 579 aa  72  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.775399  normal  0.325244 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  25.62 
 
 		 626 aa  71.6  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2049  Chloride channel core  26.27 
 
 		 596 aa  71.6  0.00000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.993111  normal  0.527331 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  27.27 
 
 		 897 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2950  Cl- channel, voltage gated  23.29 
 
 		 613 aa  70.5  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.952562  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>